Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9GLP4

Protein Details
Accession A0A1B9GLP4    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-349GSGTGDKKKGKKKRAAPAPEPBasic
352-380EEEEETEKPKPKKKKKNADKDKDKDKGKDBasic
389-416GSGSGKKGSKDKDKDKNKDEKEDNHKKEBasic
436-506TGPTTTTTKKKKAGTKQQNDADKDKDKDKDTDKKDKEIKKEDKEKEKDTTAAPKKKVAKKKKDDTGTGGGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-428DKKKGKKKRAAPAPEPAPEEEEETEKPKPKKKKKNADKDKDKDKGKDDNQKEAGSGSGSGKKGSKDKDKDKNKDEKEDNHKKEKKVKAEGGGSAK
444-497KKKKAGTKQQNDADKDKDKDKDTDKKDKEIKKEDKEKEKDTTAAPKKKVAKKKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWESSLTVQLFPNHWRFENSPVNFPYDGPMKPFLLALRSQIIPTALIPFLYDIHPPVSFVDGCLVVEVQDHRRASAGQPDVRSRVVMRPAAGALAQTIDVMLERRGQSWDEIMALELESRIIAATSPPLYLGTSPLASRNATLALSLTCPANPNLSADGTVRSSTIRAEGESKSSLDRIKRLLRAGVVDRSAVASSSATAGPSGTGPTSTVTGTGSGVGATSTSSAAASATGTFTANWAVLRAKEKYEQIKAQRDQEAREAAARSMQAVNGMGLPGTGGGSGPDDGSGAQLNGGGAGGDGSGGVGGSGSGTGDKKKGKKKRAAPAPEPAPEEEEETEKPKPKKKKKNADKDKDKDKGKDDNQKEAGSGSGSGKKGSKDKDKDKNKDEKEDNHKKEKKVKAEGGGSAKGDGDSKETGPTTTTTKKKKAGTKQQNDADKDKDKDKDTDKKDKEIKKEDKEKEKDTTAAPKKKVAKKKKDDTGTGGGVKTKTEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.66
6 0.74
7 0.79
8 0.72
9 0.69
10 0.69
11 0.65
12 0.65
13 0.68
14 0.64
15 0.58
16 0.57
17 0.55
18 0.49
19 0.48
20 0.45
21 0.39
22 0.37
23 0.37
24 0.37
25 0.43
26 0.5
27 0.47
28 0.48
29 0.46
30 0.49
31 0.44
32 0.42
33 0.39
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.29
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.23
42 0.22
43 0.22
44 0.21
45 0.22
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.08
74 0.11
75 0.13
76 0.15
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.29
84 0.32
85 0.3
86 0.34
87 0.38
88 0.4
89 0.39
90 0.38
91 0.32
92 0.3
93 0.33
94 0.31
95 0.28
96 0.27
97 0.27
98 0.26
99 0.24
100 0.17
101 0.11
102 0.09
103 0.08
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.15
182 0.17
183 0.19
184 0.18
185 0.2
186 0.23
187 0.28
188 0.31
189 0.32
190 0.32
191 0.3
192 0.31
193 0.32
194 0.29
195 0.24
196 0.2
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.12
201 0.09
202 0.06
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.16
253 0.2
254 0.24
255 0.28
256 0.32
257 0.36
258 0.45
259 0.45
260 0.47
261 0.5
262 0.47
263 0.44
264 0.42
265 0.37
266 0.28
267 0.28
268 0.24
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.07
279 0.07
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.11
321 0.17
322 0.24
323 0.34
324 0.44
325 0.52
326 0.61
327 0.7
328 0.76
329 0.81
330 0.83
331 0.79
332 0.79
333 0.75
334 0.7
335 0.63
336 0.53
337 0.45
338 0.36
339 0.33
340 0.25
341 0.21
342 0.18
343 0.2
344 0.23
345 0.28
346 0.33
347 0.38
348 0.48
349 0.57
350 0.67
351 0.74
352 0.82
353 0.85
354 0.91
355 0.95
356 0.95
357 0.95
358 0.93
359 0.92
360 0.89
361 0.85
362 0.79
363 0.74
364 0.73
365 0.7
366 0.72
367 0.65
368 0.67
369 0.65
370 0.59
371 0.53
372 0.43
373 0.36
374 0.26
375 0.23
376 0.17
377 0.19
378 0.19
379 0.2
380 0.22
381 0.25
382 0.3
383 0.36
384 0.43
385 0.47
386 0.57
387 0.66
388 0.74
389 0.8
390 0.83
391 0.87
392 0.82
393 0.83
394 0.79
395 0.78
396 0.79
397 0.8
398 0.78
399 0.79
400 0.8
401 0.76
402 0.8
403 0.79
404 0.78
405 0.76
406 0.76
407 0.72
408 0.7
409 0.7
410 0.66
411 0.6
412 0.51
413 0.41
414 0.35
415 0.27
416 0.23
417 0.18
418 0.16
419 0.14
420 0.15
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.18
425 0.19
426 0.22
427 0.29
428 0.37
429 0.42
430 0.49
431 0.56
432 0.63
433 0.71
434 0.75
435 0.78
436 0.81
437 0.82
438 0.85
439 0.85
440 0.86
441 0.82
442 0.75
443 0.72
444 0.68
445 0.62
446 0.59
447 0.57
448 0.53
449 0.55
450 0.59
451 0.62
452 0.63
453 0.7
454 0.67
455 0.71
456 0.77
457 0.77
458 0.78
459 0.79
460 0.8
461 0.8
462 0.86
463 0.85
464 0.87
465 0.87
466 0.83
467 0.79
468 0.73
469 0.66
470 0.6
471 0.62
472 0.61
473 0.63
474 0.6
475 0.61
476 0.66
477 0.72
478 0.78
479 0.79
480 0.79
481 0.81
482 0.89
483 0.91
484 0.9
485 0.87
486 0.84
487 0.81
488 0.76
489 0.69
490 0.6
491 0.54
492 0.45
493 0.39