Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9GD41

Protein Details
Accession A0A1B9GD41    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210YIPPDKSKNKDKKGKGKAKPIMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-207KSKNKDKKGKGKAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MPRPGQAQARRKRALEEMEAGSSTSYTSYNYSNGPSNLNCENDYNLEADDDGDDEEGGAIDNPRSQCLPVGMLPEDFDGTPLDGSQYLAMANRDNRDLPFVKTVINPYKTDLIGPTLPSTSQNHASGSRHPALPKESWQELFPIHYQGYRKHIQSQLSSSPSTSTYPSDYPPIPPASRRSDWYAYINGYIPPDKSKNKDKKGKGKAKPIMSEEEMMNASMGQEMDIDTEKVEEEVVEDVIVGKTSRGNEKVVGAPREPLLGVLRNLNSSQALNILSHFAHWLSESIEQSPPPIPTSPYLPPTQPGDHPPPHQHKTINHLSSNYFSWIFSLLLITDQHLSSDEISTLRDLARASMKVAGHRYILGVVGKQIGEGWKLGDELKAKHVEDGDQGLSSGKEDNSVDQILARCWLIVHAVASGWGQKDLLYELDNLFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.59
3 0.55
4 0.48
5 0.45
6 0.44
7 0.39
8 0.31
9 0.24
10 0.18
11 0.13
12 0.1
13 0.09
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.17
18 0.2
19 0.25
20 0.26
21 0.29
22 0.28
23 0.31
24 0.32
25 0.33
26 0.32
27 0.27
28 0.28
29 0.26
30 0.26
31 0.22
32 0.19
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.11
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.11
49 0.12
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.18
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.19
63 0.15
64 0.14
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.1
77 0.13
78 0.16
79 0.18
80 0.2
81 0.21
82 0.21
83 0.26
84 0.27
85 0.26
86 0.27
87 0.26
88 0.26
89 0.26
90 0.33
91 0.36
92 0.38
93 0.35
94 0.33
95 0.37
96 0.35
97 0.33
98 0.27
99 0.23
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.16
104 0.16
105 0.18
106 0.2
107 0.2
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.26
112 0.28
113 0.3
114 0.34
115 0.33
116 0.31
117 0.3
118 0.32
119 0.33
120 0.33
121 0.34
122 0.33
123 0.33
124 0.31
125 0.31
126 0.29
127 0.26
128 0.26
129 0.21
130 0.18
131 0.15
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.27
136 0.28
137 0.29
138 0.33
139 0.37
140 0.38
141 0.39
142 0.41
143 0.41
144 0.4
145 0.38
146 0.32
147 0.29
148 0.26
149 0.24
150 0.2
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.2
156 0.19
157 0.19
158 0.22
159 0.24
160 0.22
161 0.23
162 0.28
163 0.31
164 0.32
165 0.33
166 0.36
167 0.34
168 0.36
169 0.36
170 0.33
171 0.26
172 0.26
173 0.24
174 0.19
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.19
180 0.21
181 0.25
182 0.35
183 0.43
184 0.52
185 0.61
186 0.66
187 0.72
188 0.79
189 0.85
190 0.82
191 0.83
192 0.8
193 0.76
194 0.72
195 0.64
196 0.57
197 0.48
198 0.42
199 0.31
200 0.26
201 0.21
202 0.16
203 0.13
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.06
231 0.08
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.22
238 0.26
239 0.27
240 0.24
241 0.23
242 0.22
243 0.22
244 0.2
245 0.15
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.15
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.2
283 0.22
284 0.24
285 0.25
286 0.23
287 0.25
288 0.28
289 0.3
290 0.27
291 0.29
292 0.34
293 0.36
294 0.4
295 0.47
296 0.51
297 0.51
298 0.53
299 0.52
300 0.47
301 0.51
302 0.56
303 0.52
304 0.46
305 0.44
306 0.42
307 0.39
308 0.38
309 0.33
310 0.23
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.17
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.23
342 0.26
343 0.3
344 0.29
345 0.25
346 0.25
347 0.24
348 0.19
349 0.2
350 0.17
351 0.14
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.11
362 0.12
363 0.13
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.25
368 0.29
369 0.29
370 0.31
371 0.31
372 0.29
373 0.29
374 0.31
375 0.25
376 0.2
377 0.2
378 0.18
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.11
383 0.14
384 0.14
385 0.16
386 0.2
387 0.2
388 0.2
389 0.2
390 0.21
391 0.19
392 0.2
393 0.18
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.15
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.14
410 0.15
411 0.16
412 0.14
413 0.15