FuNGI

A0A1B9GQF6

Protein Details

Accession

A0A1B9GQF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MSDNAFFLRKRKDKDRRNRVASTSAS	Hydrophilic
189-210	GGNRAGSKKKMKKGTKEVFHQD	Basic
693-716	GPSEQPRPGKKSKKGSSTPTPGPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-16	KRKDKDR
192-202	RAGSKKKMKKG
455-465	RKLKKIIRRRR
648-658	PGARPKSGKRK
680-707	SKRKNSPAPSASAGPSEQPRPGKKSKKG

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSDNAFFLRKRKDKDRRNRVASTSASASARAGPSGTAGASNAPSPASSSSKPSQSKHSASSGTPVKTEPSSDGSNAKKANLTEIKIFSSAPNTGLRFNIMRLNTGQGSMGRDVDPTEISQPVLMNRKRPGPKAPPLFATDGEGKIIGKYVYDSAGKPVLDSEGKPVIERKAEGMDMSLVGSAPDGTGGGGNRAGSKKKMKKGTKEVFHQDIEIMRLRREEAVPWVLESGRPKEKSAVPEHWVGRMQEPSALPTVLLVNDGTTEGFEMVPLGRTYRFDPERPFKALDSDAANKLYEHQAKHKIHDRWALRPEGSNNVVHADSIASGIKPERDLEQRAMRMEVGIRVRRGMDIDRKPKVERYEDDYKREGRRAERGLEGGIDEELDFDEAEEFQDDDEVNTFYRNAEEEDAAREAEEQQKKEYRLANANVGDRPQIASDDDEDDLFGEKKVLDDEGRKLKKIIRRRREDGMDEGDFSDDDETDESEAETVDSKAEDKEKEKGKDKEMDKEGKLTTNGTEDRPSRPSSRGPGGRVTSSPAGRRPNGLPTGKASTAPPGSGAALLAQRAASRGASPRPPSVGRAGSPLSGRAASPDAASGRAASPPMRGSSPVSVRGASPAPGAGVARGSSPGSAPPTRDASPAPSASGSGPGARPKSGKRKTTSESPGPSAGGLNSAQPSPSSKRKNSPAPSASAGPSEQPRPGKKSKKGSSTPTPGPEEIPSFPGMITKQDVLDWFKRSNKDTIPMSEAIAAFRGRIMNAGKNRETNQKLFLTWMKMLADQEEKMLRLKPEYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.89
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.83
7	0.8
8	0.73
9	0.67
10	0.6
11	0.53
12	0.45
13	0.38
14	0.33
15	0.3
16	0.27
17	0.22
18	0.18
19	0.14
20	0.15
21	0.16
22	0.15
23	0.11
24	0.1
25	0.12
26	0.13
27	0.13
28	0.12
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.16
33	0.2
34	0.2
35	0.27
36	0.32
37	0.41
38	0.47
39	0.47
40	0.53
41	0.56
42	0.6
43	0.58
44	0.6
45	0.54
46	0.49
47	0.55
48	0.53
49	0.45
50	0.41
51	0.37
52	0.34
53	0.31
54	0.32
55	0.27
56	0.25
57	0.26
58	0.27
59	0.33
60	0.33
61	0.39
62	0.38
63	0.36
64	0.35
65	0.32
66	0.39
67	0.39
68	0.39
69	0.38
70	0.39
71	0.4
72	0.37
73	0.38
74	0.29
75	0.27
76	0.25
77	0.21
78	0.24
79	0.23
80	0.24
81	0.24
82	0.26
83	0.23
84	0.24
85	0.28
86	0.23
87	0.24
88	0.24
89	0.28
90	0.25
91	0.25
92	0.24
93	0.2
94	0.23
95	0.22
96	0.22
97	0.17
98	0.17
99	0.17
100	0.17
101	0.16
102	0.14
103	0.15
104	0.14
105	0.13
106	0.14
107	0.14
108	0.18
109	0.27
110	0.28
111	0.31
112	0.35
113	0.44
114	0.49
115	0.53
116	0.57
117	0.57
118	0.65
119	0.68
120	0.68
121	0.62
122	0.6
123	0.58
124	0.49
125	0.44
126	0.37
127	0.28
128	0.25
129	0.22
130	0.18
131	0.15
132	0.16
133	0.12
134	0.08
135	0.09
136	0.1
137	0.13
138	0.14
139	0.15
140	0.17
141	0.21
142	0.21
143	0.19
144	0.18
145	0.19
146	0.19
147	0.19
148	0.21
149	0.22
150	0.23
151	0.23
