Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YKD4

Protein Details
Accession C7YKD4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-95ASDKKSKATAKKPAAKKPAAKTTVEKPKAKPVKKNPIGRPKGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-106KKSKATAKKPAAKKPAAKTTVEKPKAKPVKKNPIGRPKGPVDPEEEKKAEI
Subcellular Location(s) mito 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_98705  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MFTAVGRAAARRIQAPSAHPAAVAQLLLRQAPATSALPIRTFSASAPAHLPAASDKKSKATAKKPAAKKPAAKTTVEKPKAKPVKKNPIGRPKGPVDPEEEKKAEIRQLKKWALRDTPTQRPISKWSQFVNDNKEVLKGGLASGMPGLATKFQSLSAAELDNLETIAIANREKNAADLKAWIKTHEPARIHIANQARRRLIKLTDKHYKLLEDDRLPKKPLGSYTLFTTENWHRLGGKDAIDSSKDMSDAWKALSPSEKAGYTERSAEASAKYEAEMESILARADEIKAEADPKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.36
4 0.37
5 0.35
6 0.31
7 0.28
8 0.25
9 0.23
10 0.19
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.19
29 0.16
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.22
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.2
38 0.16
39 0.22
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.29
44 0.36
45 0.42
46 0.47
47 0.49
48 0.56
49 0.63
50 0.72
51 0.76
52 0.79
53 0.81
54 0.8
55 0.79
56 0.77
57 0.77
58 0.71
59 0.66
60 0.6
61 0.6
62 0.64
63 0.63
64 0.6
65 0.52
66 0.59
67 0.66
68 0.68
69 0.68
70 0.68
71 0.72
72 0.76
73 0.83
74 0.82
75 0.83
76 0.84
77 0.76
78 0.72
79 0.65
80 0.64
81 0.56
82 0.47
83 0.44
84 0.43
85 0.45
86 0.44
87 0.4
88 0.34
89 0.33
90 0.33
91 0.32
92 0.32
93 0.32
94 0.33
95 0.42
96 0.47
97 0.5
98 0.53
99 0.54
100 0.52
101 0.51
102 0.53
103 0.51
104 0.54
105 0.56
106 0.54
107 0.49
108 0.46
109 0.49
110 0.48
111 0.45
112 0.4
113 0.36
114 0.38
115 0.42
116 0.44
117 0.45
118 0.4
119 0.36
120 0.32
121 0.31
122 0.26
123 0.21
124 0.17
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.03
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.14
165 0.15
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.19
170 0.23
171 0.26
172 0.29
173 0.28
174 0.26
175 0.32
176 0.33
177 0.32
178 0.33
179 0.36
180 0.37
181 0.42
182 0.45
183 0.41
184 0.41
185 0.43
186 0.41
187 0.4
188 0.42
189 0.44
190 0.46
191 0.53
192 0.54
193 0.54
194 0.52
195 0.47
196 0.41
197 0.4
198 0.38
199 0.34
200 0.41
201 0.45
202 0.48
203 0.49
204 0.47
205 0.43
206 0.4
207 0.37
208 0.34
209 0.32
210 0.29
211 0.31
212 0.34
213 0.33
214 0.29
215 0.32
216 0.3
217 0.31
218 0.3
219 0.27
220 0.23
221 0.23
222 0.29
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.22
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.2
231 0.17
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.19
241 0.24
242 0.24
243 0.24
244 0.27
245 0.26
246 0.24
247 0.28
248 0.31
249 0.28
250 0.3
251 0.27
252 0.26
253 0.26
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.21
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.16