FuNGI

A0A1B9H1X6

Protein Details

Accession

A0A1B9H1X6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-117	GVQKLKFKPKVPIRRVKQEPDVK	Hydrophilic
232-259	QGKAKGKPGKEEKDRKNKGKKKATQGGA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
98-112	KLKFKPKVPIRRVKQ
125-146	APAVRGGMRGRGRGGPNRGRGR
230-254	LNQGKAKGKPGKEEKDRKNKGKKKA

Subcellular Location(s)

mito 24, cyto_mito 13.833, mito_nucl 12.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSNPPRRGKPSLIAAAQAQAQAQAQAQASTSASASGSALPPNLASVPMSATDSATTVSDGSGGGRSVSARSTPAPGTSTGPGSRGGEGSVPPPGGVQKLKFKPKVPIRRVKQEPDVKPDISQAPAPAVRGGMRGRGRGGPNRGRGRGTVVSTSIAAGVFGGPRPAASSSSSRRFAAAPAPAPRNFDDTYAEVYSDHSDEEGTMGGRPIDIDMVSTMSESAPTSLYRDRRLNQGKAKGKPGKEEKDRKNKGKKKATQGGAGAGEAMDVDQPETSTSASGAFNVKAEPISPEKQPRQLREDDAMLSDDENQDRDERGRRVRSFAATGGVEEPVRGGDDDDDEEVNEAQKVDLSESEEEEEEEDMEGDFVQAEGYDNPEEKLFIFQFPNLFPKFAPSDPVDLTQEVKPDPAASAPSAGAGAGASSTQADVKPDIKPTAAQLRASQGKKAQAEPLPEGRVGTMVVMKSGKVKMVMGKDIVMNVTPGLPATFIQHLVHLDAKSKSAQILGEVHKNYVVTPDIDRLLQELYINGGKTPGEIETERRRRIILEKGLVPMKKERD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.45
3	0.4
4	0.33
5	0.24
6	0.17
7	0.16
8	0.14
9	0.14
10	0.15
11	0.14
12	0.14
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.15
17	0.14
18	0.11
19	0.1
20	0.1
21	0.11
22	0.11
23	0.12
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.12
28	0.14
29	0.13
30	0.11
31	0.1
32	0.1
33	0.11
34	0.12
35	0.13
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.1
43	0.09
44	0.08
45	0.08
46	0.07
47	0.08
48	0.09
49	0.09
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.1
54	0.12
55	0.12
56	0.13
57	0.15
58	0.19
59	0.19
60	0.21
61	0.22
62	0.22
63	0.24
64	0.24
65	0.27
66	0.24
67	0.23
68	0.24
69	0.24
70	0.23
71	0.2
72	0.18
73	0.16
74	0.16
75	0.16
76	0.17
77	0.15
78	0.14
79	0.14
80	0.15
81	0.17
82	0.2
83	0.22
84	0.29
85	0.38
86	0.48
87	0.53
88	0.55
89	0.61
90	0.68
91	0.75
92	0.75
93	0.77
94	0.75
95	0.8
96	0.85
97	0.81
98	0.81
99	0.8
100	0.75
101	0.73
102	0.71
103	0.61
104	0.54
105	0.51
106	0.43
107	0.35
108	0.31
109	0.23
110	0.22
111	0.22
112	0.22
113	0.18
114	0.17
115	0.15
116	0.18
117	0.18
118	0.21
119	0.23
120	0.24
121	0.26
122	0.31
123	0.35
124	0.39
125	0.47
126	0.48
127	0.54
128	0.6
129	0.61
130	0.56
131	0.52
132	0.52
133	0.48
134	0.42
135	0.35
136	0.28
137	0.27
138	0.25
139	0.24
140	0.17
141	0.12
142	0.09
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.05
149	0.06
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.12
154	0.18
155	0.24
156	0.31
157	0.34
158	0.33
159	0.33
160	0.32
161	0.31
162	0.3
163	0.28
164	0.26
165	0.3
166	0.34
167	0.34
168	0.36
169	0.36
170	0.35
171	0.31
172	0.27
173	0.24
174	0.21
175	0.24
176	0.21
177	0.2
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.14
182	0.12
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.06
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.09
210	0.14
211	0.17
212	0.22
213	0.27
214	0.27
215	0.37
216	0.44
217	0.48
218	0.51
219	0.58
220	0.6
221	0.59
222	0.67
223	0.63
224	0.57
225	0.59
226	0.61
227	0.6
228	0.63
229	0.69
230	0.69
231	0.74
232	0.81
233	0.82
234	0.85
235	0.83
236	0.84
237	0.84
238	0.82
239	0.81
240	0.82
241	0.76
242	0.69
243	0.62
244	0.55
245	0.45
246	0.37
247	0.26
248	0.17
249	0.13
250	0.07
251	0.06
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.11
274	0.13
275	0.16
276	0.23
277	0.25
278	0.34
279	0.38
280	0.4
281	0.41
282	0.43
283	0.43
284	0.38
285	0.38
286	0.3
287	0.26
288	0.22
289	0.17
290	0.14
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.12
299	0.16
300	0.2
301	0.27
302	0.34
303	0.35
304	0.39
305	0.41
306	0.41
307	0.37
308	0.33
309	0.29
310	0.21
311	0.21
312	0.17
313	0.15
314	0.12
315	0.1
316	0.09
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.1
338	0.1
339	0.11
340	0.12
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.1
345	0.08
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.13
366	0.12
367	0.13
368	0.14
369	0.15
370	0.17
371	0.18
372	0.24
373	0.21
374	0.21
375	0.18
376	0.21
377	0.23
378	0.22
379	0.24
380	0.2
381	0.23
382	0.24
383	0.26
384	0.24
385	0.21
386	0.23
387	0.21
388	0.21
389	0.17
390	0.16
391	0.14
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.1
401	0.09
402	0.08
403	0.06
404	0.05
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.04
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.1
414	0.12
415	0.15
416	0.18
417	0.2
418	0.19
419	0.2
420	0.23
421	0.3
422	0.31
423	0.3
424	0.28
425	0.35
426	0.42
427	0.43
428	0.42
429	0.37
430	0.41
431	0.42
432	0.43
433	0.42
434	0.38
435	0.42
436	0.43
437	0.45
438	0.4
439	0.37
440	0.35
441	0.28
442	0.24
443	0.2
444	0.15
445	0.13
446	0.1
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.16
451	0.17
452	0.18
453	0.16
454	0.18
455	0.21
456	0.26
457	0.29
458	0.26
459	0.27
460	0.26
461	0.25
462	0.24
463	0.19
464	0.14
465	0.11
466	0.1
467	0.09
468	0.08
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.1
473	0.12
474	0.13
475	0.14
476	0.16
477	0.16
478	0.18
479	0.22
480	0.19
481	0.22
482	0.21
483	0.23
484	0.23
485	0.23
486	0.21
487	0.19
488	0.19
489	0.17
490	0.24
491	0.26
492	0.33
493	0.33
494	0.33
495	0.32
496	0.32
497	0.28
498	0.25
499	0.22
500	0.16
501	0.18
502	0.21
503	0.21
504	0.22
505	0.22
506	0.19
507	0.18
508	0.17
509	0.15
510	0.11
511	0.14
512	0.17
513	0.17
514	0.15
515	0.15
516	0.15
517	0.15
518	0.16
519	0.13
520	0.14
521	0.16
522	0.23
523	0.33
524	0.43
525	0.46
526	0.46
527	0.46
528	0.45
529	0.5
530	0.52
531	0.51
532	0.5
533	0.49
534	0.54
535	0.6
536	0.58
537	0.55

A0A1B9H1X6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer