FuNGI

A0A1B9GRT0

Protein Details

Accession

A0A1B9GRT0

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
455-480	EEDRERMKNRDRTKKTKEDKERVAEP	Basic
575-595	AVKAERSARRAEKKSHKETFS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
302-309	KKRRGKRG
460-471	RMKNRDRTKKTK
569-600	KKARKAAVKAERSARRAEKKSHKETFSTERKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKKSIFRGPDAQHFQLVHRSQQDPRINDPEASQRVFKSVTRGNDSGRKPEITLADLENSVDKSAIRKNEGEAALYGITYDDSSYDYMAHLKPVGDGGVFESVMIAAPRGGSAVARGMKTMGKGKGKAKDDDVFGLLPEDVLPSKEQLSVYEAQTRGESIPAELQGLQPDMDPHLRQVLEALDDDAFVDEDGDEDADWFGELVGDGEREEDVEVPWEFKEWGDDEGLARAKAKAGQAHDDNNEDGEPREETWEDRFKAFKRQQASLPDEVSDIDPEERSETADTVGTLMSNFDDMMVVGGKKRRGKRGPSDASGMSMSSSSMFRTQGLRDLDDRFDKVEMDYLYDDDEEEEYEDFPDDDTASVAASNFSVSSRFSLASHASRAGGGPPEVSRDDFEAIMDDFLDNYEVVGRRLRPALGGTGLTGTEKLSVLRSAIEGEDEAKEENRRRIMRIEEEDRERMKNRDRTKKTKEDKERVAEPEEEKWDVQTILTTYTNTENHPAMIRSRTAAQAKARAEALAKQQLQQQEEQDAEEDSDDGDDGTDSGSETEREAPKVTVTRQKGETTEDKKARKAAVKAERSARRAEKKSHKETFSTERKRQLASHKKLVSNGRAADVAVGARGVVSLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.54
3	0.49
4	0.49
5	0.47
6	0.42
7	0.41
8	0.42
9	0.42
10	0.51
11	0.57
12	0.51
13	0.56
14	0.57
15	0.54
16	0.51
17	0.49
18	0.49
19	0.47
20	0.45
21	0.41
22	0.34
23	0.36
24	0.37
25	0.35
26	0.34
27	0.34
28	0.39
29	0.44
30	0.46
31	0.48
32	0.54
33	0.56
34	0.56
35	0.54
36	0.48
37	0.41
38	0.44
39	0.41
40	0.34
41	0.34
42	0.28
43	0.26
44	0.25
45	0.24
46	0.21
47	0.19
48	0.17
49	0.14
50	0.12
51	0.14
52	0.2
53	0.25
54	0.27
55	0.28
56	0.3
57	0.38
58	0.39
59	0.36
60	0.31
61	0.28
62	0.23
63	0.22
64	0.19
65	0.11
66	0.1
67	0.08
68	0.08
69	0.05
70	0.07
71	0.07
72	0.08
73	0.08
74	0.08
75	0.12
76	0.13
77	0.14
78	0.14
79	0.14
80	0.14
81	0.15
82	0.15
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.07
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.05
100	0.06
101	0.12
102	0.15
103	0.15
104	0.16
105	0.17
106	0.18
107	0.22
108	0.27
109	0.28
110	0.31
111	0.37
112	0.43
113	0.5
114	0.53
115	0.54
116	0.52
117	0.5
118	0.46
119	0.43
120	0.39
121	0.3
122	0.26
123	0.23
124	0.17
125	0.12
126	0.1
127	0.09
128	0.07
129	0.08
130	0.09
131	0.09
132	0.1
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.17
137	0.19
138	0.21
139	0.26
140	0.25
141	0.23
142	0.23
143	0.24
144	0.19
145	0.17
146	0.16
147	0.1
148	0.13
149	0.12
150	0.13
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.1
157	0.1
158	0.11
159	0.14
160	0.14
161	0.13
162	0.17
163	0.17
164	0.16
165	0.17
166	0.15
167	0.13
168	0.13
169	0.14
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.05
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.05
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.11
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.14
214	0.15
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.14
220	0.15
221	0.16
222	0.17
223	0.22
224	0.24
225	0.28
226	0.29
227	0.27
228	0.25
229	0.22
230	0.2
231	0.15
232	0.13
