Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9H058

Protein Details
Accession A0A1B9H058    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-54GPLAPPATSKKPRGRPRKAAAAAAHydrophilic
82-103EEAPKTAKKRGRPSKAQPQATQHydrophilic
126-150EAGPSKAKKAKKDDKPPKKEVEEKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-49SKKPRGRPRKA
88-95AKKRGRPS
129-161PSKAKKAKKDDKPPKKEVEEKPKATKGKGRVKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, pero 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MPPRRSARVSAQEQDHAPETSNEDSSAAQNGPLAPPATSKKPRGRPRKAAAAAAAAAATPDVGNGIGDGTSVQQQAVPASIEEAPKTAKKRGRPSKAQPQATQPATAADPSTFKSNPAEKPTDYAEAGPSKAKKAKKDDKPPKKEVEEKPKATKGKGRVKKVDPNMDRYARVQGSGCPDDFFKKFKKAISQRMFMIAREKGGTGQNQYEDFKILGSTGNVYTTRLCSKPKCDCPDYIFNGRTICKHTIFVLIRVLKVPDESSVWYRPTLTASEIEQIFAKAPPTPNEAIHADARKAYMRATGASVEEEAVAEEVKAEAEAAGVNLKRLEVLGDDCPVCYEEITEDDVKEDKLVYDDTPTGCGKGLHKECFDMWANTATSKHQPVTCVWCRAPWPVPGGTNVSPSKGHGKVRISGQNYHSMGYMNMAEAAGMSQPQGVQCVDYCTTGNVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.49
3 0.39
4 0.34
5 0.28
6 0.27
7 0.25
8 0.25
9 0.22
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.21
14 0.17
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.18
20 0.17
21 0.14
22 0.19
23 0.24
24 0.32
25 0.38
26 0.46
27 0.53
28 0.63
29 0.73
30 0.79
31 0.85
32 0.86
33 0.87
34 0.89
35 0.83
36 0.77
37 0.7
38 0.62
39 0.52
40 0.42
41 0.33
42 0.21
43 0.17
44 0.11
45 0.09
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.08
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.2
73 0.24
74 0.3
75 0.33
76 0.41
77 0.52
78 0.61
79 0.68
80 0.74
81 0.8
82 0.83
83 0.88
84 0.86
85 0.78
86 0.76
87 0.75
88 0.66
89 0.57
90 0.46
91 0.38
92 0.31
93 0.29
94 0.21
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.18
99 0.16
100 0.16
101 0.22
102 0.27
103 0.32
104 0.38
105 0.41
106 0.36
107 0.39
108 0.41
109 0.39
110 0.33
111 0.28
112 0.25
113 0.22
114 0.23
115 0.24
116 0.22
117 0.24
118 0.29
119 0.33
120 0.37
121 0.46
122 0.55
123 0.61
124 0.71
125 0.77
126 0.82
127 0.88
128 0.87
129 0.85
130 0.81
131 0.81
132 0.79
133 0.79
134 0.78
135 0.74
136 0.74
137 0.73
138 0.69
139 0.62
140 0.59
141 0.57
142 0.58
143 0.61
144 0.62
145 0.64
146 0.68
147 0.74
148 0.75
149 0.76
150 0.68
151 0.67
152 0.65
153 0.59
154 0.54
155 0.46
156 0.45
157 0.34
158 0.32
159 0.25
160 0.21
161 0.25
162 0.26
163 0.25
164 0.19
165 0.19
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.21
170 0.25
171 0.27
172 0.29
173 0.39
174 0.43
175 0.53
176 0.56
177 0.55
178 0.5
179 0.54
180 0.52
181 0.42
182 0.39
183 0.29
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.13
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.13
211 0.13
212 0.17
213 0.18
214 0.25
215 0.33
216 0.41
217 0.45
218 0.46
219 0.47
220 0.49
221 0.55
222 0.53
223 0.5
224 0.42
225 0.37
226 0.37
227 0.35
228 0.3
229 0.27
230 0.25
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.25
235 0.25
236 0.25
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.24
241 0.24
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.13
249 0.16
250 0.17
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.14
257 0.12
258 0.13
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.12
269 0.14
270 0.19
271 0.2
272 0.19
273 0.23
274 0.23
275 0.23
276 0.25
277 0.24
278 0.2
279 0.19
280 0.2
281 0.18
282 0.18
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.09
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.13
342 0.16
343 0.16
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.19
349 0.18
350 0.25
351 0.31
352 0.34
353 0.34
354 0.36
355 0.36
356 0.39
357 0.41
358 0.32
359 0.27
360 0.26
361 0.26
362 0.24
363 0.25
364 0.23
365 0.25
366 0.28
367 0.3
368 0.27
369 0.28
370 0.31
371 0.4
372 0.43
373 0.45
374 0.41
375 0.41
376 0.42
377 0.46
378 0.46
379 0.41
380 0.38
381 0.35
382 0.36
383 0.35
384 0.39
385 0.34
386 0.37
387 0.34
388 0.32
389 0.29
390 0.3
391 0.35
392 0.34
393 0.37
394 0.37
395 0.41
396 0.44
397 0.52
398 0.58
399 0.55
400 0.56
401 0.54
402 0.57
403 0.53
404 0.48
405 0.4
406 0.33
407 0.29
408 0.24
409 0.22
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.2