Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YGV7

Protein Details
Accession C7YGV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-69AKSAAKKLVKEKDSKKKKKAEPESESSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-60SKTKESKKAKAAEPLAAVKAGGITKPSKTTKAKSKELAKSAAKKLVKEKDSKKKKKA
450-486GGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGGRGGGRGRGGRGGGRG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0008139  F:nuclear localization sequence binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_102368  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKSKTKESKKAKAAEPLAAVKAGGITKPSKTTKAKSKELAKSAAKKLVKEKDSKKKKKAEPESESSESESESEAESSDDSDSSSEEEKKVTKKATTNGKAKAKAPTPSSDSESESDSGSDDSGDSDSESEEEEKPKAKATKVNGTAKAAAKKAESSDSSDSESGSDSDSDDESEEKEEKKPAAKVTEKKAASSDDSDDSDDSEEDSDDSDDSSEESDAKAKTEEAPSKKRKAEDDIDSDEAKKTKTDAPTTLFAGSLSWNIDDDALYEAFKEFNGLVGARVVTEKGTGRSRGFGYVDFNDPEGCTKAYEAMQGFELDGRALNLDYANARPADANPAGRAADRAKRHGDTLSPESDTLFVGNLPFDVDQDAVREFFGEVAEVASVRLPTDPDSGNLKGFGYVSFNSVEDAKAVIDAKNGAPIGNGRMSRSVRLDFASSRPQQGGGGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGGRGGGRGRGGRGGGRGGFGTGANSTPASYSGTKISFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.71
3 0.66
4 0.6
5 0.52
6 0.43
7 0.37
8 0.26
9 0.25
10 0.2
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.19
15 0.28
16 0.32
17 0.37
18 0.44
19 0.52
20 0.59
21 0.65
22 0.71
23 0.72
24 0.78
25 0.79
26 0.78
27 0.78
28 0.76
29 0.76
30 0.73
31 0.73
32 0.66
33 0.61
34 0.64
35 0.65
36 0.63
37 0.64
38 0.68
39 0.7
40 0.79
41 0.85
42 0.86
43 0.86
44 0.89
45 0.9
46 0.91
47 0.91
48 0.88
49 0.85
50 0.84
51 0.77
52 0.69
53 0.6
54 0.5
55 0.39
56 0.31
57 0.24
58 0.16
59 0.13
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.1
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.18
75 0.22
76 0.26
77 0.32
78 0.34
79 0.36
80 0.39
81 0.46
82 0.55
83 0.6
84 0.63
85 0.67
86 0.71
87 0.69
88 0.66
89 0.67
90 0.61
91 0.58
92 0.54
93 0.5
94 0.47
95 0.46
96 0.47
97 0.41
98 0.39
99 0.34
100 0.33
101 0.28
102 0.23
103 0.2
104 0.16
105 0.14
106 0.11
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.13
120 0.15
121 0.17
122 0.17
123 0.24
124 0.26
125 0.27
126 0.32
127 0.36
128 0.44
129 0.5
130 0.58
131 0.55
132 0.54
133 0.56
134 0.54
135 0.53
136 0.44
137 0.37
138 0.3
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.23
143 0.24
144 0.26
145 0.26
146 0.28
147 0.26
148 0.24
149 0.2
150 0.2
151 0.14
152 0.12
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.14
165 0.16
166 0.18
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.32
171 0.39
172 0.43
173 0.47
174 0.54
175 0.5
176 0.48
177 0.46
178 0.4
179 0.34
180 0.31
181 0.26
182 0.2
183 0.21
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.12
210 0.18
211 0.24
212 0.27
213 0.37
214 0.42
215 0.49
216 0.52
217 0.52
218 0.49
219 0.5
220 0.5
221 0.46
222 0.46
223 0.43
224 0.42
225 0.4
226 0.37
227 0.32
228 0.26
229 0.2
230 0.15
231 0.13
232 0.15
233 0.19
234 0.21
235 0.23
236 0.26
237 0.28
238 0.29
239 0.27
240 0.22
241 0.17
242 0.15
243 0.12
244 0.09
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.1
274 0.13
275 0.16
276 0.16
277 0.19
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.2
283 0.19
284 0.21
285 0.19
286 0.18
287 0.16
288 0.15
289 0.15
290 0.13
291 0.11
292 0.09
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.1
303 0.1
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.17
324 0.17
325 0.16
326 0.18
327 0.16
328 0.2
329 0.22
330 0.27
331 0.3
332 0.3
333 0.32
334 0.31
335 0.31
336 0.3
337 0.32
338 0.3
339 0.26
340 0.25
341 0.24
342 0.23
343 0.2
344 0.14
345 0.1
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.21
380 0.22
381 0.22
382 0.22
383 0.2
384 0.17
385 0.17
386 0.15
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.1
396 0.1
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.12
404 0.16
405 0.16
406 0.14
407 0.14
408 0.15
409 0.18
410 0.22
411 0.22
412 0.2
413 0.27
414 0.29
415 0.32
416 0.35
417 0.33
418 0.29
419 0.3
420 0.32
421 0.27
422 0.3
423 0.36
424 0.34
425 0.35
426 0.34
427 0.33
428 0.29
429 0.28
430 0.27
431 0.17
432 0.16
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.05
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.17
463 0.19
464 0.2
465 0.23
466 0.25
467 0.25
468 0.26
469 0.31
470 0.29
471 0.28
472 0.26
473 0.22
474 0.21
475 0.18
476 0.17
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.12
484 0.15
485 0.16
486 0.17
487 0.22