FuNGI

A0A1B9GC13

Protein Details

Accession

A0A1B9GC13

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-135	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
426-447	ERQEHHTKRRRIDDHRRQNEAK	Basic
594-615	EGESPTRPNKRKRTKGDDEDEE	Acidic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, nucl 8, cyto_mito 8, mito 4.5, plas 1, extr 1, pero 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MCMFIVLQGVPALFRWLSKKYPKIVNRVVEDTPKKVRTSDGEIEEIPVRYEGPNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEAEMMVEIFKYTERVVNMTRPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKAEEKREAIKMFEAMGHIVSEETQNQKHWDTNAITPGTPFMDLLSISLKYWVSHKLSTDPGWKNLKVILSDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRSHPTWDANTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFAQGSKGPQPCKNCGQSGHLTSNCIGEKKAKDPNVVEVAKPVDPKPFIFLDVSCLREYLAVELNVPGVPFPFDHELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLLKIWRAELPRMGGYLTNHGKVNLDRAQVILEGLAKNEDEIFQKRKEDEERQEHHTKRRRIDDHRRQNEAKGNGGAVQPAATARGGPLHPSLPTRPQFDLVPKEEADKKQSEAVKKAMSNTASNSDIVKNRRAIRMANLNAAEALKAELLGDDEPETVTVENTEDEEKEQLPLEEAREVLEEQGEDEGVDEEIVQPAIVSDEDEGEAPIGDETIELDEGESPTRPNKRKRTKGDDEDEEENGDEEDDDSSSSSSDDDDDDDAPPNPEADQPVPKKKLKVNPDGTVEGYEDDVKLWEPGYRERYYEKKFGVSLSDTEFIQQITKSYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWFYPYHYAPFAQDFKDIDKFKIEFEISEPFKPFAQLLGVFPAASRIHLPEPLQQLMINEDSPILDFYPDDFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQDRLLAALESKEKELTPDEKFRNRWGDNIMFVSNQQEYGLGEVCSEMYGLKFKDINVPVPLNPKQSDGATGSILAVPNYIPYSTFESPIPEIDECPDLTNNNSISVRYYFPKQAHPHRSVILPRYTPGPSRLNESDKDWVQRGGGGGGHRKGPRHSGGGDQRTGGPGMGRGGFHQTPQPRTSNGYPTPPASGYGGYAPPPVNAYNPPPRTYGGYAPPPPQAAPYGGGGYGGYGGGAYSAPQGGYGGYGGGSAYSAYNPPPPRPNPYAAPPPNPYGAPRPAYGAPPQGGYGGYGGAGAGAGSGAGRGGYNPYGGGGGAYQPRNGGGGGRGGRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.18
3	0.21
4	0.3
5	0.4
6	0.47
7	0.51
8	0.62
9	0.67
10	0.72
11	0.77
12	0.76
13	0.73
14	0.71
15	0.67
16	0.66
17	0.63
18	0.6
19	0.6
20	0.56
21	0.51
22	0.47
23	0.48
24	0.45
25	0.49
26	0.51
27	0.46
28	0.46
29	0.45
30	0.46
31	0.44
32	0.38
33	0.3
34	0.22
35	0.19
36	0.15
37	0.21
38	0.25
39	0.28
40	0.34
41	0.35
42	0.37
43	0.37
44	0.36
45	0.32
46	0.29
47	0.25
48	0.19
49	0.18
50	0.16
51	0.14
52	0.15
53	0.13
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.09
59	0.09
60	0.12
61	0.17
62	0.2
63	0.2
64	0.26
65	0.32
66	0.36
67	0.41
68	0.4
69	0.39
70	0.37
71	0.39
72	0.34
73	0.3
74	0.25
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.14
79	0.11
80	0.09
81	0.07
82	0.09
83	0.09
84	0.13
85	0.14
86	0.18
87	0.22
88	0.31
89	0.4
90	0.47
91	0.51
92	0.49
93	0.5
94	0.48
95	0.46
96	0.41
97	0.35
98	0.32
99	0.28
100	0.26
101	0.26
102	0.24
103	0.23
104	0.19
105	0.15
106	0.1
107	0.13
108	0.19
109	0.26
110	0.37
111	0.45
112	0.55
113	0.66
114	0.74
115	0.79
116	0.81
117	0.78
118	0.74
119	0.75
120	0.72
121	0.68
122	0.66
123	0.59
124	0.53
