Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YMR1

Protein Details
Accession C7YMR1    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-150QKVPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRSRAQKEMNEDNTPKVEARRRKPRTTRGRIRAETARHydrophilic
183-217VGRAPRPKIRRNELNEPPKPMAKFRKRQLNKTWLPHydrophilic
608-628LEERRKRKAAWERRPKSKRVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-168KVPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRSRAQKEMNEDNTPKVEARRRKPRTTRGRIRAETARRLGILAARKRRAALEKAK
185-209RAPRPKIRRNELNEPPKPMAKFRKR
611-626RRKRKAAWERRPKSKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG nhe:NECHADRAFT_92057  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MAPGSATAGSSGQGAKKRKADAPAPNARSDNFAQKRSKVHIARNIPAQPADAALKDGELDLQAFVAAHEFEIRSLEQSIATSKAVGSSRAFQKVPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRSRAQKEMNEDNTPKVEARRRKPRTTRGRIRAETARRLGILAARKRRAALEKAKENGQDETPGSELAVVGRAPRPKIRRNELNEPPKPMAKFRKRQLNKTWLPTHAWHAKRARMTDPLNPLWRFAIPLTPNEKICRPTHRAQGDRGAVVWEMSYMSTIGLYGNSVGIERVLKRVGVVQDSCWNEKGRKWRLGTRSWTGILSRKTNTGRQVIGPGTILWNPESSTQAEVQEPQKKQRQVFLRIHPSAFLELFNELLQLIKQENPRLYIEDLRFEIGSIDLTGPGSTEALLSVLTPYPSKDKAKDQHAELFRGLAGLSNAATLPAGSILSFPVQDPRLRYPPRRLEVSDDADAQLQLLEKIAAWPAEEDLLPYAIFDRDARHRASQLPSQKNVDRRKTKKTPGSLLKPTAVDPPIPVTLLASRTGTSTQTQGTWTLLAPWKCIQPIWYSLVHYPLSSGGNPRFAGMDEIRQIAFERGQPWFPGDFPGTAAGAEWELEERRKRKAAWERRPKSKRVAWESLDLGGGRKGEIGDGFASNFELLFKSTKTRCSSNNQGEDPMDIDQDESTQKPAQQKSSGIHGLQQISKDAFKQLLEIPQPTTIPTNALVTVRITLLSRGVVTPCARIYRLPPPPTIIPPSSEAEVPATIPPKSASHSSLPRDIRSQWLARVPSSTTPKSKASKSSKPRDLDSLKRVLARELISKPTPYSSEPANQSDMNGHPLVPNTEDLIGFVTTGSFSLSEGHGMAIGSIAAEKGAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.42
4 0.47
5 0.51
6 0.56
7 0.6
8 0.63
9 0.67
10 0.71
11 0.69
12 0.68
13 0.65
14 0.57
15 0.54
16 0.47
17 0.48
18 0.44
19 0.47
20 0.48
21 0.51
22 0.57
23 0.59
24 0.66
25 0.62
26 0.65
27 0.67
28 0.69
29 0.7
30 0.72
31 0.69
32 0.62
33 0.56
34 0.48
35 0.38
36 0.33
37 0.29
38 0.21
39 0.18
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.18
71 0.18
72 0.2
73 0.2
74 0.25
75 0.32
76 0.37
77 0.38
78 0.35
79 0.43
80 0.49
81 0.56
82 0.59
83 0.61
84 0.61
85 0.7
86 0.75
87 0.72
88 0.72
89 0.74
90 0.75
91 0.77
92 0.82
93 0.8
94 0.82
95 0.86
96 0.86
97 0.85
98 0.84
99 0.85
100 0.84
101 0.87
102 0.89
103 0.88
104 0.89
105 0.88
106 0.85
107 0.81
108 0.81
109 0.76
110 0.73
111 0.65
112 0.58
113 0.5
114 0.45
115 0.4
116 0.37
117 0.4
118 0.42
119 0.51
120 0.59
121 0.65
122 0.74
123 0.83
124 0.86
125 0.88
126 0.9
127 0.91
128 0.89
129 0.92
130 0.84
131 0.8
132 0.79
133 0.76
134 0.73
135 0.66
136 0.58
137 0.48
138 0.45
139 0.4
140 0.35
141 0.36
142 0.36
143 0.41
144 0.42
145 0.43
146 0.44
147 0.48
148 0.5
149 0.5
150 0.51
151 0.52
152 0.57
153 0.59
154 0.62
155 0.6
156 0.56
157 0.49
158 0.4
159 0.34
160 0.27
161 0.26
162 0.22
163 0.19
164 0.16
165 0.13
166 0.12
167 0.09
168 0.1
169 0.07
170 0.09
171 0.13
172 0.16
173 0.19
174 0.27
175 0.34
176 0.4
177 0.5
178 0.57
179 0.63
180 0.68
181 0.75
182 0.78
183 0.82
184 0.78
185 0.74
186 0.68
187 0.63
188 0.56
189 0.54
190 0.55
191 0.55
192 0.6
193 0.62
194 0.7
195 0.72
196 0.79
197 0.82
198 0.81
199 0.78
200 0.78
201 0.76
202 0.67
203 0.65
204 0.58
205 0.56
206 0.54
207 0.49
208 0.47
209 0.47
210 0.49
211 0.49
212 0.5
213 0.46
214 0.45
215 0.46
216 0.45
217 0.48
218 0.48
219 0.51
220 0.47
221 0.45
222 0.38
223 0.35
224 0.3
225 0.23
226 0.25
227 0.19
228 0.24
229 0.29
230 0.3
231 0.32
232 0.33
233 0.35
234 0.32
235 0.34
236 0.37
237 0.39
238 0.42
239 0.49
240 0.55
241 0.56
242 0.55
243 0.6
244 0.55
245 0.48
246 0.42
247 0.34
248 0.25
249 0.22
250 0.18
251 0.09
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.15
275 0.16
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.24
280 0.27
281 0.29
282 0.27
283 0.27
284 0.24
285 0.27
286 0.36
287 0.37
288 0.42
289 0.44
290 0.5
291 0.54
292 0.61
293 0.63
294 0.58
295 0.55
296 0.48
297 0.45
298 0.39
299 0.39
300 0.35
301 0.32
302 0.29
303 0.3
304 0.32
305 0.36
306 0.39
307 0.36
308 0.34
309 0.31
310 0.34
311 0.28
312 0.26
313 0.22
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.2
330 0.26
331 0.26
332 0.31
333 0.37
334 0.41
335 0.41
336 0.45
337 0.48
338 0.49
339 0.55
340 0.58
341 0.6
342 0.57
343 0.56
344 0.5
345 0.43
346 0.36
347 0.28
348 0.2
349 0.11
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.09
360 0.11
361 0.15
362 0.16
363 0.19
364 0.2
365 0.21
366 0.22
367 0.24
368 0.23
369 0.22
370 0.22
371 0.2
372 0.19
373 0.16
374 0.15
375 0.09
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.09
397 0.13
398 0.16
399 0.18
400 0.26
401 0.31
402 0.39
403 0.42
404 0.41
405 0.45
406 0.45
407 0.45
408 0.37
409 0.31
410 0.23
411 0.19
412 0.17
413 0.09
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.14
435 0.18
436 0.27
437 0.31
438 0.35
439 0.41
440 0.49
441 0.51
442 0.52
443 0.48
444 0.46
445 0.48
446 0.49
447 0.4
448 0.32
449 0.29
450 0.25
451 0.24
452 0.17
453 0.11
454 0.07
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.08
477 0.13
478 0.16
479 0.19
480 0.2
481 0.21
482 0.25
483 0.29
484 0.32
485 0.37
486 0.4
487 0.4
488 0.44
489 0.46
490 0.5
491 0.55
492 0.58
493 0.59
494 0.59
495 0.66
496 0.7
497 0.76
498 0.75
499 0.73
500 0.73
501 0.72
502 0.75
503 0.71
504 0.65
505 0.58
506 0.51
507 0.45
508 0.4
509 0.32
510 0.24
511 0.18
512 0.18
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.1
517 0.11
518 0.12
519 0.12
520 0.1
521 0.1
522 0.11
523 0.12
524 0.12
525 0.11
526 0.12
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.13
535 0.17
536 0.17
537 0.18
538 0.19
539 0.2
540 0.2
541 0.2
542 0.17
543 0.15
544 0.19
545 0.2
546 0.2
547 0.2
548 0.21
549 0.24
550 0.23
551 0.2
552 0.17
553 0.15
554 0.15
555 0.14
556 0.18
557 0.15
558 0.19
559 0.19
560 0.19
561 0.17
562 0.16
563 0.2
564 0.16
565 0.18
566 0.16
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.17
571 0.14
572 0.15
573 0.13
574 0.14
575 0.14
576 0.16
577 0.16
578 0.17
579 0.17
580 0.16
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.14
585 0.15
586 0.12
587 0.11
588 0.11
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.11
596 0.18
597 0.19
598 0.25
599 0.29
600 0.3
601 0.38
602 0.48
603 0.56
604 0.6
605 0.7
606 0.73
607 0.8
608 0.86
609 0.8
610 0.79
611 0.73
612 0.72
613 0.69
614 0.7
615 0.61
616 0.6
617 0.56
618 0.48
619 0.44
620 0.34
621 0.25
622 0.19
623 0.16
624 0.11
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.06
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.16
643 0.19
644 0.26
645 0.3
646 0.34
647 0.37
648 0.44
649 0.54
650 0.57
651 0.63
652 0.57
653 0.56
654 0.52
655 0.48
656 0.41
657 0.31
658 0.21
659 0.13
660 0.12
661 0.09
662 0.1
663 0.11
664 0.1
665 0.12
666 0.14
667 0.17
668 0.25
669 0.29
670 0.33
671 0.35
672 0.39
673 0.38
674 0.44
675 0.45
676 0.38
677 0.37
678 0.36
679 0.36
680 0.34
681 0.33
682 0.27
683 0.25
684 0.25
685 0.22
686 0.2
687 0.18
688 0.16
689 0.18
690 0.18
691 0.24
692 0.26
693 0.27
694 0.26
695 0.27
696 0.27
697 0.25
698 0.25
699 0.18
700 0.17
701 0.16
702 0.16
703 0.16
704 0.16
705 0.16
706 0.14
707 0.15
708 0.13
709 0.13
710 0.11
711 0.1
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.12
717 0.16
718 0.16
719 0.19
720 0.2
721 0.22
722 0.22
723 0.23
724 0.27
725 0.32
726 0.41
727 0.42
728 0.41
729 0.44
730 0.47
731 0.51
732 0.52
733 0.43
734 0.37
735 0.36
736 0.37
737 0.33
738 0.29
739 0.25
740 0.21
741 0.2
742 0.18
743 0.18
744 0.18
745 0.16
746 0.17
747 0.18
748 0.17
749 0.2
750 0.23
751 0.24
752 0.29
753 0.37
754 0.41
755 0.48
756 0.5
757 0.49
758 0.49
759 0.47
760 0.46
761 0.45
762 0.44
763 0.4
764 0.44
765 0.43
766 0.4
767 0.41
768 0.37
769 0.38
770 0.43
771 0.44
772 0.42
773 0.44
774 0.51
775 0.54
776 0.57
777 0.6
778 0.61
779 0.65
780 0.7
781 0.77
782 0.78
783 0.77
784 0.75
785 0.75
786 0.73
787 0.72
788 0.69
789 0.66
790 0.61
791 0.6
792 0.57
793 0.49
794 0.46
795 0.4
796 0.4
797 0.35
798 0.39
799 0.38
800 0.39
801 0.38
802 0.37
803 0.37
804 0.32
805 0.32
806 0.3
807 0.35
808 0.39
809 0.41
810 0.41
811 0.38
812 0.36
813 0.38
814 0.34
815 0.31
816 0.27
817 0.23
818 0.21
819 0.23
820 0.25
821 0.22
822 0.21
823 0.18
824 0.19
825 0.19
826 0.17
827 0.17
828 0.15
829 0.13
830 0.11
831 0.09
832 0.08
833 0.08
834 0.09
835 0.06
836 0.07
837 0.09
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.11
842 0.11
843 0.11
844 0.1
845 0.08
846 0.07
847 0.06
848 0.06
849 0.06
850 0.04