Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9H0F6

Protein Details
Accession A0A1B9H0F6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-152QEAIKMKRELRKKRQEEYKKNLEKNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-116KGKKR
130-141IKMKRELRKKRQ
244-264RTVKGWKPRKLGGGLGGRPKP
284-311GRGGFRGGFRGGPPRGGGFGGGRGGFGG
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 8.5, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034143  snRNP70_RRM  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12236  RRM_snRNP70  
Amino Acid Sequences MSHLLPPNLLRLFAPRPQPPFLKPLTKDERVRGPNKLQGVAELVTRLREEAEDAEVRQGMDAGDDQQQQDKPQTSTADEENVLEGGSKLNGAEGEDGEVKPQASDEKKAVTKGKKRDIVKEMGLIGQEAIKMKRELRKKRQEEYKKNLEKNYKPNDDPNAVGDPYKTLFISRLSKKATEVDLRREFEMYGAIERIRIVKDRKGKSKSYAFIVYERERDMKAAYKDAEGIPIHHKKILVDVERGRTVKGWKPRKLGGGLGGRPKPVNPDAAPVIPAFGAGGGFGGRGGFRGGFRGGPPRGGGFGGGRGGFGGGRGGFGGGGGGGFQDRGGFGGGGRGGFGGGGGGGGFGGRGGFQGGGGDRGYGGGAPGGYGGGGGGGGGYGGGAGGGGYGGPPGPGGGYQSNGYGQGPPGGGGGGFGKRDYDSAGAGGGGYGGGAGGGGGGYGGGGGAGGSYDDRDSKRMRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.44
4 0.5
5 0.54
6 0.51
7 0.53
8 0.54
9 0.56
10 0.52
11 0.57
12 0.6
13 0.64
14 0.66
15 0.65
16 0.69
17 0.68
18 0.69
19 0.67
20 0.65
21 0.63
22 0.61
23 0.59
24 0.48
25 0.42
26 0.41
27 0.34
28 0.28
29 0.24
30 0.2
31 0.17
32 0.17
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.12
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.21
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.15
51 0.17
52 0.18
53 0.22
54 0.24
55 0.25
56 0.3
57 0.32
58 0.28
59 0.31
60 0.33
61 0.3
62 0.32
63 0.32
64 0.3
65 0.26
66 0.25
67 0.21
68 0.18
69 0.16
70 0.12
71 0.11
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.16
90 0.16
91 0.2
92 0.21
93 0.27
94 0.29
95 0.34
96 0.42
97 0.45
98 0.51
99 0.57
100 0.65
101 0.66
102 0.67
103 0.71
104 0.7
105 0.67
106 0.61
107 0.54
108 0.46
109 0.39
110 0.36
111 0.27
112 0.2
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.19
120 0.26
121 0.35
122 0.44
123 0.53
124 0.64
125 0.68
126 0.76
127 0.82
128 0.87
129 0.88
130 0.86
131 0.86
132 0.84
133 0.82
134 0.8
135 0.78
136 0.75
137 0.74
138 0.75
139 0.7
140 0.63
141 0.64
142 0.62
143 0.55
144 0.48
145 0.41
146 0.35
147 0.29
148 0.27
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.12
154 0.08
155 0.09
156 0.14
157 0.22
158 0.24
159 0.29
160 0.31
161 0.32
162 0.33
163 0.35
164 0.35
165 0.35
166 0.36
167 0.39
168 0.43
169 0.44
170 0.43
171 0.39
172 0.35
173 0.27
174 0.25
175 0.17
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.14
184 0.16
185 0.21
186 0.3
187 0.37
188 0.46
189 0.5
190 0.52
191 0.54
192 0.59
193 0.56
194 0.51
195 0.49
196 0.41
197 0.39
198 0.41
199 0.37
200 0.3
201 0.29
202 0.26
203 0.21
204 0.21
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.19
212 0.19
213 0.22
214 0.15
215 0.16
216 0.2
217 0.23
218 0.23
219 0.23
220 0.23
221 0.19
222 0.24
223 0.28
224 0.24
225 0.24
226 0.27
227 0.29
228 0.32
229 0.32
230 0.28
231 0.24
232 0.25
233 0.25
234 0.32
235 0.39
236 0.41
237 0.46
238 0.49
239 0.52
240 0.5
241 0.46
242 0.44
243 0.41
244 0.39
245 0.41
246 0.39
247 0.35
248 0.33
249 0.32
250 0.29
251 0.23
252 0.24
253 0.18
254 0.21
255 0.22
256 0.22
257 0.23
258 0.18
259 0.17
260 0.12
261 0.11
262 0.07
263 0.05
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.07
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.05
383 0.09
384 0.1
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.16
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.16
408 0.15
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.07
416 0.05
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.02
427 0.02
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.03
437 0.04
438 0.05
439 0.07
440 0.12
441 0.14
442 0.2