FuNGI

A0A1B9FTM3

Protein Details

Accession

A0A1B9FTM3

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
68-88	GVQRLKFKPKVPIRRVKQEVD	Hydrophilic
205-236	RRSNQDKKVKGKDEKDKKQKKQKQMEKESQTS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-125	RGGMRGAPRGRGGAGRGRGRGA
210-227	DKKVKGKDEKDKKQKKQK
500-514	RRRLIREKGLIPMKK

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 12, mito_nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSAPNRGKPSLIAAAQGQPQPQTQPQASTSTPTNPPNLTSIPMSTVSSSTSGSGSISARSTPAPSAGGVQRLKFKPKVPIRRVKQEVDVKPDVSSIPSASTAPRGGMRGAPRGRGGAGRGRGRGAAPAPSTSIAAGVFGGPRPVASASTNRKFTSTATTSRFDEQDAEVYSDHSDTEGGSKGRPIDIDLVSTMSESAPTSLYRDRRSNQDKKVKGKDEKDKKQKKQKQMEKESQTSTPMEVDNIGAELGVKAEPISPEKRTQQLREDDTMLSDDEMQDRDTAGRRVRNFAQTGGSEQPTLQSDEDEEEVNEAQMVDLSESEEEEEEEDMMGDFNAVDGYDNPEEKLFIFQFPHLFPKFLPSTPVDLTTDTKPDINGAGAAPTKDVKPDIKPTAAQLRGTTGPGGKKGVEPLPEGRVGTMVVMKSGRVKIVMGKDIVMNVTPGLPTTFIQHLVHLDQKNKSAHVLGEVHKNYVVTPDIDRLLEDLYINGGQTPGEVDAERRRRLIREKGLIPMKKERD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.37
3	0.38
4	0.33
5	0.27
6	0.28
7	0.31
8	0.32
9	0.35
10	0.32
11	0.34
12	0.35
13	0.39
14	0.38
15	0.36
16	0.36
17	0.35
18	0.39
19	0.38
20	0.4
21	0.36
22	0.37
23	0.38
24	0.36
25	0.32
26	0.28
27	0.26
28	0.24
29	0.25
30	0.24
31	0.21
32	0.19
33	0.18
34	0.17
35	0.17
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.11
40	0.13
41	0.12
42	0.13
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.15
47	0.17
48	0.15
49	0.16
50	0.15
51	0.14
52	0.19
53	0.21
54	0.27
55	0.28
56	0.29
57	0.36
58	0.39
59	0.46
60	0.45
61	0.47
62	0.5
63	0.58
64	0.67
65	0.68
66	0.75
67	0.76
68	0.82
69	0.84
70	0.78
71	0.77
72	0.75
73	0.71
74	0.69
75	0.65
76	0.54
77	0.48
78	0.45
79	0.36
80	0.27
81	0.23
82	0.15
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.16
88	0.15
89	0.15
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.2
94	0.23
95	0.3
96	0.31
97	0.33
98	0.32
99	0.32
100	0.32
101	0.29
102	0.28
103	0.27
104	0.32
105	0.34
106	0.34
107	0.34
108	0.34
109	0.32
110	0.33
111	0.27
112	0.25
113	0.21
114	0.21
115	0.21
116	0.21
117	0.21
118	0.16
119	0.16
120	0.1
121	0.08
122	0.08
123	0.07
124	0.07
125	0.06
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.1
133	0.19
134	0.27
135	0.34
136	0.38
137	0.37
138	0.37
139	0.37
140	0.36
141	0.37
142	0.32
143	0.33
144	0.33
145	0.36
146	0.37
147	0.39
148	0.38
149	0.29
150	0.27
151	0.21
152	0.21
153	0.19
154	0.18
155	0.16
156	0.16
157	0.16
158	0.14
159	0.13
160	0.08
161	0.07
162	0.06
163	0.07
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.13
178	0.13
179	0.11
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.09
187	0.14
188	0.19
189	0.23
190	0.29
191	0.3
192	0.39
193	0.48
194	0.54
195	0.59
196	0.65
197	0.67
198	0.7
199	0.78
200	0.76
201	0.75
202	0.75
203	0.75
204	0.76
205	0.8
206	0.83
207	0.84
208	0.84
209	0.88
210	0.88
211	0.88
212	0.88
213	0.87
214	0.87
215	0.87
216	0.87
217	0.82
218	0.78
219	0.7
220	0.61
221	0.54
222	0.43
223	0.33
224	0.25
225	0.18
226	0.13
227	0.1
228	0.09
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.04
233	0.04
234	0.03
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.05
241	0.09
242	0.11
243	0.13
244	0.17
245	0.19
246	0.26
247	0.29
248	0.31
249	0.35
250	0.4
251	0.41
252	0.4
253	0.4
254	0.33
255	0.3
256	0.28
257	0.2
258	0.14
259	0.1
260	0.08
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.1
268	0.13
269	0.16
270	0.2
271	0.21
272	0.25
273	0.28
274	0.33
275	0.32
276	0.29
277	0.29
278	0.24
279	0.27
280	0.25
281	0.22
282	0.17
283	0.16
284	0.16
285	0.14
286	0.16
287	0.12
288	0.1
289	0.09
290	0.11
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.04
325	0.09
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.16
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.15
337	0.17
338	0.18
339	0.25
340	0.22
341	0.22
342	0.2
343	0.25
344	0.27
345	0.24
346	0.26
347	0.21
348	0.25
349	0.26
350	0.28
351	0.23
352	0.21
353	0.24
354	0.23
355	0.23
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.16
360	0.15
361	0.12
362	0.11
363	0.09
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.15
372	0.15
373	0.19
374	0.27
375	0.31
376	0.33
377	0.33
378	0.36
379	0.43
380	0.43
381	0.39
382	0.32
383	0.32
384	0.3
385	0.31
386	0.28
387	0.22
388	0.22
389	0.23
390	0.24
391	0.21
392	0.21
393	0.24
394	0.27
395	0.26
396	0.26
397	0.27
398	0.29
399	0.3
400	0.29
401	0.24
402	0.21
403	0.18
404	0.16
405	0.15
406	0.11
407	0.11
408	0.12
409	0.12
410	0.16
411	0.18
412	0.18
413	0.15
414	0.16
415	0.21
416	0.27
417	0.31
418	0.26
419	0.26
420	0.26
421	0.26
422	0.26
423	0.2
424	0.14
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.13
433	0.15
434	0.17
435	0.18
436	0.19
437	0.21
438	0.23
439	0.3
440	0.3
441	0.33
442	0.33
443	0.39
444	0.41
445	0.39
446	0.38
447	0.32
448	0.29
449	0.3
450	0.33
451	0.3
452	0.37
453	0.37
454	0.37
455	0.35
456	0.34
457	0.28
458	0.26
459	0.25
460	0.17
461	0.18
462	0.21
463	0.22
464	0.22
465	0.22
466	0.19
467	0.18
468	0.17
469	0.14
470	0.1
471	0.11
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.1
476	0.08
477	0.08
478	0.1
479	0.08
480	0.1
481	0.1
482	0.14
483	0.24
484	0.33
485	0.36
486	0.38
487	0.41
488	0.46
489	0.55
490	0.62
491	0.62
492	0.63
493	0.64
494	0.69
495	0.76
496	0.73
497	0.7

A0A1B9FTM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer