Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YU41

Protein Details
Accession C7YU41    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-292ASANDPNRPRRNIKKRTYGDSSFHydrophilic
312-335TGEGEGSQKRRKKNPGNASPYPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG nhe:NECHADRAFT_84794  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSFHPQTPQSPSQFSSGTSEPALGVATSMTATATATTLPTPAHSVSGSASHHDVVMADDSPHKRKRSVDDSGDREQKKVHVEESKLGIEDLHLDVGKKYLLCQTPHLESLPRISEDLYDMFNLTGLAAEVAREKPNGEKNALRSSYTGHIKRLGIAGHFKVQKVENRGENDPQEESDFAQILHLGDEDWSNSFVRGREISLGLSQSSLSSLGRAVTMAKGSIKKDVWDTSVLGLQSSNGELKQPSSARPTAPNTPLNVPGAVGRLKAQGASANDPNRPRRNIKKRTYGDSSFEGYGEGYPDDDNAMEGGYSTGEGEGSQKRRKKNPGNASPYPSAMRQQSYGPGMVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.31
4 0.29
5 0.25
6 0.24
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.11
11 0.09
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.12
28 0.13
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.19
34 0.19
35 0.18
36 0.19
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.11
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.16
46 0.2
47 0.28
48 0.34
49 0.35
50 0.37
51 0.42
52 0.5
53 0.52
54 0.57
55 0.6
56 0.63
57 0.66
58 0.71
59 0.74
60 0.66
61 0.59
62 0.51
63 0.45
64 0.42
65 0.38
66 0.36
67 0.34
68 0.35
69 0.39
70 0.42
71 0.39
72 0.33
73 0.31
74 0.25
75 0.18
76 0.18
77 0.14
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.09
85 0.1
86 0.15
87 0.2
88 0.21
89 0.26
90 0.29
91 0.31
92 0.32
93 0.32
94 0.27
95 0.23
96 0.26
97 0.24
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.13
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.04
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.14
122 0.21
123 0.23
124 0.25
125 0.26
126 0.29
127 0.38
128 0.38
129 0.35
130 0.28
131 0.28
132 0.32
133 0.36
134 0.34
135 0.27
136 0.3
137 0.29
138 0.29
139 0.29
140 0.23
141 0.17
142 0.19
143 0.18
144 0.2
145 0.22
146 0.21
147 0.21
148 0.23
149 0.25
150 0.27
151 0.3
152 0.28
153 0.31
154 0.33
155 0.34
156 0.32
157 0.3
158 0.25
159 0.21
160 0.17
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.1
206 0.13
207 0.14
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.24
213 0.23
214 0.21
215 0.21
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.22
233 0.25
234 0.25
235 0.31
236 0.35
237 0.37
238 0.41
239 0.42
240 0.39
241 0.4
242 0.4
243 0.36
244 0.31
245 0.24
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.17
257 0.21
258 0.27
259 0.28
260 0.33
261 0.38
262 0.46
263 0.49
264 0.52
265 0.56
266 0.61
267 0.68
268 0.75
269 0.78
270 0.81
271 0.8
272 0.82
273 0.82
274 0.75
275 0.69
276 0.63
277 0.57
278 0.46
279 0.4
280 0.32
281 0.24
282 0.2
283 0.16
284 0.12
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.09
303 0.17
304 0.24
305 0.33
306 0.38
307 0.47
308 0.56
309 0.67
310 0.74
311 0.77
312 0.81
313 0.84
314 0.87
315 0.87
316 0.85
317 0.77
318 0.7
319 0.62
320 0.53
321 0.48
322 0.44
323 0.39
324 0.34
325 0.33
326 0.36
327 0.37
328 0.36