Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C7YHV6

Protein Details
Accession C7YHV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-470ERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSBasic
488-509PESQKTMTKKEMKKNQQAKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-462RKRQKRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 11, cyto_nucl 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG nhe:NECHADRAFT_31052  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQPQAQVPPRAFSPPQPTPSPAASQSSFALPPQKRVRTDGPPSQPESPYATSPYAASPGPTGTPPAAANSPAYAHSPALPQPYATPYTNGHTTPGLNLPDARPNSTPPIQTPHHPPMPQYTNATMTPVPVPAVAPVVAPAQGAGAMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMNELYSTGFDEARTGFAQHPPGGKGSFYGAGPANQPAQSTPDQSQEQFAAQQAERAWSESSMRLAVQRTQEIGDPFLMVATLHRRADKIAREHHLSLNLDLKNNSQTMGKMRLPEQFPYPKVNIKTAQGPDAALVQTTGSYIPHDAYLVDQLALLSIASKQRLRGLLEDAHVVATNRQKTSHGDVPEDWAPAAAPMNAEPLQPIEKPAEGADAAGVESANGEGTNPLKRSADGAGLTNGAPPVKLPKISSYMTTTMRDLARQERDWEEARLRKRQKRKDGIPDSGSTTSRAGSVAPGTPGTTAPESQKTMTKKEMKKNQQAKAAELDSHQSQNTTSSLFAGLGGKGGLFGKKKTGKTYDWMNVGRGGSGASTPTRNPSGLGKGTAGSAAAAAPVNMAMTTEGRNRLGTWREDKEKGRNIQLRDWVSVLERDGREHKALQGAYLRLDASNPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.49
4 0.47
5 0.51
6 0.52
7 0.53
8 0.51
9 0.53
10 0.51
11 0.44
12 0.42
13 0.38
14 0.36
15 0.34
16 0.33
17 0.3
18 0.26
19 0.33
20 0.28
21 0.36
22 0.44
23 0.5
24 0.5
25 0.56
26 0.61
27 0.61
28 0.69
29 0.69
30 0.69
31 0.67
32 0.69
33 0.68
34 0.62
35 0.55
36 0.53
37 0.46
38 0.39
39 0.37
40 0.33
41 0.28
42 0.28
43 0.27
44 0.23
45 0.19
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.17
52 0.14
53 0.17
54 0.16
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.18
61 0.17
62 0.19
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.21
68 0.25
69 0.24
70 0.22
71 0.22
72 0.26
73 0.29
74 0.27
75 0.27
76 0.24
77 0.28
78 0.32
79 0.3
80 0.27
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.27
85 0.24
86 0.21
87 0.23
88 0.23
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.27
93 0.29
94 0.35
95 0.37
96 0.38
97 0.32
98 0.37
99 0.36
100 0.39
101 0.44
102 0.45
103 0.48
104 0.47
105 0.45
106 0.48
107 0.51
108 0.5
109 0.45
110 0.4
111 0.37
112 0.36
113 0.38
114 0.28
115 0.25
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.13
120 0.13
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.21
143 0.29
144 0.33
145 0.36
146 0.42
147 0.46
148 0.46
149 0.46
150 0.44
151 0.39
152 0.35
153 0.32
154 0.26
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.15
188 0.18
189 0.19
190 0.21
191 0.2
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.22
213 0.23
214 0.23
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.14
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.18
243 0.18
244 0.14
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.05
250 0.06
251 0.09
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.16
257 0.21
258 0.26
259 0.29
260 0.32
261 0.35
262 0.39
263 0.41
264 0.41
265 0.4
266 0.35
267 0.3
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.22
272 0.22
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.22
283 0.27
284 0.28
285 0.28
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.32
290 0.32
291 0.31
292 0.31
293 0.33
294 0.3
295 0.26
296 0.31
297 0.27
298 0.28
299 0.23
300 0.21
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.09
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.05
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.13
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.21
340 0.18
341 0.16
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.14
346 0.17
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.21
351 0.28
352 0.31
353 0.28
354 0.27
355 0.27
356 0.31
357 0.31
358 0.28
359 0.21
360 0.15
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.09
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.06
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.18
403 0.15
404 0.16
405 0.15
406 0.16
407 0.15
408 0.14
409 0.13
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.12
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.18
418 0.24
419 0.25
420 0.27
421 0.26
422 0.28
423 0.3
424 0.3
425 0.27
426 0.26
427 0.26
428 0.25
429 0.23
430 0.26
431 0.29
432 0.29
433 0.32
434 0.3
435 0.33
436 0.34
437 0.35
438 0.35
439 0.35
440 0.39
441 0.46
442 0.53
443 0.58
444 0.66
445 0.73
446 0.77
447 0.81
448 0.86
449 0.87
450 0.86
451 0.86
452 0.79
453 0.71
454 0.65
455 0.57
456 0.48
457 0.39
458 0.3
459 0.23
460 0.19
461 0.17
462 0.12
463 0.1
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.16
475 0.21
476 0.23
477 0.24
478 0.29
479 0.3
480 0.33
481 0.41
482 0.47
483 0.51
484 0.59
485 0.68
486 0.72
487 0.79
488 0.84
489 0.82
490 0.81
491 0.74
492 0.67
493 0.63
494 0.55
495 0.45
496 0.37
497 0.34
498 0.28
499 0.28
500 0.25
501 0.19
502 0.17
503 0.18
504 0.18
505 0.15
506 0.12
507 0.11
508 0.12
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.13
519 0.13
520 0.15
521 0.24
522 0.31
523 0.35
524 0.42
525 0.47
526 0.46
527 0.5
528 0.58
529 0.55
530 0.56
531 0.55
532 0.49
533 0.47
534 0.43
535 0.38
536 0.28
537 0.22
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.11
542 0.14
543 0.14
544 0.2
545 0.22
546 0.22
547 0.23
548 0.26
549 0.31
550 0.32
551 0.33
552 0.29
553 0.27
554 0.27
555 0.26
556 0.21
557 0.13
558 0.1
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.11
571 0.16
572 0.2
573 0.21
574 0.22
575 0.23
576 0.29
577 0.34
578 0.38
579 0.41
580 0.46
581 0.51
582 0.58
583 0.63
584 0.66
585 0.69
586 0.68
587 0.71
588 0.69
589 0.67
590 0.68
591 0.71
592 0.64
593 0.58
594 0.52
595 0.43
596 0.39
597 0.36
598 0.31
599 0.3
600 0.27
601 0.29
602 0.33
603 0.36
604 0.37
605 0.37
606 0.37
607 0.37
608 0.36
609 0.36
610 0.38
611 0.35
612 0.33
613 0.33
614 0.3
615 0.22