Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IVD3

Protein Details
Accession A0A1B9IVD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-288EDEFTGLRNKRKRPRGSTNRNGKGKSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-288RNKRKRPRGSTNRNGKGKSR
366-370RKSRR
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13.333, nucl 11, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
Amino Acid Sequences MSQNRHVRPTNLHRLFIQSMLSRRAIKEDVALEMYKRAVGACQANDDTFRPLHETTIRGFRTFITDVSDILHDLGMEVVLGQEQTGKGKSWVVLRNMDPTEVALQATDYTPLEIDYYRRVVKEIIESYPANSISHGQATTIVGELEGTMARHVAETLLDSLCSRGWLSKSKRGRYTLGVRAISELETYLKQQFEDYMQNCKHCKRVILDGVCCSKQGCDAHYHSYCYSAILKLPRPSCPECKSKFSEYEPSPIGEKAVSRAEDEFTGLRNKRKRPRGSTNRNGKGKSRADGDEEEDDTDEDEDELEEEEGRDGEGAGSGFIERAGPSGWRVDSSSRRRSIVPETQYLDDEAEADDDDEEEPPTSRRKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.55
3 0.47
4 0.42
5 0.36
6 0.35
7 0.38
8 0.4
9 0.37
10 0.35
11 0.39
12 0.36
13 0.32
14 0.32
15 0.29
16 0.28
17 0.28
18 0.28
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.18
23 0.16
24 0.13
25 0.11
26 0.15
27 0.2
28 0.19
29 0.24
30 0.26
31 0.26
32 0.28
33 0.28
34 0.27
35 0.22
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.23
40 0.25
41 0.25
42 0.25
43 0.34
44 0.35
45 0.31
46 0.31
47 0.27
48 0.3
49 0.29
50 0.26
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.22
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.03
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.05
70 0.06
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.14
76 0.17
77 0.22
78 0.28
79 0.3
80 0.34
81 0.34
82 0.4
83 0.39
84 0.37
85 0.29
86 0.24
87 0.22
88 0.17
89 0.16
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.19
109 0.24
110 0.24
111 0.21
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.26
116 0.25
117 0.17
118 0.15
119 0.15
120 0.12
121 0.14
122 0.13
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.18
154 0.23
155 0.32
156 0.4
157 0.46
158 0.52
159 0.53
160 0.54
161 0.52
162 0.54
163 0.53
164 0.51
165 0.45
166 0.4
167 0.37
168 0.35
169 0.28
170 0.2
171 0.13
172 0.08
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.17
182 0.17
183 0.24
184 0.25
185 0.28
186 0.3
187 0.31
188 0.33
189 0.28
190 0.31
191 0.25
192 0.32
193 0.37
194 0.4
195 0.4
196 0.4
197 0.42
198 0.38
199 0.35
200 0.28
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.15
205 0.18
206 0.21
207 0.28
208 0.29
209 0.31
210 0.26
211 0.27
212 0.26
213 0.22
214 0.2
215 0.14
216 0.16
217 0.18
218 0.22
219 0.26
220 0.28
221 0.3
222 0.35
223 0.39
224 0.44
225 0.45
226 0.5
227 0.48
228 0.53
229 0.55
230 0.53
231 0.54
232 0.5
233 0.54
234 0.47
235 0.48
236 0.43
237 0.39
238 0.35
239 0.3
240 0.26
241 0.17
242 0.16
243 0.13
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.18
251 0.15
252 0.13
253 0.2
254 0.22
255 0.29
256 0.35
257 0.44
258 0.52
259 0.62
260 0.7
261 0.72
262 0.8
263 0.84
264 0.88
265 0.89
266 0.91
267 0.9
268 0.87
269 0.81
270 0.74
271 0.72
272 0.66
273 0.6
274 0.54
275 0.47
276 0.45
277 0.44
278 0.44
279 0.38
280 0.34
281 0.3
282 0.25
283 0.23
284 0.18
285 0.16
286 0.12
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.05
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.18
318 0.25
319 0.34
320 0.42
321 0.5
322 0.5
323 0.52
324 0.52
325 0.55
326 0.57
327 0.56
328 0.53
329 0.51
330 0.51
331 0.5
332 0.5
333 0.46
334 0.38
335 0.28
336 0.23
337 0.16
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.2
350 0.25