FuNGI

A0A1B9GPH6

Protein Details

Accession

A0A1B9GPH6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
172-196	RAGREKQYKLRQKVLKKNPTLRMLH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005607 BSD_dom IPR035925 BSD_dom_sf IPR011993 PH-like_dom_sf IPR027079 Tfb1/GTF2H1 IPR013876 TFIIH_BTF_p62_N
Gene Ontology	GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
Pfam	View protein in Pfam PF03909 BSD PF08567 PH_TFIIH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50858 BSD
CDD	cd13229 PH_TFIIH

Amino Acid Sequences

MASAGEGSDIRRFDVDFKKVPGTLTVTGTHIAWVPKQKEAMDRQNQAMNRAINMLASKAGSKSVSLKILFKDDIPSGGLLLVFSNPSTRENDRKAVQDILIPFVAANKNPPTGGTSSGPATPSATVPAAAVPSTNAAAAVMSANAKGKRKAEGSSPSATPGVSTPNLPPAVRAGREKQYKLRQKVLKKNPTLRMLHRELVLGKQITEEEFWDGREALIQAEEMAYAQKPGRASRLLDDRFDLDAGRKGKSTGGTGVGIKTAENGPVILKLSKELTREIFEEFPVVQDAYARYVPGISETEFWSRYFTSQLWERHRASVRKSAVDESSRKKDDIFDQYLEEPDWNIQPRQAQPDDVERYLDLAATEEDHGESITVRDVTMQAGRERSALPLIRRFNDHSKKLLRALLGSVSDPFFFPIRRRGIDLYNEIDLEDLHGPAKETTITLDVQNAADMADKQGNEGPTGVLPGRSEEELRSIASESTSKLSTFTPDFSSVCLPNPGTTQIDADGNPEPHPAHKAFAVQRDAQAAALLVVKDLHTRANAETAVNAPIPDEIFEQMRSCHNAATEFLRQYWSAILPSQPGALNSSASAKESKAVKMAGYLKNTNAKVEAIVQSGMIMGFDPERIRKSMAPTIAAVDVALAREAKRTTQAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.37
3	0.38
4	0.42
5	0.46
6	0.46
7	0.46
8	0.43
9	0.4
10	0.36
11	0.34
12	0.31
13	0.28
14	0.28
15	0.27
16	0.23
17	0.21
18	0.19
19	0.21
20	0.28
21	0.29
22	0.32
23	0.35
24	0.37
25	0.42
26	0.5
27	0.56
28	0.56
29	0.58
30	0.58
31	0.61
32	0.6
33	0.54
34	0.52
35	0.43
36	0.34
37	0.31
38	0.28
39	0.23
40	0.22
41	0.2
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.13
46	0.15
47	0.14
48	0.15
49	0.19
50	0.22
51	0.28
52	0.29
53	0.32
54	0.32
55	0.37
56	0.37
57	0.32
58	0.32
59	0.26
60	0.26
61	0.23
62	0.21
63	0.15
64	0.15
65	0.14
66	0.1
67	0.09
68	0.08
69	0.07
70	0.07
71	0.09
72	0.1
73	0.12
74	0.17
75	0.22
76	0.3
77	0.35
78	0.42
79	0.44
80	0.47
81	0.48
82	0.47
83	0.42
84	0.38
85	0.34
86	0.31
87	0.27
88	0.22
89	0.18
90	0.19
91	0.21
92	0.16
93	0.2
94	0.2
95	0.21
96	0.21
97	0.22
98	0.21
99	0.21
100	0.25
101	0.21
102	0.2
103	0.21
104	0.23
105	0.23
106	0.19
107	0.19
108	0.16
109	0.14
110	0.15
111	0.14
112	0.12
113	0.11
114	0.12
115	0.11
116	0.1
117	0.1
118	0.07
119	0.08
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.05
128	0.05
129	0.06
130	0.11
131	0.15
132	0.18
133	0.22
134	0.24
135	0.29
136	0.31
137	0.33
138	0.36
139	0.4
140	0.42
141	0.42
142	0.41
143	0.37
144	0.35
145	0.32
146	0.25
147	0.18
148	0.18
149	0.14
150	0.15
151	0.14
152	0.2
153	0.23
154	0.22
155	0.21
156	0.22
157	0.26
158	0.28
159	0.31
160	0.3
161	0.37
162	0.44
163	0.48
164	0.51
165	0.56
166	0.64
167	0.66
168	0.7
169	0.7
170	0.73
171	0.8
172	0.82
173	0.81
174	0.8
175	0.83
176	0.81
177	0.81
178	0.76
179	0.71
180	0.69
181	0.64
182	0.58
183	0.49
184	0.43
185	0.36
186	0.33
187	0.32
188	0.24
189	0.19
190	0.17
191	0.16
192	0.15
193	0.15
194	0.13
195	0.12
196	0.12
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.13
202	0.12
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.1
216	0.11
217	0.15
218	0.17
219	0.18
220	0.22
221	0.32
222	0.32
223	0.31
224	0.31
225	0.29
226	0.28
227	0.26
228	0.21
229	0.13
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.16
234	0.15
235	0.17
236	0.19
237	0.19
238	0.15
239	0.16
240	0.17
241	0.17
242	0.17
243	0.15
244	0.14
245	0.11
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.12
258	0.14
259	0.15
260	0.16
261	0.17
262	0.18
263	0.19
264	0.2
265	0.18
266	0.15
267	0.15
268	0.13
269	0.12
270	0.1
271	0.09
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.07
284	0.09
285	0.11
286	0.13
287	0.14
288	0.14
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.14
293	0.12
294	0.13
295	0.19
296	0.26
297	0.3
298	0.36
299	0.37
300	0.41
301	0.47
302	0.47
303	0.45
304	0.46
305	0.42
306	0.39
307	0.39
308	0.35
309	0.32
310	0.33
311	0.34
312	0.31
313	0.36
314	0.35
315	0.33
316	0.31
317	0.31
318	0.32
319	0.35
320	0.33
321	0.27
322	0.27
323	0.27
324	0.28
325	0.25
326	0.19
327	0.12
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.14
334	0.16
335	0.22
336	0.22
337	0.21
338	0.2
339	0.28
340	0.31
341	0.27
342	0.26
343	0.19
344	0.2
345	0.19
346	0.17
347	0.09
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.09
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.16
374	0.17
375	0.18
376	0.24
377	0.27
378	0.27
379	0.3
380	0.33
381	0.39
382	0.45
383	0.45
384	0.45
385	0.46
386	0.48
387	0.48
388	0.46
389	0.37
390	0.29
391	0.28
392	0.23
393	0.2
394	0.17
395	0.15
396	0.13
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.09
401	0.1
402	0.12
403	0.19
404	0.23
405	0.24
406	0.27
407	0.29
408	0.32
409	0.36
410	0.38
411	0.32
412	0.28
413	0.27
414	0.23
415	0.21
416	0.16
417	0.13
418	0.1
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.09
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.14
444	0.15
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.1
449	0.12
450	0.11
451	0.09
452	0.09
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.12
458	0.15
459	0.15
460	0.15
461	0.14
462	0.13
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.11
467	0.13
468	0.14
469	0.13
470	0.13
471	0.13
472	0.16
473	0.17
474	0.18
475	0.19
476	0.21
477	0.21
478	0.21
479	0.25
480	0.22
481	0.21
482	0.23
483	0.19
484	0.18
485	0.19
486	0.21
487	0.19
488	0.18
489	0.18
490	0.16
491	0.17
492	0.16
493	0.17
494	0.18
495	0.17
496	0.17
497	0.18
498	0.17
499	0.17
500	0.22
501	0.2
502	0.18
503	0.18
504	0.25
505	0.27
506	0.34
507	0.37
508	0.34
509	0.35
510	0.36
511	0.34
512	0.27
513	0.23
514	0.16
515	0.12
516	0.12
517	0.1
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.1
522	0.11
523	0.12
524	0.11
525	0.13
526	0.14
527	0.18
528	0.18
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.18
533	0.16
534	0.15
535	0.11
536	0.11
537	0.11
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.13
543	0.14
544	0.15
545	0.19
546	0.22
547	0.21
548	0.21
549	0.21
550	0.22
551	0.23
552	0.27
553	0.29
554	0.26
555	0.26
556	0.27
557	0.26
558	0.25
559	0.26
560	0.22
561	0.17
562	0.17
563	0.18
564	0.18
565	0.19
566	0.2
567	0.18
568	0.17
569	0.18
570	0.17
571	0.16
572	0.15
573	0.18
574	0.17
575	0.17
576	0.18
577	0.16
578	0.2
579	0.23
580	0.24
581	0.25
582	0.25
583	0.24
584	0.29
585	0.37
586	0.38
587	0.41
588	0.42
589	0.42
590	0.49
591	0.5
592	0.44
593	0.38
594	0.32
595	0.27
596	0.3
597	0.28
598	0.22
599	0.22
600	0.19
601	0.18
602	0.17
603	0.16
604	0.1
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.09
609	0.11
610	0.15
611	0.18
612	0.21
613	0.24
614	0.27
615	0.34
616	0.4
617	0.41
618	0.4
619	0.38
620	0.38
621	0.35
622	0.31
623	0.24
624	0.17
625	0.14
626	0.11
627	0.12
628	0.1
629	0.09
630	0.14
631	0.16
632	0.17

A0A1B9GPH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer