Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IRN3

Protein Details
Accession A0A1B9IRN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-202SAYRKQLTRFFPKRRIRKEKKLIGNKEEVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-193FPKRRIRKEKK
610-616KETKKNK
Subcellular Location(s) cyto 12, nucl 5, pero 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MSGRAAGGPVAQPADPARQQGNNDKIWGVVRSVAMFVAVQAAMKYGMQYMGMGGNKSPSPPVPSPAGITAGTASTPVAVPQGSQLATPAWDLGTPLSMLLYTSTSPSGRDVDLDHPLVQWDGLTYGEWKDEREADLILDVPESVWAHNGSWFMDVVLVKGGGTPGGKGPGNVSAYRKQLTRFFPKRRIRKEKKLIGNKEEVEEDLEDPTEQSGPAPIVAHWSNNLTLTIVASGGEINFGQLSPVAQPFYTIQSSLEDPTKKVYPPPIYPNDFWIMKESLYTINETTKTLPLHVTYHAISAMKFNVFSSLTASFEQAAQQQGGGGMEFDEIKRTLTETSPWLLITTAIVTVLHTLFEFLAFSSDVSHWRKKDKDLVGVSLNTILTNCFVQLVILLYLHDSSEETSFMILFGQGIGLLIEAWKITKVTNIRIRPAPASIFGYTVQFEDKRELSEDEKKTQEYDALAFRLVSYGAIPLLAGHTVYSPDKTLLHRTHRGWYSFIVTTLAQAIYMFGFVQLVPQLIINYKLKSVAHMPMKAMMYKTLSTVVDDFFAFCIRMPWLHRLACFRDDVVFLILIYQRWIYRVDYSRVNEYGQVNESMVEDVGKPGEKEKETKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.26
4 0.28
5 0.31
6 0.36
7 0.45
8 0.49
9 0.45
10 0.45
11 0.42
12 0.39
13 0.37
14 0.34
15 0.26
16 0.22
17 0.2
18 0.19
19 0.19
20 0.17
21 0.15
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.08
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.21
45 0.18
46 0.24
47 0.26
48 0.29
49 0.31
50 0.32
51 0.33
52 0.32
53 0.33
54 0.25
55 0.23
56 0.2
57 0.15
58 0.14
59 0.11
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.09
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.24
100 0.25
101 0.23
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.17
106 0.13
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.1
126 0.08
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.17
157 0.2
158 0.22
159 0.25
160 0.27
161 0.3
162 0.32
163 0.33
164 0.3
165 0.34
166 0.39
167 0.46
168 0.5
169 0.55
170 0.64
171 0.72
172 0.8
173 0.84
174 0.88
175 0.87
176 0.88
177 0.9
178 0.9
179 0.9
180 0.91
181 0.88
182 0.82
183 0.8
184 0.7
185 0.61
186 0.52
187 0.41
188 0.33
189 0.25
190 0.2
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.18
243 0.15
244 0.15
245 0.18
246 0.2
247 0.19
248 0.2
249 0.26
250 0.26
251 0.3
252 0.37
253 0.41
254 0.44
255 0.44
256 0.44
257 0.41
258 0.36
259 0.32
260 0.28
261 0.21
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.13
351 0.18
352 0.22
353 0.23
354 0.29
355 0.32
356 0.34
357 0.43
358 0.42
359 0.45
360 0.43
361 0.45
362 0.42
363 0.39
364 0.36
365 0.28
366 0.24
367 0.15
368 0.12
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.1
411 0.13
412 0.21
413 0.3
414 0.33
415 0.37
416 0.41
417 0.43
418 0.4
419 0.4
420 0.33
421 0.27
422 0.27
423 0.23
424 0.21
425 0.19
426 0.18
427 0.16
428 0.15
429 0.16
430 0.13
431 0.13
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.19
436 0.21
437 0.23
438 0.31
439 0.34
440 0.35
441 0.37
442 0.36
443 0.35
444 0.33
445 0.31
446 0.23
447 0.22
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.14
454 0.13
455 0.1
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.15
473 0.17
474 0.26
475 0.31
476 0.38
477 0.45
478 0.46
479 0.54
480 0.57
481 0.56
482 0.5
483 0.44
484 0.41
485 0.35
486 0.33
487 0.26
488 0.2
489 0.18
490 0.19
491 0.16
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.15
509 0.16
510 0.17
511 0.17
512 0.2
513 0.2
514 0.22
515 0.25
516 0.29
517 0.33
518 0.34
519 0.35
520 0.37
521 0.39
522 0.38
523 0.35
524 0.3
525 0.26
526 0.24
527 0.24
528 0.23
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.19
533 0.17
534 0.17
535 0.16
536 0.13
537 0.13
538 0.11
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.15
543 0.18
544 0.24
545 0.3
546 0.33
547 0.36
548 0.41
549 0.45
550 0.44
551 0.43
552 0.37
553 0.32
554 0.3
555 0.29
556 0.24
557 0.19
558 0.15
559 0.17
560 0.17
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.14
565 0.15
566 0.17
567 0.16
568 0.24
569 0.3
570 0.33
571 0.4
572 0.43
573 0.48
574 0.48
575 0.47
576 0.44
577 0.39
578 0.39
579 0.33
580 0.31
581 0.25
582 0.24
583 0.23
584 0.19
585 0.17
586 0.13
587 0.11
588 0.11
589 0.13
590 0.15
591 0.14
592 0.18
593 0.26
594 0.28
595 0.35
596 0.44