FuNGI

A0A1B9GCK6

Protein Details

Accession

A0A1B9GCK6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-147	MELMRKRKETREGKKPENVG	Basic
246-272	ASTRLPSSSYKPKPKFKPHTHPDDPSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
134-135	RK
211-224	RRRAEARAGKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 12, cysk 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLKDIVERPSKAPSTPSAPAPGGVGFPIAVHRSQRPSAFAKSRQQQAARQAGVGSKAVGEGRAVDIIPSIGISPRQDEGPSAQGQLSEMEEVRRSVEAENTKRVEGMSNAEREEEVEELKERFGSGLMELMRKRKETREGKKPENVGDMMGDINESGPSSRPFDMTDAQKILDEVSEENRRKVESMDNLEREQEVEELQERFGGKLIEALRRRAEARAGKGKGKEEVGQAQSIPSMSRSSGPTPSASTRLPSSSYKPKPKFKPHTHPDDPSLSELKAYFPSVPAESSKLAWLQPLSPSSTSSTNSPRFDLSGNILSSSEQNELPSHLGLHHHGSSPDLAGYTIQEILYLCRSTVPSQKITMMGILAKCLSKLRNGEYSEEARKELEAEECTKKAIELGVEILAGLSRGIGVIESGIDLLFMALDSSSWTWFSEEIDWPARFTVDEGVLAIPFEDVLPRMKELLAIEDGLSSITIWQLLQILRRATYISKDLCETICSIVPSVIKVQVISKPWPPSSSTNKAGQVYPSIEGLKLLKEIVTSSRECAEDLVKVNQQMFEGILKFVVTATWENDGSDPDSVYASYSHGLAIEVLEIFMVLGKYGLSSNTLASSAELWYTLGKWVNKTSSGQYLSQEEIRLVEGYFGLMEVWITCAIDPHRTTPEHDLTWAQVNAMNYQDEAVSVIQTSKEPAIIASALDMLCAWSKGVKVNGVKGGEEEKGSLLSSLSETSLEELVVGSSEKAERVTVEDRLVAAAVQLHRLLLPSGQLLSSGTIEKIRSLLFDSPAPSTRHITHARYELLLVSLPNPISQEWISQAFDLFQHFQIGDEPLALDLLDVILKSDLSTLLPEIKELNHPDGIQILRPLLQYAILPNVESVIAPSQPTHQYLKATSTLRPPAVVESKEKPALPGLSLGEDWFFSPLNELLRSGTSEALQQIPQDWSATEVQITQATLLLAKLRYHNGVRGLDRARLIFGLMKVHMLEHGQTSSNAVGEVEVFRDGTVGGLMRDLMGLVLVHQSTSQDQEEEIHGKGQDMSGELERISIPFLGSGVPFFQFYQDFLGLYESISFSDPLFTQLFMPVLSMNYSRDYRRLLWVEHHPLLKNIRTPLNHVPLLSGTGMEVYYNPLEGDQEILTSYARALISEVITKERNEFMWSIAIHHLAGLFWLGTEVEKDSKRVGLLIMILANGSDRVVGSLLGWDLDRRVEGVKEEEKGRRREVLRDLSGDRGMRRIEGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.41
3	0.43
4	0.4
5	0.39
6	0.37
7	0.35
8	0.3
9	0.23
10	0.2
11	0.16
12	0.1
13	0.1
14	0.13
15	0.14
16	0.15
17	0.18
18	0.24
19	0.29
20	0.35
21	0.37
22	0.39
23	0.42
24	0.49
25	0.55
26	0.57
27	0.61
28	0.64
29	0.7
30	0.73
31	0.72
32	0.69
33	0.7
34	0.72
35	0.63
36	0.56
37	0.49
38	0.43
39	0.41
40	0.35
41	0.26
42	0.16
43	0.17
44	0.16
45	0.15
46	0.12
47	0.11
48	0.12
49	0.13
50	0.13
51	0.11
52	0.11
53	0.11
54	0.1
55	0.09
56	0.08
57	0.08
58	0.11
59	0.12
60	0.15
61	0.16
62	0.18
63	0.18
64	0.19
65	0.21
66	0.25
67	0.25
68	0.24
69	0.23
70	0.22
71	0.22
72	0.21
73	0.19
74	0.15
75	0.14
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.17
80	0.17
81	0.16
82	0.15
83	0.22
84	0.29
85	0.33
86	0.41
87	0.42
88	0.42
89	0.41
90	0.4
91	0.36
92	0.28
93	0.3
94	0.28
95	0.29
96	0.3
97	0.3
98	0.29
99	0.27
100	0.26
101	0.2
102	0.15
103	0.13
104	0.15
105	0.15
106	0.16
107	0.15
108	0.14
109	0.13
110	0.12
111	0.11
112	0.09
113	0.14
114	0.15
115	0.2
116	0.22
117	0.29
118	0.32
119	0.35
120	0.38
121	0.41
122	0.49
123	0.55
124	0.63
125	0.67
126	0.72
127	0.77
128	0.81
129	0.79
130	0.73
131	0.69
132	0.59
133	0.49
134	0.4
135	0.33
136	0.25
137	0.2
138	0.14
139	0.08
140	0.08
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.09
145	0.11
146	0.15
147	0.17
148	0.17
149	0.19
150	0.23
151	0.28
152	0.3
153	0.34
154	0.32
155	0.31
156	0.31
157	0.29
158	0.25
159	0.2
160	0.16
161	0.12
162	0.17
163	0.26
164	0.27
165	0.29
166	0.3
167	0.31
168	0.3
169	0.31
170	0.32
171	0.32
172	0.39
173	0.46
174	0.48
175	0.48
176	0.48
177	0.46
178	0.38
179	0.31
180	0.22
181	0.13
182	0.12
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.16
187	0.15
188	0.15
189	0.16
190	0.14
191	0.11
192	0.15
193	0.19
194	0.25
195	0.27
196	0.31
197	0.32
198	0.34
199	0.36
200	0.33
201	0.38
202	0.36
203	0.42
204	0.48
205	0.49
206	0.52
207	0.55
208	0.56
209	0.51
210	0.47
211	0.43
212	0.37
213	0.41
214	0.38
215	0.35
216	0.32
217	0.28
218	0.26
219	0.22
220	0.18
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.13
225	0.17
226	0.19
227	0.23
228	0.24
229	0.25
230	0.27
231	0.3
232	0.31
233	0.28
234	0.27
235	0.25
236	0.26
237	0.28
238	0.27
239	0.31
240	0.37
241	0.46
242	0.55
243	0.61
244	0.68
245	0.75
246	0.83
247	0.87
248	0.87
249	0.89
250	0.87
251	0.89
252	0.86
253	0.81
254	0.75
255	0.7
256	0.61
257	0.54
258	0.47
259	0.36
260	0.3
261	0.26
262	0.22
263	0.19
264	0.18
265	0.15
266	0.13
267	0.16
268	0.16
269	0.17
270	0.16
271	0.17
272	0.17
273	0.17
274	0.18
275	0.17
276	0.16
277	0.17
278	0.16
279	0.15
280	0.17
281	0.18
282	0.2
283	0.19
284	0.2
285	0.21
286	0.23
287	0.23
288	0.24
289	0.3
290	0.34
291	0.35
292	0.35
293	0.33
294	0.31
295	0.31
296	0.29
297	0.25
298	0.24
299	0.22
300	0.22
301	0.21
302	0.2
303	0.2
304	0.2
305	0.17
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.14
310	0.15
311	0.14
312	0.12
313	0.11
314	0.13
315	0.13
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.17
320	0.18
321	0.17
322	0.16
323	0.15
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.12
335	0.11
336	0.1
337	0.11
338	0.13
339	0.16
340	0.23
341	0.26
342	0.26
343	0.27
344	0.29
345	0.28
346	0.27
347	0.24
348	0.18
349	0.16
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.18
359	0.22
360	0.28
361	0.3
362	0.33
363	0.35
364	0.39
365	0.4
366	0.37
367	0.34
368	0.27
369	0.25
370	0.23
371	0.2
372	0.18
373	0.14
374	0.18
375	0.21
376	0.21
377	0.22
378	0.2
379	0.19
380	0.16
381	0.15
382	0.11
383	0.08
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.05
391	0.04
392	0.03
393	0.02
394	0.02
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.02
408	0.02
409	0.02
410	0.02
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.09
419	0.11
420	0.12
421	0.15
422	0.2
423	0.2
424	0.19
425	0.19
426	0.18
427	0.15
428	0.14
429	0.13
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.13
450	0.11
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.08
456	0.07
457	0.05
458	0.04
459	0.03
460	0.04
461	0.03
462	0.04
463	0.06
464	0.07
465	0.1
466	0.13
467	0.14
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.14
472	0.16
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.17
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.16
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.12
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.12
490	0.1
491	0.1
492	0.12
493	0.14
494	0.17
495	0.19
496	0.22
497	0.24
498	0.25
499	0.26
500	0.28
501	0.3
502	0.36
503	0.4
504	0.4
505	0.4
506	0.43
507	0.43
508	0.41
509	0.35
510	0.3
511	0.24
512	0.21
513	0.18
514	0.14
515	0.13
516	0.13
517	0.12
518	0.1
519	0.09
520	0.08
521	0.07
522	0.06
523	0.07
524	0.09
525	0.12
526	0.12
527	0.13
528	0.15
529	0.15
530	0.15
531	0.15
532	0.13
533	0.13
534	0.14
535	0.16
536	0.15
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.15
541	0.13
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.07
554	0.08
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.09
561	0.08
562	0.06
563	0.07
564	0.06
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.06
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.07
604	0.1
605	0.1
606	0.12
607	0.14
608	0.15
609	0.16
610	0.17
611	0.18
612	0.2
613	0.22
614	0.21
615	0.21
616	0.21
617	0.21
618	0.21
619	0.19
620	0.13
621	0.11
622	0.11
623	0.1
624	0.08
625	0.07
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.03
632	0.03
633	0.02
634	0.03
635	0.03
636	0.04
637	0.03
638	0.05
639	0.06
640	0.11
641	0.11
642	0.13
643	0.17
644	0.18
645	0.2
646	0.24
647	0.27
648	0.24
649	0.24
650	0.22
651	0.19
652	0.22
653	0.2
654	0.14
655	0.13
656	0.13
657	0.13
658	0.13
659	0.12
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.06
664	0.07
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.06
671	0.07
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.08
691	0.09
692	0.14
693	0.15
694	0.18
695	0.22
696	0.22
697	0.21
698	0.2
699	0.21
700	0.17
701	0.16
702	0.13
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.08
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.04
723	0.04
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.05
729	0.09
730	0.12
731	0.13
732	0.13
733	0.14
734	0.13
735	0.13
736	0.13
737	0.09
738	0.07
739	0.08
740	0.07
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.09
747	0.06
748	0.07
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.08
756	0.07
757	0.07
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.1
762	0.09
763	0.09
764	0.11
765	0.13
766	0.13
767	0.15
768	0.16
769	0.17
770	0.22
771	0.23
772	0.22
773	0.23
774	0.23
775	0.28
776	0.32
777	0.32
778	0.31
779	0.34
780	0.33
781	0.3
782	0.29
783	0.22
784	0.18
785	0.16
786	0.12
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.09
793	0.11
794	0.11
795	0.12
796	0.12
797	0.14
798	0.14
799	0.14
800	0.14
801	0.11
802	0.12
803	0.13
804	0.13
805	0.11
806	0.11
807	0.11
808	0.11
809	0.12
810	0.13
811	0.11
812	0.09
813	0.08
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.05
818	0.03
819	0.03
820	0.03
821	0.03
822	0.04
823	0.04
824	0.04
825	0.04
826	0.05
827	0.05
828	0.05
829	0.06
830	0.06
831	0.1
832	0.1
833	0.11
834	0.11
835	0.12
836	0.17
837	0.19
838	0.21
839	0.19
840	0.19
841	0.19
842	0.21
843	0.21
844	0.17
845	0.15
846	0.13
847	0.13
848	0.13
849	0.13
850	0.1
851	0.1
852	0.09
853	0.09
854	0.12
855	0.11
856	0.11
857	0.1
858	0.1
859	0.1
860	0.09
861	0.09
862	0.07
863	0.08
864	0.08
865	0.09
866	0.12
867	0.14
868	0.17
869	0.2
870	0.2
871	0.22
872	0.23
873	0.26
874	0.29
875	0.28
876	0.28
877	0.32
878	0.35
879	0.32
880	0.32
881	0.29
882	0.28
883	0.33
884	0.32
885	0.3
886	0.29
887	0.33
888	0.36
889	0.35
890	0.3
891	0.28
892	0.27
893	0.23
894	0.22
895	0.18
896	0.17
897	0.17
898	0.16
899	0.13
900	0.12
901	0.11
902	0.09
903	0.08
904	0.06
905	0.08
906	0.1
907	0.12
908	0.13
909	0.13
910	0.13
911	0.14
912	0.15
913	0.14
914	0.13
915	0.11
916	0.12
917	0.13
918	0.14
919	0.14
920	0.13
921	0.14