152	0.26
153	0.26
154	0.27
155	0.27
156	0.24
157	0.21
158	0.22
159	0.21
160	0.19
161	0.16
162	0.13
163	0.13
164	0.11
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.05
174	0.06
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.12
179	0.15
180	0.18
181	0.22
182	0.32
183	0.4
184	0.47
185	0.58
186	0.63
187	0.7
188	0.79
189	0.83
190	0.81
191	0.81
192	0.8
193	0.75
194	0.67
195	0.57
196	0.47
197	0.39
198	0.33
199	0.3
200	0.24
201	0.19
202	0.2
203	0.2
204	0.21
205	0.21
206	0.19
207	0.19
208	0.22
209	0.21
210	0.21
211	0.21
212	0.18
213	0.19
214	0.21
215	0.22
216	0.26
217	0.27
218	0.28
219	0.32
220	0.36
221	0.41
222	0.44
223	0.44
224	0.39
225	0.45
226	0.44
227	0.42
228	0.41
229	0.35
230	0.31
231	0.27
232	0.24
233	0.21
234	0.21
235	0.2
236	0.18
237	0.17
238	0.14
239	0.12
240	0.13
241	0.09
242	0.09
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.08
259	0.1
260	0.12
261	0.2
262	0.23
263	0.25
264	0.33
265	0.39
266	0.43
267	0.45
268	0.45
269	0.37
270	0.37
271	0.35
272	0.29
273	0.26
274	0.25
275	0.23
276	0.23
277	0.22
278	0.18
279	0.2
280	0.24
281	0.23
282	0.21
283	0.26
284	0.35
285	0.37
286	0.42
287	0.49
288	0.46
289	0.47
290	0.53
291	0.5
292	0.47
293	0.5
294	0.49
295	0.41
296	0.4
297	0.36
298	0.34
299	0.33
300	0.26
301	0.22
302	0.2
303	0.19
304	0.16
305	0.14
306	0.09
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.11
317	0.14
318	0.17
319	0.21
320	0.26
321	0.28
322	0.28
323	0.28
324	0.24
325	0.21
326	0.19
327	0.19
328	0.19
329	0.2
330	0.19
331	0.19
332	0.19
333	0.19
334	0.2
335	0.2
336	0.24
337	0.3
338	0.37
339	0.4
340	0.42
341	0.43
342	0.46
343	0.46
344	0.43
345	0.37
346	0.37
347	0.44
348	0.45
349	0.48
350	0.47
351	0.47
352	0.44
353	0.45
354	0.41
355	0.34
356	0.38
357	0.37
358	0.37
359	0.33
360	0.31
361	0.28
362	0.24
363	0.21
364	0.13
365	0.1
366	0.07
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.11
396	0.1
397	0.09
398	0.08
399	0.08
400	0.16
401	0.19
402	0.18
403	0.21
404	0.26
405	0.27
406	0.31
407	0.33
408	0.29
409	0.33
410	0.34
411	0.36
412	0.34
413	0.35
414	0.31
415	0.28
416	0.25
417	0.18
418	0.17
419	0.11
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.1
439	0.16
440	0.25
441	0.27
442	0.28
443	0.29
444	0.32
445	0.38
446	0.46
447	0.51
448	0.52
449	0.59
450	0.63
451	0.69
452	0.7
453	0.66
454	0.61
455	0.56
456	0.46
457	0.38
458	0.34
459	0.26
460	0.2
461	0.17
462	0.12
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.07
479	0.11
480	0.13
481	0.14
482	0.22
483	0.29
484	0.35
485	0.43
486	0.47
487	0.49
488	0.55
489	0.55
490	0.57
491	0.56
492	0.57
493	0.49
494	0.49
495	0.45
496	0.39
