Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M7E0

Protein Details
Accession A0A1C7M7E0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MATTARQTKPPRKAIPEPPVRRAPAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MATTARQTKPPRKAIPEPPVRRAPAWTGARASPTFSPATPNVRVPNGSQPASAGAFPPLAQTNGVRSTDNSHERILQQLSGLTGTTVTVSTKTNQRYEGVVASTGTEGDTTGVTLKDVRDISIPGAPIRDQVFIAATNIDQWSSGPADAKAPNGDSFKTDTDISQGQRRERELQAWQPTVDENGTATVTVAATRHVDEVTFGPGASGANGFDEDAYTTKLDRNAPDFKERERKALQLANEIMGSSTTNVHIAEERVMNLANDNSTNEEDKYGAVVRGANAYVPPGARKTNATTSSPVKPDLPKVSINAPDGSSVPAPQTSTPTPPKAASPAPSSSSAANRPAADPIPAFRDFVSTEKDRLMKKKQALMKNEMDKRKAELLKFSQSFKLNKPIPEDLVPILAKDAEKQRQIKEKSSKDAQSSHARAIGVATTTVLAPATAVRPSAPPTSKAAPETTRQSVAKTSAGAPMAKTATAPAKPGAEPGSKRITMFIQPIPPFKGKRSSTTGTAGAPPSVSGPARQVSSIASPLSPAAANRLNVNASSFRPTATKSSSFSPGGSPNPNSTSSSSASPKNKSAESVSPQGPPNPFFGTRLIKKGPPVHIKDDFNPFKYHKVAEASAVSAIWPYSGKRYMQMFPQLPTQPQQQSPHMAPPVPPPPMPPPSYEEDSAAQAAARGYVYAYPPYGYPGQPMMPGMPPPPGAYIPGPYMQPMPYPMPPPNGIISPQNFQVKYLTSFAISAMYPSTPMGQMPRELRTLITASIHASSPSAWHVSSPSKWCRSPAIHPPTPIPAHAHPYYHQSPQRMLSYQLVPFGQPMTDAHPTVQHAVPYPMMMPPPGQGVPPHPYEAAQAPPVPMGGVGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.85
3 0.86
4 0.83
5 0.81
6 0.81
7 0.76
8 0.68
9 0.62
10 0.57
11 0.56
12 0.53
13 0.5
14 0.45
15 0.43
16 0.48
17 0.43
18 0.42
19 0.33
20 0.32
21 0.3
22 0.26
23 0.3
24 0.29
25 0.35
26 0.35
27 0.39
28 0.4
29 0.41
30 0.43
31 0.4
32 0.45
33 0.45
34 0.43
35 0.37
36 0.34
37 0.33
38 0.33
39 0.3
40 0.21
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.2
50 0.25
51 0.26
52 0.24
53 0.23
54 0.28
55 0.36
56 0.41
57 0.38
58 0.35
59 0.37
60 0.37
61 0.42
62 0.38
63 0.3
64 0.24
65 0.23
66 0.22
67 0.18
68 0.17
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.15
78 0.22
79 0.28
80 0.31
81 0.33
82 0.34
83 0.35
84 0.36
85 0.36
86 0.3
87 0.26
88 0.22
89 0.21
90 0.19
91 0.16
92 0.13
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.2
109 0.21
110 0.22
111 0.17
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.12
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.17
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.2
139 0.23
140 0.24
141 0.24
142 0.21
143 0.24
144 0.23
145 0.23
146 0.22
147 0.18
148 0.2
149 0.25
150 0.25
151 0.28
152 0.31
153 0.34
154 0.38
155 0.42
156 0.43
157 0.41
158 0.44
159 0.44
160 0.48
161 0.51
162 0.49
163 0.45
164 0.4
165 0.38
166 0.34
167 0.28
168 0.19
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.21
209 0.25
210 0.31
211 0.34
212 0.42
213 0.41
214 0.44
215 0.52
216 0.5
217 0.52
218 0.47
219 0.47
220 0.44
221 0.47
222 0.42
223 0.39
224 0.38
225 0.32
226 0.29
227 0.26
228 0.2