125	0.5
126	0.45
127	0.35
128	0.34
129	0.28
130	0.23
131	0.25
132	0.29
133	0.28
134	0.29
135	0.3
136	0.25
137	0.25
138	0.25
139	0.21
140	0.16
141	0.15
142	0.13
143	0.11
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.12
148	0.15
149	0.17
150	0.19
151	0.22
152	0.25
153	0.27
154	0.27
155	0.31
156	0.3
157	0.33
158	0.37
159	0.36
160	0.34
161	0.3
162	0.31
163	0.25
164	0.21
165	0.17
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.15
177	0.2
178	0.22
179	0.24
180	0.26
181	0.29
182	0.33
183	0.37
184	0.44
185	0.41
186	0.45
187	0.49
188	0.47
189	0.43
190	0.42
191	0.41
192	0.32
193	0.31
194	0.26
195	0.23
196	0.24
197	0.23
198	0.21
199	0.18
200	0.17
201	0.15
202	0.14
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.12
208	0.15
209	0.19
210	0.26
211	0.34
212	0.42
213	0.47
214	0.5
215	0.57
216	0.62
217	0.65
218	0.64
219	0.63
220	0.59
221	0.61
222	0.6
223	0.52
224	0.48
225	0.41
226	0.33
227	0.27
228	0.22
229	0.15
230	0.14
231	0.12
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.14
247	0.16
248	0.16
249	0.2
250	0.22
251	0.24
252	0.25
253	0.25
254	0.22
255	0.23
256	0.23
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.2
261	0.23
262	0.26
263	0.28
264	0.33
265	0.38
266	0.44
267	0.48
268	0.46
269	0.45
270	0.47
271	0.48
272	0.48
273	0.5
274	0.43
275	0.4
276	0.37
277	0.39
278	0.34
279	0.28
280	0.24
281	0.23
282	0.25
283	0.29
284	0.37
285	0.36
286	0.39
287	0.4
288	0.45
289	0.47
290	0.45
291	0.39
292	0.34
293	0.33
294	0.3
295	0.31
296	0.25
297	0.22
298	0.22
299	0.22
300	0.23
301	0.21
302	0.21
303	0.2
304	0.19
305	0.2
306	0.22
307	0.24
308	0.21
309	0.2
310	0.18
311	0.18
312	0.18
313	0.14
314	0.15
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.1
322	0.06
323	0.07
324	0.06
325	0.09
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.15
333	0.12
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.05
339	0.05
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.07
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.09
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.17
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.22
379	0.23
380	0.21
381	0.21
382	0.21
383	0.22
384	0.2
385	0.26
386	0.22
387	0.21
388	0.19
389	0.19
390	0.19
391	0.18
392	0.17
393	0.11
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.09
403	0.14
404	0.18
405	0.19
406	0.22
407	0.23
408	0.27
409	0.33
410	0.38
411	0.43
412	0.48
413	0.5
414	0.55
415	0.63
416	0.63
417	0.66
418	0.67
419	0.64
420	0.61
421	0.67
422	0.67
423	0.69
424	0.77
425	0.78
426	0.81
427	0.81
428	0.82
429	0.74
430	0.71
431	0.68
432	0.59
433	0.51
434	0.4
435	0.33
436	0.27
437	0.26
438	0.21
439	0.13
440	0.11
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.15
454	0.17
455	0.22
456	0.25
457	0.27
458	0.27
459	0.28
460	0.28
461	0.31
462	0.35
463	0.3
464	0.3
465	0.26
466	0.29
467	0.32
468	0.32
469	0.31
470	0.26
471	0.24
472	0.26
473	0.3
474	0.3
475	0.29
476	0.31
477	0.31
478	0.3
479	0.31
480	0.3
481	0.28
482	0.25
483	0.23
484	0.23
485	0.2
486	0.19
487	0.18
488	0.17
489	0.21
490	0.22
491	0.24
492	0.26
493	0.29
494	0.31
495	0.31
496	0.3
497	0.3
498	0.37
499	0.35
500	0.34
501	0.31
502	0.28
503	0.26
504	0.25
505	0.2
506	0.1
507	0.09
508	0.05
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.06
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.03
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.06
585	0.1
586	0.18
587	0.25
588	0.33
589	0.44
590	0.54
591	0.64
592	0.73
593	0.79
594	0.81
595	0.83
596	0.82
597	0.76
598	0.7
599	0.62
600	0.53
601	0.43
602	0.34
603	0.24
604	0.17
605	0.12
606	0.07
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.05
615	0.04
616	0.04
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.07
621	0.08
622	0.08
623	0.09
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.09
628	0.08
629	0.08
630	0.1
631	0.11
632	0.18
633	0.23
634	0.31
635	0.37
636	0.38
637	0.42
638	0.46
639	0.52
640	0.52
641	0.58
642	0.56
643	0.55
644	0.58
645	0.55
646	0.49
647	0.42
648	0.34
649	0.24
650	0.18
651	0.13
652	0.09
653	0.07
654	0.07
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.07
659	0.08
660	0.14
661	0.19
662	0.2
663	0.21
664	0.25
665	0.33
666	0.36
667	0.4
668	0.36
669	0.33
670	0.33
671	0.32
672	0.32
673	0.25
674	0.22
675	0.2
676	0.2
677	0.17
678	0.16
679	0.16
680	0.13
681	0.12
682	0.11
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.08
687	0.1
688	0.1
689	0.09
690	0.11
691	0.11
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.08
707	0.1
708	0.09
709	0.12
710	0.15
711	0.15
712	0.16
713	0.14
714	0.15
715	0.14
716	0.19
717	0.19
718	0.17
719	0.19
720	0.18
721	0.2
722	0.27
723	0.27
724	0.23
725	0.26
726	0.25
727	0.23
728	0.27
729	0.24
730	0.17
731	0.18
732	0.25
733	0.22
734	0.24
735	0.25
736	0.22
737	0.22
738	0.22
739	0.2
740	0.13
741	0.13
742	0.12
743	0.11
744	0.13
745	0.13
746	0.12
747	0.12
748	0.15
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.11
753	0.13
754	0.15
755	0.17
756	0.19
757	0.24
758	0.24
759	0.23
760	0.21
761	0.2
762	0.2
763	0.2
764	0.14
765	0.1
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.07
771	0.06
772	0.06
773	0.07
774	0.11
775	0.11
776	0.11
777	0.1
778	0.1
779	0.11
780	0.13
781	0.13
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.1
786	0.13
787	0.13
788	0.11
789	0.11
790	0.12
791	0.15
792	0.16
793	0.15
794	0.13
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.07
804	0.06
805	0.07
806	0.08
807	0.12
808	0.13
809	0.13
810	0.14
811	0.13
812	0.15
813	0.19
814	0.21
815	0.23
816	0.31
817	0.36
818	0.43
819	0.45
820	0.49
821	0.55
822	0.51
823	0.49
824	0.46
825	0.43
826	0.39
827	0.4
828	0.34
829	0.25
830	0.24
831	0.24
832	0.17
833	0.15
834	0.12
835	0.1
836	0.08
837	0.1
838	0.11
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.07
845	0.06
846	0.05
847	0.09
848	0.09
849	0.12
850	0.13
851	0.13
852	0.22
853	0.24
854	0.28
855	0.28
856	0.3
857	0.3
858	0.36
859	0.39
860	0.35
861	0.34
862	0.32
863	0.29
864	0.28
865	0.29
866	0.24
867	0.22
868	0.18
869	0.17
870	0.15
871	0.15
872	0.15
873	0.11
874	0.09
875	0.08
876	0.08
877	0.09
878	0.08
879	0.07
880	0.1
881	0.18
882	0.19
883	0.2
884	0.2
885	0.22
886	0.23
887	0.24
888	0.25
889	0.17
890	0.17
891	0.17
892	0.19
893	0.15
894	0.17
895	0.17
896	0.14
897	0.15
898	0.2
899	0.18
900	0.2
901	0.2
902	0.18
903	0.2
904	0.22
905	0.23
906	0.21
907	0.25
908	0.27
909	0.29
910	0.38
911	0.43
912	0.52
913	0.58
914	0.6
915	0.6
916	0.56
917	0.59
918	0.56
919	0.55
920	0.51
921	0.43
922	0.4
923	0.4
924	0.4
925	0.37
926	0.36
927	0.36
928	0.3
929	0.36
930	0.41
931	0.41
932	0.41
933	0.42
934	0.44
935	0.42
936	0.45
937	0.39
938	0.35
939	0.3
940	0.3
941	0.26
942	0.2
943	0.19
944	0.19
945	0.24
946	0.24
947	0.3
948	0.31
949	0.33
950	0.34
951	0.39
952	0.39
953	0.38
954	0.37
955	0.41
956	0.48
957	0.52
958	0.51
959	0.45
960	0.42
961	0.38
962	0.37
963	0.28
964	0.18
965	0.14
966	0.15
967	0.16
968	0.15
969	0.14
970	0.21
971	0.21
972	0.22
973	0.27
974	0.31
975	0.35
976	0.39
977	0.41
978	0.36
979	0.42
980	0.46
981	0.48
982	0.46
983	0.48
984	0.46
985	0.45
986	0.47
987	0.41
988	0.37
989	0.3
990	0.26
991	0.2
992	0.2
993	0.2
994	0.17
995	0.2
996	0.19
997	0.17
998	0.19
999	0.19
1000	0.18
1001	0.2
1002	0.26
1003	0.33
1004	0.37
1005	0.39
1006	0.38
1007	0.39
1008	0.42
1009	0.43
1010	0.42
1011	0.39
1012	0.45
1013	0.47
1014	0.48
1015	0.49
1016	0.45
1017	0.42
1018	0.37
1019	0.32
1020	0.25
1021	0.22
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.17
1025	0.17
1026	0.15
1027	0.13
1028	0.11
1029	0.09
1030	0.06
1031	0.04
1032	0.04
1033	0.04
1034	0.04
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.06
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.07
1042	0.08
1043	0.07
1044	0.06
1045	0.05
1046	0.06
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.05
1051	0.06
1052	0.07
1053	0.08
1054	0.1
1055	0.18
1056	0.21
1057	0.27
1058	0.35
1059	0.39
1060	0.46
1061	0.51
1062	0.55
1063	0.54
1064	0.58
1065	0.64
1066	0.61
1067	0.65
1068	0.6
1069	0.59
1070	0.56
1071	0.51
1072	0.47
1073	0.43
1074	0.44
1075	0.4
1076	0.37
1077	0.38
1078	0.37
1079	0.39
1080	0.4
1081	0.4
1082	0.33
1083	0.31
1084	0.31
1085	0.27
1086	0.25
1087	0.22
1088	0.18
1089	0.11
1090	0.1
1091	0.08
1092	0.07
1093	0.06
1094	0.05
1095	0.04
1096	0.03
1097	0.03
1098	0.03
1099	0.03
1100	0.03
1101	0.03
1102	0.03
1103	0.04
1104	0.05
1105	0.09
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.12
1110	0.12
1111	0.12
1112	0.11
1113	0.08
1114	0.12
1115	0.19
1116	0.2
1117	0.2
1118	0.2
1119	0.21
1120	0.21
1121	0.21
1122	0.18
1123	0.13
1124	0.2
1125	0.25

A0A1B9GC13

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer