Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9G9X0

Protein Details
Accession A0A1B9G9X0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-43QPNAQASSSKHHKSKKDKSHKKDKSHKHKDKSSSNGHHHESBasic
272-291TTSRPAKQPRLANKPRQPAYHydrophilic
298-330TTGWTPRELKKYRKEQEKKKRDAKKAQKAGAEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-34KHHKSKKDKSHKKDKSHKHKDKS
306-325LKKYRKEQEKKKRDAKKAQK
362-365RKAG
369-376DENRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSQPNAQASSSKHHKSKKDKSHKKDKSHKHKDKSSSNGHHHESGSSKNDKSPFEHRLSRMRLAIPPKFSINMMEGVREKLDGMIMRYVSQMGGVLLAHWDHEFVDDTSKIINECPAGVIEVEFHSILWAPKIGQKLYGTHSLSSPSHLSLLFNKTFNVSIPLQHIPTELYEFEHTDETADSDSEDEEEEGFILGNGVVEDVGRWKEKATGKSLGEGGKGIKFTVIGMQVTNQMLSLTGSLLSDPSNPPPAPEPTMHLPTRVSPSLSPSPAPTTSRPAKQPRLANKPRQPAYQEEEVDTTGWTPRELKKYRKEQEKKKRDAKKAQKAGAEVEGGVLEHLQVEAAGDLVNAQGVDPEENVGGKRKAGEGDDENRKKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.72
3 0.8
4 0.82
5 0.85
6 0.88
7 0.9
8 0.94
9 0.94
10 0.94
11 0.94
12 0.94
13 0.94
14 0.94
15 0.94
16 0.93
17 0.93
18 0.92
19 0.91
20 0.89
21 0.88
22 0.87
23 0.85
24 0.83
25 0.77
26 0.72
27 0.63
28 0.57
29 0.49
30 0.45
31 0.43
32 0.4
33 0.37
34 0.38
35 0.43
36 0.42
37 0.44
38 0.46
39 0.47
40 0.48
41 0.55
42 0.54
43 0.58
44 0.62
45 0.61
46 0.57
47 0.53
48 0.51
49 0.52
50 0.53
51 0.48
52 0.45
53 0.42
54 0.39
55 0.36
56 0.32
57 0.26
58 0.26
59 0.22
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.12
67 0.15
68 0.12
69 0.13
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.12
77 0.1
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.07
89 0.09
90 0.08
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.12
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.11
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.23
124 0.3
125 0.28
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.22
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.13
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.14
193 0.19
194 0.23
195 0.26
196 0.31
197 0.31
198 0.33
199 0.35
200 0.3
201 0.25
202 0.22
203 0.19
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.2
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.26
240 0.25
241 0.32
242 0.31
243 0.29
244 0.27
245 0.26
246 0.32
247 0.28
248 0.25
249 0.19
250 0.26
251 0.3
252 0.31
253 0.29
254 0.25
255 0.28
256 0.29
257 0.33
258 0.28
259 0.3
260 0.35
261 0.4
262 0.46
263 0.51
264 0.56
265 0.6
266 0.66
267 0.68
268 0.73
269 0.77
270 0.79
271 0.79
272 0.8
273 0.78
274 0.75
275 0.68
276 0.63
277 0.6
278 0.58
279 0.51
280 0.42
281 0.39
282 0.35
283 0.32
284 0.25
285 0.2
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.21
291 0.31
292 0.38
293 0.46
294 0.53
295 0.64
296 0.72
297 0.8
298 0.84
299 0.85
300 0.9
301 0.91
302 0.92
303 0.91
304 0.92
305 0.91
306 0.92
307 0.92
308 0.92
309 0.91
310 0.87
311 0.81
312 0.73
313 0.66
314 0.59
315 0.48
316 0.37
317 0.27
318 0.21
319 0.16
320 0.13
321 0.1
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.06
338 0.07
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.2
349 0.22
350 0.25
351 0.26
352 0.32
353 0.32
354 0.4
355 0.5
356 0.57