Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9FW41

Protein Details
Accession A0A1B9FW41    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
423-448IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-439FRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSQKDLDSAVLAYLVKRGFTKTVKALEKESDVKAGEEGKLEAAWNASVVKTDDVEMASSSSSESSSSESESESESDSESESEDEAKKEVKVAAAVPLPKSSSGSSSSSASSSDSDSDSESGSESDSSSSSSSSSSSSSSSSSSSFSASTSTSKSSAKPEPPSALSSVTLKGDSPAPAKSSSSSSSSDSESDSSSSSSSSSDSDSESESEDDSEKSVKKFLDVEASESGSESDSESSDSDSSSSSSSSDSDSESDSEEEEEEEEAKPVIGQKRKAPSASSSSSSSSSSSSSSSSSSSESDSDSESDSESESTPAVTVVTTKKRKLEDGTEAITSTTTTTTPSHHHHHHHPSRAQNFDSPASTPGAGTPTGSGKKQRIQGQRFERIKMDNVTYHHDGLKDNSFAAREAAGANPNDYGARASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITLATHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.18
5 0.23
6 0.27
7 0.34
8 0.36
9 0.45
10 0.51
11 0.53
12 0.54
13 0.52
14 0.55
15 0.52
16 0.47
17 0.43
18 0.36
19 0.34
20 0.32
21 0.3
22 0.25
23 0.22
24 0.21
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.19
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.23
85 0.21
86 0.23
87 0.19
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.23
142 0.29
143 0.34
144 0.37
145 0.38
146 0.4
147 0.41
148 0.41
149 0.36
150 0.31
151 0.25
152 0.22
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.19
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.21
173 0.21
174 0.18
175 0.17
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.21
208 0.19
209 0.22
210 0.2
211 0.21
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.09
216 0.09
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.1
254 0.16
255 0.2
256 0.22
257 0.28
258 0.35
259 0.38
260 0.39
261 0.37
262 0.35
263 0.37
264 0.37
265 0.34
266 0.29
267 0.28
268 0.29
269 0.27
270 0.24
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.07
303 0.13
304 0.23
305 0.28
306 0.3
307 0.36
308 0.38
309 0.42
310 0.44
311 0.45
312 0.44
313 0.44
314 0.44
315 0.4
316 0.38
317 0.34
318 0.29
319 0.22
320 0.14
321 0.1
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.12
326 0.17
327 0.22
328 0.28
329 0.33
330 0.39
331 0.46
332 0.56
333 0.62
334 0.67
335 0.67
336 0.7
337 0.7
338 0.69
339 0.63
340 0.55
341 0.51
342 0.44
343 0.4
344 0.32
345 0.27
346 0.24
347 0.22
348 0.18
349 0.15
350 0.15
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.16
355 0.19
356 0.21
357 0.26
358 0.29
359 0.36
360 0.42
361 0.5
362 0.54
363 0.58
364 0.65
365 0.69
366 0.74
367 0.72
368 0.68
369 0.63
370 0.56
371 0.55
372 0.5
373 0.44
374 0.38
375 0.37
376 0.41
377 0.41
378 0.39
379 0.36
380 0.33
381 0.3
382 0.29
383 0.32
384 0.26
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.21
389 0.21
390 0.17
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.13
403 0.17
404 0.17
405 0.18
406 0.21
407 0.24
408 0.25
409 0.24
410 0.24
411 0.21
412 0.21
413 0.25
414 0.23
415 0.26
416 0.29
417 0.36
418 0.45
419 0.55
420 0.63
421 0.69
422 0.78
423 0.82
424 0.88
425 0.9
426 0.89
427 0.87
428 0.84
429 0.82
430 0.79
431 0.7
432 0.6
433 0.49
434 0.4
435 0.31
436 0.25
437 0.16
438 0.1