229 0.16
230 0.14
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.26
277 0.3
278 0.31
279 0.32
280 0.35
281 0.39
282 0.39
283 0.35
284 0.3
285 0.29
286 0.32
287 0.34
288 0.33
289 0.29
290 0.29
291 0.32
292 0.33
293 0.33
294 0.28
295 0.24
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.16
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.1
305 0.14
306 0.14
307 0.2
308 0.24
309 0.26
310 0.27
311 0.27
312 0.27
313 0.27
314 0.28
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.26
319 0.27
320 0.27
321 0.24
322 0.25
323 0.24
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.17
331 0.15
332 0.13
333 0.16
334 0.15
335 0.15
336 0.13
337 0.15
338 0.14
339 0.16
340 0.2
341 0.16
342 0.17
343 0.2
344 0.24
345 0.25
346 0.3
347 0.36
348 0.38
349 0.41
350 0.46
351 0.51
352 0.54
353 0.56
354 0.57
355 0.57
356 0.59
357 0.62
358 0.59
359 0.54
360 0.47
361 0.45
362 0.46
363 0.42
364 0.34
365 0.33
366 0.34
367 0.4
368 0.41
369 0.4
370 0.37
371 0.38
372 0.4
373 0.35
374 0.4
375 0.35
376 0.36
377 0.39
378 0.36
379 0.34
380 0.33
381 0.32
382 0.22
383 0.22
384 0.2
385 0.15
386 0.13
387 0.12
388 0.1
389 0.11
390 0.16
391 0.17
392 0.22
393 0.26
394 0.3
395 0.38
396 0.42
397 0.48
398 0.52
399 0.52
400 0.53
401 0.56
402 0.55
403 0.49
404 0.49
405 0.45
406 0.45
407 0.42
408 0.37
409 0.33
410 0.29
411 0.26
412 0.23
413 0.19
414 0.1
415 0.08
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.09
430 0.15
431 0.15
432 0.16
433 0.2
434 0.23
435 0.24
436 0.24
437 0.25
438 0.22
439 0.24
440 0.27
441 0.25
442 0.26
443 0.25
444 0.25
445 0.23
446 0.23
447 0.21
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.16
452 0.16
453 0.14
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.09
459 0.12
460 0.12
461 0.13
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.15
466 0.17
467 0.18
468 0.18
469 0.21
470 0.26
471 0.25
472 0.25
473 0.24
474 0.23
475 0.21
476 0.24
477 0.23
478 0.24
479 0.25
480 0.27
481 0.3
482 0.31
483 0.3
484 0.28
485 0.35
486 0.3
487 0.34
488 0.39
489 0.38
490 0.38
491 0.4
492 0.39
493 0.31
494 0.32
495 0.27
496 0.2
497 0.17
498 0.13
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.08
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.07
518 0.1
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.15
523 0.15
524 0.14
525 0.16
526 0.14
527 0.12
528 0.17
529 0.16
530 0.16
531 0.17
532 0.18
533 0.21
534 0.23
535 0.25
536 0.22
537 0.25
538 0.29
539 0.29
540 0.28
541 0.27
542 0.25
543 0.27
544 0.29
545 0.27
546 0.25
547 0.27
548 0.28
549 0.27
550 0.25
551 0.25
552 0.22
553 0.25
554 0.25
555 0.29
556 0.33
557 0.34
558 0.37
559 0.37
560 0.36
561 0.34
562 0.35
563 0.35
564 0.34
565 0.37
566 0.34
567 0.35
568 0.35
569 0.37
570 0.35
571 0.29
572 0.28
573 0.26
574 0.25
575 0.23
576 0.27
577 0.3
578 0.31
579 0.36
580 0.36
581 0.34
582 0.39
583 0.44
584 0.48
585 0.49
586 0.51
587 0.52
588 0.55
589 0.56
590 0.55
591 0.59
592 0.53
593 0.47
594 0.46
595 0.41
596 0.39
597 0.38
598 0.35
599 0.29
600 0.29
601 0.27
602 0.26
603 0.26
604 0.22
605 0.2
606 0.19
607 0.15
608 0.1
609 0.09
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.11
614 0.15
615 0.16
616 0.2
617 0.24
618 0.26
619 0.31
620 0.39
621 0.36
622 0.35
623 0.42
624 0.39
625 0.37
626 0.38
627 0.39
628 0.35
629 0.38
630 0.41
631 0.37
632 0.4
633 0.41
634 0.45
635 0.4
636 0.37
637 0.33
638 0.35
639 0.38
640 0.35
641 0.33
642 0.3
643 0.35
644 0.39
645 0.4
646 0.35
647 0.33
648 0.36
649 0.4
650 0.37
651 0.33
652 0.28
653 0.29
654 0.26
655 0.22
656 0.15
657 0.12
658 0.11
659 0.1
660 0.08
661 0.06
662 0.06
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.12
667 0.11
668 0.11
669 0.15
670 0.17
671 0.15
672 0.16
673 0.18
674 0.18
675 0.19
676 0.19
677 0.18
678 0.17
679 0.18
680 0.17
681 0.17
682 0.16
683 0.17
684 0.19
685 0.17
686 0.18
687 0.17
688 0.19
689 0.19
690 0.2
691 0.19
692 0.18
693 0.19
694 0.17
695 0.17
696 0.18
697 0.2
698 0.21
699 0.25
700 0.27
701 0.31
702 0.31
703 0.32
704 0.31
705 0.29
706 0.27
707 0.3
708 0.29
709 0.27
710 0.31
711 0.35
712 0.33
713 0.32
714 0.33
715 0.3
716 0.3
717 0.3
718 0.25
719 0.19
720 0.2
721 0.19
722 0.18
723 0.15
724 0.12
725 0.11
726 0.1
727 0.1
728 0.1
729 0.12
730 0.1
731 0.11
732 0.14
733 0.15
734 0.21
735 0.24
736 0.27
737 0.27
738 0.27
739 0.26
740 0.26
741 0.26
742 0.22
743 0.2
744 0.17
745 0.17
746 0.18
747 0.18
748 0.15
749 0.13
750 0.12
751 0.12
752 0.14
753 0.14
754 0.13
755 0.13
756 0.17
757 0.22
758 0.28
759 0.35
760 0.41
761 0.46
762 0.47
763 0.5
764 0.54
765 0.54
766 0.56
767 0.59
768 0.6
769 0.58
770 0.59
771 0.59
772 0.59
773 0.55
774 0.48
775 0.44
776 0.38
777 0.4
778 0.4
779 0.4
780 0.33
781 0.4
782 0.42
783 0.45
784 0.46
785 0.42
786 0.44
787 0.47
788 0.51
789 0.45
790 0.44
791 0.41
792 0.42
793 0.4
794 0.39
795 0.34
796 0.29
797 0.28
798 0.25
799 0.19
800 0.15
801 0.14
802 0.17
803 0.2
804 0.21
805 0.21
806 0.24
807 0.26
808 0.29
809 0.3
810 0.26
811 0.24
812 0.26
813 0.26
814 0.23
815 0.21
816 0.19
817 0.19
818 0.18
819 0.16
820 0.14
821 0.19
822 0.19
823 0.19
824 0.19
825 0.23
826 0.27
827 0.3
828 0.32
829 0.27
830 0.27
831 0.29
832 0.3
833 0.29
834 0.28
835 0.27
836 0.25
837 0.25
838 0.24
839 0.2
840 0.17