497	0.38
498	0.29
499	0.23
500	0.22
501	0.23
502	0.2
503	0.24
504	0.23
505	0.26
506	0.28
507	0.31
508	0.28
509	0.3
510	0.33
511	0.34
512	0.41
513	0.42
514	0.42
515	0.45
516	0.45
517	0.43
518	0.39
519	0.38
520	0.34
521	0.31
522	0.32
523	0.31
524	0.34
525	0.33
526	0.36
527	0.33
528	0.36
529	0.41
530	0.39
531	0.35
532	0.33
533	0.38
534	0.35
535	0.34
536	0.27
537	0.25
538	0.24
539	0.23
540	0.19
541	0.14
542	0.14
543	0.13
544	0.13
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.08
549	0.08
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.07
554	0.09
555	0.13
556	0.18
557	0.24
558	0.27
559	0.29
560	0.33
561	0.33
562	0.34
563	0.36
564	0.35
565	0.29
566	0.31
567	0.29
568	0.27
569	0.26
570	0.25
571	0.21
572	0.17
573	0.16
574	0.14
575	0.15
576	0.13
577	0.13
578	0.14
579	0.13
580	0.13
581	0.13
582	0.12
583	0.11
584	0.12
585	0.13
586	0.11
587	0.13
588	0.14
589	0.16
590	0.16
591	0.17
592	0.19
593	0.25
594	0.28
595	0.31
596	0.3
597	0.29
598	0.28
599	0.3
600	0.28
601	0.21
602	0.18
603	0.13
604	0.11
605	0.12
606	0.12
607	0.09
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.12
616	0.16
617	0.18
618	0.19
619	0.22
620	0.27
621	0.28
622	0.29
623	0.27
624	0.27
625	0.31
626	0.3
627	0.28
628	0.23
629	0.22
630	0.21
631	0.23
632	0.18
633	0.15
634	0.17
635	0.21
636	0.23
637	0.24
638	0.28
639	0.33
640	0.43
641	0.5
642	0.56
643	0.56
644	0.63
645	0.66
646	0.73
647	0.73
648	0.71
649	0.68
650	0.63
651	0.59
652	0.51
653	0.46
654	0.36
655	0.28
656	0.21
657	0.16
658	0.14
659	0.14
660	0.13
661	0.13
662	0.13
663	0.18
664	0.22
665	0.32
666	0.38
667	0.44
668	0.53
669	0.61
670	0.71
671	0.73
672	0.77
673	0.72
674	0.68
675	0.66
676	0.6
677	0.53
678	0.45
679	0.38
680	0.32
681	0.31
682	0.29
683	0.3
684	0.34
685	0.39
686	0.44
687	0.54
688	0.6
689	0.65
690	0.73
691	0.77
692	0.8
693	0.82
694	0.83
695	0.83
696	0.82
697	0.8
698	0.76
699	0.73
700	0.63
701	0.57
702	0.52
703	0.45
704	0.38
705	0.33
706	0.27
707	0.22
708	0.21
709	0.22
710	0.19
711	0.19
712	0.2
713	0.19
714	0.18
715	0.19
716	0.23
717	0.26
718	0.31
719	0.32
720	0.34
721	0.39
722	0.45
723	0.47
724	0.51
725	0.49
726	0.52
727	0.53
728	0.53
729	0.52
730	0.47
731	0.45
732	0.41
733	0.36
734	0.29
735	0.27
736	0.21
737	0.16
738	0.17
739	0.17
740	0.12
741	0.17
742	0.2
743	0.26
744	0.33
745	0.42
746	0.44
747	0.48
748	0.52
749	0.58
750	0.6
751	0.55
752	0.54
753	0.49
754	0.46
755	0.46
756	0.47
757	0.43
758	0.38
759	0.38
760	0.33
761	0.33
762	0.33
763	0.32
764	0.31
765	0.25
766	0.29
767	0.28
768	0.28
769	0.28
770	0.32
771	0.29

A0A1B9GQF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer