Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7Z7H0

Protein Details
Accession C7Z7H0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-90EEAKDEPRKSKRKSKASLSTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-84PRKSKRKSK
263-271KAKAKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG nhe:NECHADRAFT_17606  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences KNDFLDTADSDEENDVGYNSEDEVTKGGHTAKRRKLDSDDEDDLGSDNDRDASDNEDDAAEGGADLKEDEEAKDEPRKSKRKSKASLSTELPDITKPLTKKNLVASEAAIKKSGVVYLSRIPPFMKPAKLRSLLEPYGTINRIFLAPEDPASHARRVRAGGNKKRSYTEGWVEFVNKKEAKTVCELLNARTIGGKKGSYYRDDLWNLLYLKGFKWHNLTEQIATENAERTSRMRAEISKTTRENKEFVRNVEKAKMLDGMEAKAKAKKRKAGAEEQGEDEVRQVKRSFKQVPLAKKRTEVEEQPAEVARVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.17
15 0.2
16 0.29
17 0.38
18 0.46
19 0.54
20 0.57
21 0.6
22 0.62
23 0.67
24 0.65
25 0.64
26 0.59
27 0.51
28 0.48
29 0.43
30 0.37
31 0.27
32 0.21
33 0.12
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.07
48 0.05
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.09
58 0.1
59 0.14
60 0.22
61 0.25
62 0.31
63 0.41
64 0.5
65 0.54
66 0.64
67 0.71
68 0.74
69 0.79
70 0.82
71 0.82
72 0.79
73 0.79
74 0.73
75 0.65
76 0.56
77 0.48
78 0.39
79 0.28
80 0.23
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.2
85 0.26
86 0.27
87 0.3
88 0.36
89 0.41
90 0.38
91 0.38
92 0.33
93 0.34
94 0.35
95 0.33
96 0.26
97 0.2
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.11
102 0.08
103 0.11
104 0.15
105 0.21
106 0.21
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.26
111 0.28
112 0.29
113 0.27
114 0.31
115 0.38
116 0.41
117 0.42
118 0.4
119 0.43
120 0.37
121 0.35
122 0.31
123 0.25
124 0.24
125 0.24
126 0.2
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.21
144 0.24
145 0.29
146 0.37
147 0.43
148 0.52
149 0.55
150 0.54
151 0.54
152 0.52
153 0.47
154 0.42
155 0.4
156 0.32
157 0.29
158 0.28
159 0.29
160 0.28
161 0.26
162 0.27
163 0.22
164 0.19
165 0.24
166 0.25
167 0.25
168 0.27
169 0.29
170 0.23
171 0.29
172 0.29
173 0.25
174 0.29
175 0.27
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.13
183 0.2
184 0.22
185 0.22
186 0.26
187 0.27
188 0.32
189 0.33
190 0.32
191 0.27
192 0.29
193 0.27
194 0.24
195 0.22
196 0.16
197 0.15
198 0.2
199 0.2
200 0.17
201 0.21
202 0.22
203 0.25
204 0.29
205 0.3
206 0.26
207 0.26
208 0.25
209 0.21
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.18
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.23
222 0.29
223 0.37
224 0.41
225 0.43
226 0.46
227 0.51
228 0.55
229 0.54
230 0.51
231 0.48
232 0.53
233 0.5
234 0.51
235 0.53
236 0.49
237 0.5
238 0.51
239 0.49
240 0.38
241 0.36
242 0.34
243 0.26
244 0.27
245 0.25
246 0.22
247 0.23
248 0.24
249 0.24
250 0.26
251 0.32
252 0.38
253 0.44
254 0.5
255 0.53
256 0.61
257 0.67
258 0.72
259 0.75
260 0.75
261 0.7
262 0.65
263 0.6
264 0.51
265 0.44
266 0.35
267 0.32
268 0.24
269 0.25
270 0.24
271 0.29
272 0.34
273 0.43
274 0.48
275 0.48
276 0.57
277 0.6
278 0.69
279 0.73
280 0.75
281 0.69
282 0.69
283 0.66
284 0.63
285 0.63
286 0.57
287 0.55
288 0.55
289 0.53
290 0.49
291 0.47
292 0.41
293 0.34
294 0.29
295 0.21