233	0.1
234	0.1
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.11
239	0.16
240	0.23
241	0.22
242	0.23
243	0.26
244	0.25
245	0.36
246	0.39
247	0.38
248	0.35
249	0.37
250	0.41
251	0.45
252	0.49
253	0.42
254	0.38
255	0.34
256	0.3
257	0.28
258	0.23
259	0.15
260	0.11
261	0.08
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.09
288	0.13
289	0.19
290	0.23
291	0.32
292	0.39
293	0.46
294	0.54
295	0.63
296	0.65
297	0.62
298	0.61
299	0.52
300	0.46
301	0.39
302	0.29
303	0.18
304	0.12
305	0.09
306	0.06
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.1
313	0.11
314	0.16
315	0.18
316	0.18
317	0.19
318	0.21
319	0.22
320	0.22
321	0.22
322	0.16
323	0.15
324	0.14
325	0.12
326	0.14
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.07
335	0.07
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.14
365	0.15
366	0.17
367	0.16
368	0.15
369	0.14
370	0.14
371	0.13
372	0.12
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.12
377	0.12
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.14
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.04
393	0.04
394	0.07
395	0.08
396	0.09
397	0.12
398	0.13
399	0.14
400	0.16
401	0.16
402	0.14
403	0.15
404	0.16
405	0.14
406	0.14
407	0.12
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.15
431	0.19
432	0.24
433	0.3
434	0.32
435	0.33
436	0.38
437	0.42
438	0.45
439	0.49
440	0.5
441	0.49
442	0.52
443	0.55
444	0.52
445	0.5
446	0.44
447	0.42
448	0.45
449	0.47
450	0.52
451	0.58
452	0.65
453	0.72
454	0.78
455	0.84
456	0.84
457	0.86
458	0.88
459	0.86
460	0.86
461	0.83
462	0.8
463	0.73
464	0.67
465	0.61
466	0.52
467	0.48
468	0.42
469	0.37
470	0.3
471	0.27
472	0.25
473	0.2
474	0.18
475	0.15
476	0.12
477	0.14
478	0.15
479	0.14
480	0.14
481	0.19
482	0.2
483	0.19
484	0.22
485	0.19
486	0.19
487	0.22
488	0.21
489	0.2
490	0.22
491	0.22
492	0.2
493	0.22
494	0.27
495	0.28
496	0.32
497	0.33
498	0.38
499	0.38
500	0.39
501	0.37
502	0.31
503	0.29
504	0.28
505	0.31
506	0.32
507	0.32
508	0.31
509	0.35
510	0.39
511	0.4
512	0.39
513	0.34
514	0.29
515	0.29
516	0.28
517	0.24
518	0.2
519	0.17
520	0.14
521	0.12
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.07
535	0.09
536	0.16
537	0.19
538	0.21
539	0.22
540	0.22
541	0.26
542	0.31
543	0.36
544	0.38
545	0.4
546	0.45
547	0.47
548	0.5
549	0.47
550	0.48
551	0.52
552	0.5
553	0.55
554	0.57
555	0.57
556	0.58
557	0.62
558	0.62
559	0.6
560	0.59
561	0.59
562	0.61
563	0.65
564	0.67
565	0.72
566	0.73
567	0.68
568	0.7
569	0.7
570	0.69
571	0.69
572	0.73
573	0.74
574	0.76
575	0.84
576	0.84
577	0.79
578	0.73
579	0.73
580	0.73
581	0.73
582	0.72
583	0.69
584	0.69
585	0.69
586	0.68
587	0.68
588	0.68
589	0.68
590	0.67
591	0.71
592	0.69
593	0.69
594	0.72
595	0.75
596	0.71
597	0.68
598	0.61
599	0.53
600	0.46
601	0.42
602	0.36
603	0.29
604	0.21
605	0.14
606	0.11
607	0.08
608	0.07

A0A1B9GRT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer