Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9GDW8

Protein Details
Accession A0A1B9GDW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-45IISNGRTKPKDQKRSESDEMIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MPLVEYDSSSDSDPDPDQEHEDRQIISNGRTKPKDQKRSESDEMIVRPMKRQRTLPSLPDTFETAPKDDPSLHQGRRRTRPYVDGEYNTHVYLSLSIPTGLRMILEEVLKAIQDELPTHTMHSLLSSLHISLTHPLPLRRHQIIPFRNALTDRLRTGDKFRLSFASEIKVYYNRLEGGEEGSGGRAFVALRVGAGAKELESILDKVIHPLLEVNHFPKYHENPEFHTSFGWTLLQPTSGECDGTIAGDVDDYDTPNLPTTPRDSSTTEFKSKFTPFLDDLVKRINTKFEDAILERQPKGGWEVDTVQFRVAKEVHILPLGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.25
5 0.27
6 0.3
7 0.31
8 0.32
9 0.3
10 0.29
11 0.33
12 0.31
13 0.32
14 0.36
15 0.38
16 0.45
17 0.48
18 0.51
19 0.56
20 0.64
21 0.7
22 0.71
23 0.75
24 0.74
25 0.8
26 0.8
27 0.74
28 0.66
29 0.62
30 0.55
31 0.5
32 0.47
33 0.38
34 0.39
35 0.41
36 0.46
37 0.44
38 0.49
39 0.5
40 0.55
41 0.6
42 0.6
43 0.61
44 0.56
45 0.53
46 0.48
47 0.45
48 0.37
49 0.36
50 0.32
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.25
55 0.22
56 0.22
57 0.25
58 0.31
59 0.34
60 0.38
61 0.44
62 0.52
63 0.61
64 0.64
65 0.62
66 0.57
67 0.6
68 0.62
69 0.64
70 0.6
71 0.54
72 0.52
73 0.51
74 0.49
75 0.4
76 0.33
77 0.24
78 0.18
79 0.16
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.16
123 0.18
124 0.24
125 0.29
126 0.3
127 0.32
128 0.33
129 0.41
130 0.42
131 0.44
132 0.42
133 0.36
134 0.35
135 0.32
136 0.31
137 0.25
138 0.23
139 0.2
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.22
144 0.25
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.23
149 0.24
150 0.25
151 0.21
152 0.18
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.14
200 0.15
201 0.18
202 0.19
203 0.2
204 0.25
205 0.29
206 0.33
207 0.37
208 0.37
209 0.38
210 0.43
211 0.43
212 0.36
213 0.32
214 0.25
215 0.2
216 0.19
217 0.15
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.11
228 0.12
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.16
247 0.2
248 0.22
249 0.25
250 0.27
251 0.3
252 0.39
253 0.43
254 0.47
255 0.43
256 0.41
257 0.44
258 0.43
259 0.44
260 0.37
261 0.37
262 0.31
263 0.35
264 0.41
265 0.36
266 0.35
267 0.38
268 0.38
269 0.34
270 0.34
271 0.36
272 0.31
273 0.35
274 0.34
275 0.29
276 0.33
277 0.34
278 0.39
279 0.4
280 0.43
281 0.38
282 0.38
283 0.36
284 0.31
285 0.32
286 0.29
287 0.23
288 0.22
289 0.27
290 0.31
291 0.35
292 0.35
293 0.34
294 0.33
295 0.31
296 0.32
297 0.28
298 0.24
299 0.25
300 0.27
301 0.27
302 0.29