Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1C7LSN0

Protein Details
Accession A0A1C7LSN0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-387TSTMLRSRRLQHLQRNPHRRSRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-306GKRR
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 8, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039997  TFE  
IPR002853  TFIIE_asu  
IPR021600  TFIIE_asu_C  
IPR024550  TFIIEa/SarR/Rpc3_HTH_dom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF11521  TFIIE-A_C  
PF02002  TFIIE_alpha  
Amino Acid Sequences MTAMSRVTRRHHLLLCDFGLSLGELHTGATGSAAQPLACGLCGLDVIADQGRAGDAPSASAACLAGILRAKIHHRHGPARRHPVLKDDDLAGRALQLKELNKIMAVLEGDRLVRIHRQNELKEGAQRSVGRQYFYIDYQHFCNVVKWRVAEMRNKIDTGLRRELDTKGYICPQCHKSFSPLEADKLIDFVAGTFNCDVCRAELVDNENSENVIGSKDRMQRFNWQMRFIREGLRKTEDMVLPAFDVAVWIKMHIIDAERAKAAAQNGGLKIAGSSGDGKQEDTIGVVLSVDKDEETRRRNATGKRRRSASRTFALVALEEYDYGRADCAWGQLGVVASHETLVHTIEEDVKPGWCKRRNRLITTSTMLRSRRLQHLQRNPHRRSRSSEDVGGSGTPKMPRTNGFTDSFSMEVRDEVTIVTNEDVGEAGLVANGEPVDDPIVYVNGEPIPFSQVTEEHQELMTPEEYTAYFEVFSARS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.55
3 0.47
4 0.4
5 0.32
6 0.28
7 0.2
8 0.16
9 0.09
10 0.09
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.1
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.05
32 0.05
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.06
50 0.07
51 0.06
52 0.08
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.15
57 0.2
58 0.26
59 0.33
60 0.37
61 0.41
62 0.51
63 0.59
64 0.66
65 0.71
66 0.75
67 0.76
68 0.74
69 0.68
70 0.67
71 0.65
72 0.57
73 0.5
74 0.42
75 0.38
76 0.33
77 0.33
78 0.24
79 0.19
80 0.21
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.23
86 0.25
87 0.23
88 0.18
89 0.19
90 0.17
91 0.15
92 0.14
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.16
101 0.2
102 0.22
103 0.28
104 0.35
105 0.37
106 0.43
107 0.45
108 0.41
109 0.42
110 0.42
111 0.36
112 0.34
113 0.33
114 0.3
115 0.35
116 0.34
117 0.29
118 0.27
119 0.29
120 0.27
121 0.27
122 0.3
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.25
127 0.22
128 0.2
129 0.23
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.26
134 0.27
135 0.33
136 0.37
137 0.4
138 0.41
139 0.45
140 0.44
141 0.44
142 0.41
143 0.39
144 0.4
145 0.4
146 0.41
147 0.33
148 0.32
149 0.34
150 0.35
151 0.34
152 0.31
153 0.25
154 0.19
155 0.26
156 0.26
157 0.26
158 0.31
159 0.33
160 0.34
161 0.36
162 0.35
163 0.34
164 0.35
165 0.36
166 0.38
167 0.33
168 0.31
169 0.29
170 0.28
171 0.23
172 0.2
173 0.18
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.12
203 0.19
204 0.22
205 0.24
206 0.26
207 0.34
208 0.42
209 0.5
210 0.46
211 0.46
212 0.46
213 0.46
214 0.48
215 0.4
216 0.41
217 0.36
218 0.36
219 0.34
220 0.34
221 0.32
222 0.3
223 0.34
224 0.26
225 0.22
226 0.2
227 0.16
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.05
261 0.07
262 0.07
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.09
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.09
281 0.15
282 0.18
283 0.23
284 0.25
285 0.29
286 0.36
287 0.43
288 0.51
289 0.56
290 0.62
291 0.63
292 0.68
293 0.69
294 0.69
295 0.69
296 0.65
297 0.6
298 0.53
299 0.48
300 0.43
301 0.39
302 0.32
303 0.24
304 0.17
305 0.12
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.17
339 0.21
340 0.3
341 0.33
342 0.41
343 0.49
344 0.6
345 0.67
346 0.71
347 0.75
348 0.7
349 0.68
350 0.66
351 0.62
352 0.54
353 0.51
354 0.45
355 0.4
356 0.42
357 0.41
358 0.45
359 0.49
360 0.55
361 0.59
362 0.69
363 0.76
364 0.81
365 0.86
366 0.83
367 0.83
368 0.83
369 0.77
370 0.75
371 0.73
372 0.72
373 0.67
374 0.66
375 0.58
376 0.51
377 0.48
378 0.4
379 0.32
380 0.23
381 0.21
382 0.18
383 0.18
384 0.2
385 0.22
386 0.24
387 0.31
388 0.35
389 0.37
390 0.38
391 0.37
392 0.37
393 0.36
394 0.34
395 0.26
396 0.23
397 0.18
398 0.15
399 0.14
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.07
412 0.07
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.08
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.16
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.19
441 0.26
442 0.26
443 0.23
444 0.23
445 0.23
446 0.21
447 0.24
448 0.22
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.17
454 0.17
455 0.14
456 0.13
457 0.12