FuNGI

A0A1B9GF09

Protein Details

Accession

A0A1B9GF09

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MSDASLFLRKRKDKERRSRVPSRSVGG	Hydrophilic
108-127	SKLLLNRKRPGPKQPPQFAI	Hydrophilic
177-199	DPVGRAPGKKKMKKGTKEVFHQD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-21	RKRKDKERRSRVP
181-191	RAPGKKKMKKG
507-536	RPSRPPSRGPGSRGTSSPTGKRPNGPMPGK
668-677	ANRAGKKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSDASLFLRKRKDKERRSRVPSRSVGGGGPSTSTASQNAPSPSSSSAPRPNATASSSSTVKPEPVDSNGKNPNITEIKIYSSGSDGGMRFNFMRLNHEKEIDPTQIGSKLLLNRKRPGPKQPPQFAINDEGKIVGKYVYDASGKPVLDSEGKPVIEKKAEGETMDMSLVVSAPPGEDPVGRAPGKKKMKKGTKEVFHQDIEVMRLRREEAQPWLLESSRPRANGNNNIPEMWVGRMQEPSALPTVLLVNDGTTDGFEMVPLGRTYRFDPERPFKPLDSDEANKLFDHQTRHKIHDRWALRPEGSNDDAPTPGTPVVRVNIKAERDLEERAMRMEGRLRLNNGSLQDRKPKVERYEDDYVKEGRRAERGLEGGIDEELDFDETEHFQDDDDVNTFYRNAEEEDDARDAEEQQKKEYRLANANVGDRPQIAEDDDEEDLFGEKKKYSDEGKQLKKILKKRAEDGEDDNMFSDDESDDTDTESIDSKTSQNKDQDKDKDKDSKPSADGDRPSRPPSRGPGSRGTSSPTGKRPNGPMPGKASTAPPGSGAALLAQRAASRGASPRPSGGARAGSPLSGRAASPEGRATSPVMRGNSPSRGQSPAPGPARGSSPVSGPSTRDASPAPASGGSQKKSTGNGKRKTTSESPGPSTAGASTNSPSSKRKNSPSETANRAGKKSKKSGSNTPTPGPEEIESFPGMITKQDVLDWFRSLKKETVPMSEAIAAFRNRIMNAGKNKEANQKLFLGWMKMLADQEEKMLRLKDEYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.87
3	0.88
4	0.9
5	0.93
6	0.9
7	0.89
8	0.85
9	0.78
10	0.71
11	0.62
12	0.54
13	0.47
14	0.41
15	0.31
16	0.25
17	0.22
18	0.19
19	0.18
20	0.18
21	0.17
22	0.17
23	0.19
24	0.23
25	0.25
26	0.24
27	0.24
28	0.25
29	0.27
30	0.27
31	0.29
32	0.31
33	0.37
34	0.42
35	0.42
36	0.42
37	0.42
38	0.42
39	0.42
40	0.37
41	0.32
42	0.32
43	0.32
44	0.3
45	0.31
46	0.29
47	0.28
48	0.26
49	0.26
50	0.24
51	0.28
52	0.37
53	0.35
54	0.43
55	0.49
56	0.49
57	0.46
58	0.42
59	0.45
60	0.39
61	0.38
62	0.34
63	0.28
64	0.3
65	0.31
66	0.31
67	0.23
68	0.22
69	0.22
70	0.19
71	0.21
72	0.17
73	0.19
74	0.19
75	0.21
76	0.19
77	0.2
78	0.22
79	0.19
80	0.27
81	0.28
82	0.35
83	0.36
84	0.38
85	0.37
86	0.37
87	0.42
88	0.36
89	0.32
90	0.25
91	0.25
92	0.25
93	0.24
94	0.22
95	0.21
96	0.26
97	0.34
98	0.41
99	0.44
100	0.48
101	0.57
102	0.66
103	0.67
104	0.71
105	0.73
106	0.75
107	0.8
108	0.81
109	0.78
110	0.71
111	0.68
112	0.6
113	0.56
114	0.5
115	0.4
116	0.31
117	0.27
118	0.24
119	0.22
120	0.19
121	0.13
122	0.09
123	0.1
124	0.11
125	0.13
126	0.14
127	0.14
128	0.18
129	0.23
130	0.22
131	0.21
132	0.21
133	0.19
134	0.22
135	0.22
136	0.23
137	0.24
138	0.24
139	0.25
140	0.26
141	0.29
142	0.27
143	0.27
144	0.24
145	0.25
146	0.26
147	0.25
148	0.25
149	0.21
150	0.19
151	0.19
152	0.16
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.06
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.09
165	0.12
166	0.19
167	0.19
168	0.22
169	0.25
170	0.34
171	0.45
172	0.49
173	0.54
174	0.59
175	0.68
176	0.73
177	0.81
178	0.81
179	0.78
180	0.81
181	0.8
182	0.74
183	0.65
184	0.57
185	0.48
186	0.39
187	0.33
188	0.31
189	0.24
190	0.2
191	0.2
192	0.21
193	0.25
194	0.25
195	0.26
196	0.26
197	0.3
198	0.29
199	0.3
200	0.3
201	0.25
202	0.25
203	0.24
204	0.25
205	0.24
206	0.25
207	0.25
208	0.29
209	0.36
210	0.43
211	0.49
212	0.5
213	0.47
214	0.45
215	0.44
216	0.39
217	0.33
218	0.24
219	0.19
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.14
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.15
228	0.13
229	0.12
230	0.11
231	0.12
232	0.09
233	0.09
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.1
251	0.12
252	0.2
253	0.23
254	0.25
255	0.33
256	0.39
257	0.43
258	0.47
259	0.48
260	0.4
261	0.42
262	0.4
263	0.36
264	0.35
265	0.32
266	0.31
267	0.3
268	0.3
269	0.25
270	0.26
271	0.24
272	0.22
273	0.26
274	0.27
275	0.35
276	0.38
277	0.44
278	0.5
279	0.5
280	0.54
281	0.56
282	0.54
283	0.5
284	0.5
285	0.48
286	0.41
287	0.41
288	0.37
289	0.33
290	0.32
291	0.27
292	0.24
293	0.21
294	0.21
295	0.18
296	0.15
297	0.12
298	0.11
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.14
304	0.15
305	0.16
306	0.19
307	0.2
308	0.21
309	0.21
310	0.23
311	0.22
312	0.23
313	0.22
314	0.19
315	0.18
316	0.17
317	0.17
318	0.13
319	0.12
320	0.15
321	0.18
322	0.21
323	0.22
324	0.24
325	0.24
326	0.25
327	0.26
328	0.24
329	0.25
330	0.23
331	0.24
332	0.31
333	0.31
334	0.33
335	0.35
336	0.39
337	0.38
338	0.44
339	0.44
340	0.42
341	0.49
342	0.48
343	0.45
344	0.42
345	0.4
346	0.32
347	0.32
348	0.27
349	0.19
350	0.21
351	0.2
352	0.19
353	0.19
354	0.19
355	0.17
356	0.15
357	0.13
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.12
389	0.13
390	0.12
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.16
395	0.2
396	0.18
397	0.21
398	0.26
399	0.27
400	0.31
401	0.34
402	0.31
403	0.33
404	0.34
405	0.36
406	0.35
407	0.36
408	0.32
409	0.29
410	0.25
411	0.18
412	0.17
413	0.12
414	0.09
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.13
431	0.16
432	0.23
433	0.32
434	0.4
435	0.47
436	0.51
437	0.55
438	0.56
439	0.6
440	0.61
441	0.61
442	0.6
443	0.56
444	0.56
445	0.6
446	0.58
447	0.54
448	0.5
449	0.48
450	0.4
451	0.37
452	0.32
453	0.24
454	0.2
455	0.17
456	0.13
457	0.06
458	0.05
459	0.06
460	0.07
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.08
470	0.1
471	0.17
472	0.19
473	0.24
474	0.31
475	0.37
476	0.41
477	0.49
478	0.56
479	0.57
480	0.58
481	0.58
482	0.61
483	0.56
484	0.61
485	0.57
486	0.53
487	0.47
488	0.51
489	0.49
490	0.45
491	0.48
492	0.44
493	0.46
494	0.44
495	0.48
496	0.46
497	0.43
498	0.41
499	0.44
500	0.47
501	0.45
502	0.46
503	0.5
504	0.51
505	0.51
506	0.48
507	0.45
508	0.42
509	0.4
510	0.41
511	0.4
512	0.42
513	0.42
514	0.46
515	0.48
516	0.5
517	0.56
518	0.53
519	0.5
520	0.48
521	0.49
522	0.46
523	0.41
524	0.35
525	0.29
526	0.28
527	0.24
528	0.19
529	0.17
530	0.16
531	0.15
532	0.13
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.09
543	0.13
544	0.18
545	0.22
546	0.23
547	0.23
548	0.26
549	0.26
550	0.26
551	0.25
552	0.24
553	0.2
554	0.23
555	0.22
556	0.2
557	0.19
558	0.18
559	0.17
560	0.14
561	0.13
562	0.11
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.18
567	0.18
568	0.18
569	0.2
570	0.2
571	0.2
572	0.24
573	0.27
574	0.26
575	0.25
576	0.28
577	0.31
578	0.35
579	0.35
580	0.33
581	0.31
582	0.33
583	0.33
584	0.34
585	0.34
586	0.36
587	0.37
588	0.35
589	0.34
590	0.31
591	0.34
592	0.31
593	0.3
594	0.21
595	0.2
596	0.23
597	0.26
598	0.25
599	0.24
600	0.25
601	0.26
602	0.25
603	0.25
604	0.22
605	0.22
606	0.24
607	0.23
608	0.21
609	0.18
610	0.18
611	0.24
612	0.3
613	0.27
614	0.27
615	0.28
616	0.29
617	0.35
618	0.44
619	0.46
620	0.5
621	0.57
622	0.64
623	0.67
624	0.67
625	0.68
626	0.65
627	0.61
628	0.6
629	0.57
630	0.54
631	0.51
632	0.5
633	0.42
634	0.37
635	0.32
636	0.25
637	0.2
638	0.17
639	0.15
640	0.19
641	0.21
642	0.23
643	0.27
644	0.33
645	0.42
646	0.49
647	0.57
648	0.62
649	0.67
650	0.72
651	0.76
652	0.76
653	0.73
654	0.73
655	0.71
656	0.65
657	0.63
658	0.63
659	0.62
660	0.62
661	0.65
662	0.65
663	0.67
664	0.69
665	0.76
666	0.75
667	0.78
668	0.75
669	0.7
670	0.67
671	0.61
672	0.55
673	0.48
674	0.41
675	0.34
676	0.29
677	0.28
678	0.23
679	0.2
680	0.18
681	0.16
682	0.15
683	0.12
684	0.13
685	0.12
686	0.12
687	0.13
688	0.17
689	0.2
690	0.22
691	0.24
692	0.25
693	0.28
694	0.31
695	0.33
696	0.35
697	0.35
698	0.4
699	0.41
700	0.45
701	0.43
702	0.41
703	0.4
704	0.4
705	0.35
706	0.29
707	0.31
708	0.24
709	0.23
710	0.24
711	0.24
712	0.2
713	0.24
714	0.26
715	0.29
716	0.38
717	0.45
718	0.48
719	0.5
720	0.55
721	0.61
722	0.64
723	0.6
724	0.54
725	0.5
726	0.45
727	0.47
728	0.44
729	0.38
730	0.3
731	0.3
732	0.27
733	0.26
734	0.27
735	0.23
736	0.23
737	0.2
738	0.24
739	0.24
740	0.24
741	0.26
742	0.28
743	0.26

A0A1B9GF09

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer