Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9GDW2

Protein Details
Accession A0A1B9GDW2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-198SAYRKQLTRFIPKRRVRKEKKLIGSKDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-192RKQLTRFIPKRRVRKEKKL
602-608KETKKNK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MSGRAPAPGPAEPPRQQGNNDKIWGVVRSVAMFFAVQMAMKYGMEYMGMGGNKSPAPPVPVPAETSDGASPPVAAPTSQGSQLATPAWDLGTPLSMLLYTSTSPSGQDVDLDHPLVQWDGLTYGEWKDEREADLILDVPESVWARNGSWYMDVVLVKGGGTPKGKGPGNVSAYRKQLTRFIPKRRVRKEKKLIGSKDEVEEEVEEPIEQSGPPPIVAHWSNNLTLTIVSSGGEVNPGQLSPVAQPFYTVQPSLSDPTKKVYPPPIFPNDFWIMKESLYAINETTKTLPLHVTYHAISAMKFNLFSSMTASFEQAAQQQGGGGMEFDEIKRTLIETSPWLLITTAIVTVLHTLFEFLAFSSDVSHWRKKDKDLVGVSLNTILTNCFVQLVILLYLHDSSEETSFMILFGQGIGLLIEAWKITKVTNIRIRPAPTSIFGYTVQFEDKRELSEDEKRTQEYDALAFRLVSYGAIPLLAGYTVYSCKTHRGWYSFIVTTLAQAIYMFGFVQLIPQLIINYKLKSVAHMPMKAMMYKTLSTVVDDFFAFCIRMPWLHRLACFRDDVVFLILLYQRWIYRVDYSRVNEYGQVNEGMVEDVGKPGEKEKETKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.49
3 0.52
4 0.57
5 0.57
6 0.57
7 0.56
8 0.5
9 0.45
10 0.44
11 0.4
12 0.32
13 0.27
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.18
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.11
35 0.12
36 0.11
37 0.12
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.13
43 0.2
44 0.21
45 0.24
46 0.27
47 0.28
48 0.3
49 0.3
50 0.32
51 0.26
52 0.27
53 0.24
54 0.19
55 0.19
56 0.16
57 0.15
58 0.11
59 0.13
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.16
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.15
101 0.16
102 0.14
103 0.12
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.28
154 0.32
155 0.37
156 0.42
157 0.44
158 0.42
159 0.45
160 0.45
161 0.43
162 0.36
163 0.37
164 0.37
165 0.44
166 0.48
167 0.54
168 0.63
169 0.69
170 0.78
171 0.81
172 0.86
173 0.85
174 0.87
175 0.88
176 0.87
177 0.89
178 0.88
179 0.82
180 0.77
181 0.73
182 0.64
183 0.55
184 0.47
185 0.37
186 0.28
187 0.24
188 0.18
189 0.13
190 0.11
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.2
244 0.23
245 0.22
246 0.24
247 0.31
248 0.32
249 0.34
250 0.4
251 0.44
252 0.43
253 0.43
254 0.45
255 0.39
256 0.36
257 0.32
258 0.27
259 0.21
260 0.18
261 0.18
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.13
349 0.18
350 0.23
351 0.23
352 0.29
353 0.32
354 0.35
355 0.43
356 0.42
357 0.46
358 0.43
359 0.45
360 0.42
361 0.4
362 0.36
363 0.28
364 0.24
365 0.15
366 0.13
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.1
409 0.13
410 0.21
411 0.3
412 0.33
413 0.38
414 0.42
415 0.45
416 0.43
417 0.43
418 0.37
419 0.3
420 0.32
421 0.27
422 0.25
423 0.23
424 0.22
425 0.19
426 0.18
427 0.19
428 0.15
429 0.16
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.22
436 0.31
437 0.34
438 0.35
439 0.37
440 0.37
441 0.35
442 0.34
443 0.31
444 0.24
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.14
452 0.12
453 0.09
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.07
466 0.08
467 0.1
468 0.11
469 0.16
470 0.18
471 0.25
472 0.3
473 0.33
474 0.36
475 0.38
476 0.44
477 0.4
478 0.38
479 0.33
480 0.26
481 0.23
482 0.22
483 0.17
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.2
505 0.2
506 0.22
507 0.25
508 0.29
509 0.33
510 0.34
511 0.35
512 0.37
513 0.39
514 0.38
515 0.35
516 0.3
517 0.26
518 0.24
519 0.24
520 0.23
521 0.21
522 0.21
523 0.22
524 0.19
525 0.17
526 0.17
527 0.16
528 0.13
529 0.13
530 0.11
531 0.1
532 0.11
533 0.11
534 0.15
535 0.18
536 0.24
537 0.3
538 0.33
539 0.36
540 0.41
541 0.45
542 0.44
543 0.42
544 0.37
545 0.32
546 0.3
547 0.29
548 0.24
549 0.19
550 0.15
551 0.17
552 0.17
553 0.15
554 0.16
555 0.16
556 0.14
557 0.15
558 0.17
559 0.16
560 0.24
561 0.3
562 0.33
563 0.39
564 0.43
565 0.48
566 0.48
567 0.47
568 0.44
569 0.39
570 0.37
571 0.32
572 0.29
573 0.22
574 0.21
575 0.2
576 0.16
577 0.14
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.15
585 0.23
586 0.25
587 0.32
588 0.41