922	0.14
923	0.14
924	0.13
925	0.12
926	0.13
927	0.13
928	0.13
929	0.11
930	0.11
931	0.11
932	0.12
933	0.12
934	0.09
935	0.09
936	0.08
937	0.08
938	0.08
939	0.1
940	0.11
941	0.12
942	0.15
943	0.17
944	0.21
945	0.22
946	0.26
947	0.29
948	0.33
949	0.33
950	0.37
951	0.37
952	0.36
953	0.36
954	0.33
955	0.27
956	0.22
957	0.22
958	0.18
959	0.17
960	0.17
961	0.16
962	0.16
963	0.15
964	0.15
965	0.15
966	0.13
967	0.13
968	0.11
969	0.12
970	0.12
971	0.12
972	0.14
973	0.14
974	0.13
975	0.12
976	0.1
977	0.08
978	0.08
979	0.09
980	0.08
981	0.08
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.07
986	0.06
987	0.07
988	0.06
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.06
993	0.06
994	0.06
995	0.04
996	0.04
997	0.04
998	0.04
999	0.07
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.09
1004	0.1
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.14
1010	0.18
1011	0.19
1012	0.18
1013	0.17
1014	0.17
1015	0.17
1016	0.17
1017	0.16
1018	0.13
1019	0.12
1020	0.15
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.13
1024	0.13
1025	0.13
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.1
1029	0.08
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.09
1035	0.09
1036	0.09
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.12
1040	0.12
1041	0.13
1042	0.17
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.15
1046	0.17
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.14
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.11
1053	0.11
1054	0.09
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.14
1060	0.13
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.13
1070	0.17
1071	0.2
1072	0.21
1073	0.24
1074	0.28
1075	0.28
1076	0.36
1077	0.39
1078	0.37
1079	0.41
1080	0.48
1081	0.53
1082	0.53
1083	0.55
1084	0.47
1085	0.47
1086	0.5
1087	0.49
1088	0.44
1089	0.41
1090	0.44
1091	0.41
1092	0.47
1093	0.51
1094	0.53
1095	0.5
1096	0.45
1097	0.41
1098	0.35
1099	0.36
1100	0.29
1101	0.2
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.1
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.11
1113	0.1
1114	0.13
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.11
1123	0.1
1124	0.1
1125	0.11
1126	0.13
1127	0.14
1128	0.18
1129	0.2
1130	0.2
1131	0.23
1132	0.24
1133	0.25
1134	0.26
1135	0.25
1136	0.24
1137	0.24
1138	0.21
1139	0.25
1140	0.24
1141	0.25
1142	0.25
1143	0.25
1144	0.21
1145	0.2
1146	0.18
1147	0.12
1148	0.12
1149	0.1
1150	0.07
1151	0.05
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.08
1156	0.1
1157	0.16
1158	0.17
1159	0.19
1160	0.21
1161	0.23
1162	0.23
1163	0.23
1164	0.21
1165	0.17
1166	0.18
1167	0.18
1168	0.17
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.12
1172	0.12
1173	0.09
1174	0.08
1175	0.06
1176	0.05
1177	0.06
1178	0.07
1179	0.07
1180	0.07
1181	0.09
1182	0.1
1183	0.1
1184	0.1
1185	0.1
1186	0.11
1187	0.12
1188	0.12
1189	0.11
1190	0.13
1191	0.14
1192	0.17
1193	0.23
1194	0.27
1195	0.3
1196	0.36
1197	0.43
1198	0.49
1199	0.54
1200	0.55
1201	0.57
1202	0.55
1203	0.59
1204	0.62
1205	0.64
1206	0.62
1207	0.62
1208	0.59
1209	0.56
1210	0.58
1211	0.53
1212	0.45
1213	0.39
1214	0.35

A0A1B9GCK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer