Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YZK5

Protein Details
Accession C7YZK5    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-372VEEPEVKKTKAKPAPKAKKAKGTKAKGRKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-9RK
15-69QKPNGAAKPVKAAKGKRKAAEDGSPVSLKKQRSVKKVAVTAKSVEKPAQKSKKSK
269-282VSKEQGRRAKKAVK
347-372KKTKAKPAPKAKKAKGTKAKGRKAKA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_47760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRKSVSDVQKPNGAAKPVKAAKGKRKAAEDGSPVSLKKQRSVKKVAVTAKSVEKPAQKSKKSKAVEEVKVVEEEETTTLDIPNESESEAEESNEVKAIVEELDSGDEDITEGDVVFKPGQDVGKIPKVSKAVQKAAEGADEDAGVIYIGRIPHGFYEHEMRQYFEQFGTIVALRLSRNKKTGASKHYAFVKFAEATTAEIVAKTMDNYLLFGHILKCRVIPKEQVHDDLFKGANRRFKPVPWNKMAGYQLQKPLTEAGWTKKVSKEQGRRAKKAVKLKEIGYEFEAPEIKDVPPPAPKAIENGEEVKAIEAAPAEEEPKEEPKVEEPKPEPEPVVEEPEVKKTKAKPAPKAKKAKGTKAKGRKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.72
3 0.68
4 0.65
5 0.6
6 0.55
7 0.47
8 0.4
9 0.46
10 0.44
11 0.5
12 0.52
13 0.56
14 0.61
15 0.69
16 0.74
17 0.7
18 0.71
19 0.7
20 0.69
21 0.68
22 0.63
23 0.56
24 0.53
25 0.49
26 0.43
27 0.42
28 0.42
29 0.35
30 0.37
31 0.42
32 0.46
33 0.52
34 0.6
35 0.62
36 0.65
37 0.72
38 0.73
39 0.68
40 0.63
41 0.59
42 0.59
43 0.54
44 0.48
45 0.45
46 0.44
47 0.45
48 0.53
49 0.59
50 0.59
51 0.65
52 0.71
53 0.76
54 0.73
55 0.71
56 0.71
57 0.7
58 0.68
59 0.65
60 0.6
61 0.51
62 0.48
63 0.43
64 0.33
65 0.23
66 0.18
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.15
116 0.22
117 0.24
118 0.23
119 0.26
120 0.28
121 0.31
122 0.35
123 0.37
124 0.35
125 0.37
126 0.37
127 0.35
128 0.32
129 0.3
130 0.24
131 0.18
132 0.12
133 0.09
134 0.08
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.15
150 0.16
151 0.21
152 0.21
153 0.22
154 0.21
155 0.22
156 0.22
157 0.15
158 0.14
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.15
168 0.18
169 0.19
170 0.22
171 0.23
172 0.27
173 0.34
174 0.41
175 0.41
176 0.43
177 0.42
178 0.43
179 0.49
180 0.46
181 0.38
182 0.32
183 0.29
184 0.23
185 0.21
186 0.19
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.16
211 0.18
212 0.2
213 0.25
214 0.29
215 0.36
216 0.38
217 0.41
218 0.39
219 0.38
220 0.36
221 0.32
222 0.28
223 0.21
224 0.23
225 0.22
226 0.28
227 0.28
228 0.33
229 0.32
230 0.34
231 0.44
232 0.49
233 0.55
234 0.52
235 0.55
236 0.5
237 0.54
238 0.52
239 0.48
240 0.43
241 0.39
242 0.4
243 0.38
244 0.37
245 0.32
246 0.32
247 0.25
248 0.24
249 0.22
250 0.2
251 0.25
252 0.27
253 0.28
254 0.31
255 0.36
256 0.41
257 0.49
258 0.54
259 0.57
260 0.67
261 0.74
262 0.75
263 0.77
264 0.76
265 0.73
266 0.74
267 0.72
268 0.7
269 0.65
270 0.62
271 0.62
272 0.56
273 0.51
274 0.44
275 0.39
276 0.3
277 0.28
278 0.28
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.22
287 0.24
288 0.25
289 0.26
290 0.26
291 0.28
292 0.3
293 0.3
294 0.27
295 0.28
296 0.27
297 0.24
298 0.24
299 0.2
300 0.17
301 0.14
302 0.12
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.26
316 0.35
317 0.37
318 0.43
319 0.42
320 0.48
321 0.51
322 0.52
323 0.46
324 0.38
325 0.41
326 0.35
327 0.39
328 0.33
329 0.33
330 0.32
331 0.4
332 0.42
333 0.37
334 0.41
335 0.38
336 0.48
337 0.53
338 0.61
339 0.62
340 0.7
341 0.8
342 0.84
343 0.9
344 0.88
345 0.89
346 0.89
347 0.89
348 0.89
349 0.88
350 0.89
351 0.89
352 0.91