Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QY12

Protein Details
Accession C4QY12    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-60DVPPPSANKDRARKNRPQPTGNEHydrophilic
73-96EPPVPAKQRSSKPRNDRQDRTGKSHydrophilic
186-207GDSAASKKSSRKKEKNLLDFEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-54ANKDRARKNRP
77-104PAKQRSSKPRNDRQDRTGKSDTAKKIKK
192-198KKSSRKK
219-267RDSSNRGRGGARGGARGGARGGARGNTRGNARGGARGGARGGANAAPAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0297  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSNNKNLFALLGNDVEDETEILVTKELVKKNTSSKKADVPPPSANKDRARKNRPQPTGNEAAIREKNTNRIVEPPVPAKQRSSKPRNDRQDRTGKSDTAKKIKKGWGDDNQELESELAGAADAEAEAEEGEPQVSTKPVKSYADYFAELKLSADALKATSKRTANAGAEDKWGSGEVIVKEAKPQGDSAASKKSSRKKEKNLLDFEATFADAQPEPRGRDSSNRGRGGARGGARGGARGGARGNTRGNARGGARGGARGGANAAPAKKEINFDEKFPAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.13
4 0.1
5 0.07
6 0.07
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.12
12 0.18
13 0.22
14 0.25
15 0.27
16 0.31
17 0.41
18 0.51
19 0.53
20 0.53
21 0.54
22 0.6
23 0.66
24 0.7
25 0.66
26 0.63
27 0.64
28 0.65
29 0.67
30 0.64
31 0.63
32 0.63
33 0.65
34 0.69
35 0.72
36 0.73
37 0.76
38 0.81
39 0.84
40 0.84
41 0.81
42 0.76
43 0.73
44 0.72
45 0.63
46 0.57
47 0.47
48 0.46
49 0.43
50 0.41
51 0.37
52 0.31
53 0.37
54 0.37
55 0.38
56 0.32
57 0.33
58 0.36
59 0.36
60 0.38
61 0.35
62 0.37
63 0.39
64 0.39
65 0.38
66 0.41
67 0.46
68 0.53
69 0.57
70 0.61
71 0.67
72 0.76
73 0.83
74 0.84
75 0.81
76 0.79
77 0.82
78 0.75
79 0.74
80 0.68
81 0.59
82 0.53
83 0.55
84 0.53
85 0.53
86 0.54
87 0.49
88 0.52
89 0.55
90 0.57
91 0.55
92 0.57
93 0.56
94 0.58
95 0.57
96 0.53
97 0.48
98 0.42
99 0.36
100 0.28
101 0.18
102 0.11
103 0.08
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.2
130 0.22
131 0.22
132 0.21
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.1
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.16
147 0.17
148 0.17
149 0.2
150 0.23
151 0.21
152 0.25
153 0.27
154 0.22
155 0.24
156 0.24
157 0.21
158 0.17
159 0.16
160 0.11
161 0.08
162 0.11
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.16
169 0.16
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.16
174 0.18
175 0.19
176 0.25
177 0.26
178 0.29
179 0.35
180 0.43
181 0.49
182 0.58
183 0.66
184 0.68
185 0.76
186 0.83
187 0.86
188 0.84
189 0.78
190 0.71
191 0.61
192 0.52
193 0.42
194 0.33
195 0.23
196 0.17
197 0.14
198 0.1
199 0.12
200 0.15
201 0.18
202 0.2
203 0.22
204 0.25
205 0.24
206 0.32
207 0.4
208 0.46
209 0.52
210 0.52
211 0.51
212 0.49
213 0.49
214 0.45
215 0.43
216 0.35
217 0.28
218 0.25
219 0.27
220 0.26
221 0.25
222 0.21
223 0.18
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.19
229 0.23
230 0.25
231 0.26
232 0.29
233 0.31
234 0.31
235 0.31
236 0.3
237 0.31
238 0.3
239 0.3
240 0.28
241 0.26
242 0.24
243 0.22
244 0.21
245 0.16
246 0.17
247 0.14
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.19
253 0.21
254 0.21
255 0.25
256 0.26
257 0.32
258 0.32
259 0.33