Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9H3P7

Protein Details
Accession A0A1B9H3P7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-91DIVDGTKRQRKKGRNVEDDEGRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-82MRRPRKRGGSDIVDGTKRQRKKGR
168-233RRDREMAIEKREAARLREERFAEMDRERERERRSYGRSPRDYSPPRRRRGSPMYDAPPPRDRDRER
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.5, cyto 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MIVTVRAGPIDDEIERSAAPNAASETATEIEITTVSDVTDDIEKTRPRRNDEKDIVEGMRRPRKRGGSDIVDGTKRQRKKGRNVEDDEGRRNVSVSVIKSEGVFLRIVNENVNVIMGANQGEIANVRCQIDDGNLEICPSSSHRPRDDAGIPSIKEMSREEKEAERERRDREMAIEKREAARLREERFAEMDRERERERRSYGRSPRDYSPPRRRRGSPMYDAPPPRDRDRERARSRDPATALLDEVDSESRSILVTQLSAKMTSQDLGMFFEDKLGRGAIRDARVVMDKVSRRSKGIGYVELDAVELVSRAVALSGTLVMGLPISIMPSEAERNRDGPVQSAPDAAIPYHRLYISNIAFSLSADDLRQVFEPFGELEFVDLHVDFSGMRKGTAYVQFKTLASAQMALDAMANFELAGRPIRVQTVQERAYVANEQIEDNGNYGTRLDATQRQQLMFKLARTEPTVNLALSKSPAMNPTTFLVVNNMFNPDEETERNWDLDLAEDVKTEVETKYGKVKRIKVDKMSAGEVYIEFDNLNGAGTALRGLNGRFFGGRQLQASYISETLFKAHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.15
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.14
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.2
30 0.25
31 0.3
32 0.39
33 0.44
34 0.48
35 0.58
36 0.65
37 0.69
38 0.72
39 0.74
40 0.7
41 0.68
42 0.63
43 0.56
44 0.53
45 0.51
46 0.53
47 0.49
48 0.49
49 0.53
50 0.6
51 0.61
52 0.65
53 0.64
54 0.62
55 0.63
56 0.65
57 0.62
58 0.55
59 0.5
60 0.5
61 0.49
62 0.46
63 0.5
64 0.53
65 0.57
66 0.66
67 0.76
68 0.8
69 0.82
70 0.84
71 0.83
72 0.83
73 0.8
74 0.74
75 0.65
76 0.56
77 0.45
78 0.39
79 0.31
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.22
87 0.24
88 0.21
89 0.17
90 0.15
91 0.11
92 0.14
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.1
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.12
127 0.18
128 0.24
129 0.3
130 0.33
131 0.37
132 0.37
133 0.43
134 0.43
135 0.4
136 0.38
137 0.38
138 0.35
139 0.33
140 0.35
141 0.28
142 0.26
143 0.24
144 0.25
145 0.22
146 0.24
147 0.26
148 0.28
149 0.35
150 0.42
151 0.48
152 0.49
153 0.52
154 0.53
155 0.57
156 0.54
157 0.48
158 0.44
159 0.47
160 0.44
161 0.45
162 0.43
163 0.39
164 0.39
165 0.43
166 0.4
167 0.31
168 0.35
169 0.35
170 0.36
171 0.4
172 0.39
173 0.36
174 0.37
175 0.37
176 0.32
177 0.27
178 0.3
179 0.26
180 0.29
181 0.3
182 0.34
183 0.35
184 0.37
185 0.42
186 0.44
187 0.49
188 0.55
189 0.62
190 0.66
191 0.69
192 0.67
193 0.65
194 0.68
195 0.69
196 0.69
197 0.71
198 0.7
199 0.71
200 0.72
201 0.72
202 0.71
203 0.72
204 0.7
205 0.66
206 0.65
207 0.62
208 0.63
209 0.61
210 0.57
211 0.53
212 0.49
213 0.44
214 0.45
215 0.44
216 0.47
217 0.55
218 0.61
219 0.62
220 0.66
221 0.67
222 0.67
223 0.67
224 0.63
225 0.55
226 0.48
227 0.43
228 0.35
229 0.31
230 0.22
231 0.19
232 0.13
233 0.12
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.16
277 0.21
278 0.26
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.28
283 0.3
284 0.3
285 0.28
286 0.24
287 0.25
288 0.24
289 0.21
290 0.2
291 0.13
292 0.1
293 0.06
294 0.04
295 0.03
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.02
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.05
317 0.09
318 0.1
319 0.13
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.19
324 0.19
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.2
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.16
380 0.24
381 0.27
382 0.24
383 0.27
384 0.29
385 0.28
386 0.29
387 0.25
388 0.19
389 0.15
390 0.16
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.2
412 0.26
413 0.27
414 0.28
415 0.29
416 0.27
417 0.28
418 0.27
419 0.22
420 0.17
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.11
435 0.18
436 0.22
437 0.29
438 0.31
439 0.32
440 0.33
441 0.33
442 0.37
443 0.33
444 0.31
445 0.3
446 0.29
447 0.31
448 0.34
449 0.36
450 0.29
451 0.31
452 0.32
453 0.25
454 0.26
455 0.23
456 0.19
457 0.18
458 0.18
459 0.15
460 0.14
461 0.18
462 0.19
463 0.19
464 0.2
465 0.2
466 0.22
467 0.21
468 0.2
469 0.21
470 0.2
471 0.21
472 0.2
473 0.22
474 0.18
475 0.18
476 0.21
477 0.18
478 0.2
479 0.19
480 0.21
481 0.24
482 0.26
483 0.26
484 0.23
485 0.22
486 0.18
487 0.19
488 0.19
489 0.15
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.15
500 0.25
501 0.29
502 0.37
503 0.43
504 0.51
505 0.57
506 0.67
507 0.74
508 0.72
509 0.76
510 0.75
511 0.71
512 0.66
513 0.57
514 0.47
515 0.4
516 0.31
517 0.26
518 0.19
519 0.15
520 0.11
521 0.1
522 0.11
523 0.09
524 0.09
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.08
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.14
535 0.15
536 0.17
537 0.16
538 0.16
539 0.23
540 0.28
541 0.3
542 0.28
543 0.3
544 0.29
545 0.31
546 0.33
547 0.29
548 0.24
549 0.21
550 0.21
551 0.19