Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IKC6

Protein Details
Accession A0A1B9IKC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-148SLPTPERKAPPPKVKKEKKPAAPAAGHydrophilic
165-189PQEGGKKKEKKEKKEKPAKAQPVKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-144RKAPPPKVKKEKKPAA
168-185GGKKKEKKEKKEKPAKAQ
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, nucl 13.5, cyto 12, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MSNVSEFVAAAEQADPSLTGSNEKEKAEIAKLAGETEGYVKDLSALNEKLTPLTYLYSNSPSSADVSLYAHLHPTLISAPTTQHPQQPSLLRYFLQIQSLESVQSAQKSLPNSFPSLEIDISSLPTPERKAPPPKVKKEKKPAAPAAGGVTETVTNAVSGASAAPQEGGKKKEKKEKKEKPAKAQPVKEEPTGPLPSMIDMRVGKVLDVKRHPDADSLYVESIDVGEPEPRTVCSGLVKYMTEDQIRGATIVVICNLKPVTMRGVKSYAMLLCASSKDGKDEGGIEFVYPPEGSQPGERIYFEGEKYENAKPETQLNPKKKVFETIQPGFTTLDTREAAWIDPETKTVHKIRTKDGVLTSKTLIGASLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.1
5 0.1
6 0.13
7 0.16
8 0.23
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.27
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.24
17 0.24
18 0.24
19 0.24
20 0.21
21 0.18
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.11
29 0.14
30 0.15
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.22
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.2
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.18
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.18
51 0.15
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.12
67 0.14
68 0.21
69 0.21
70 0.25
71 0.26
72 0.28
73 0.33
74 0.37
75 0.38
76 0.36
77 0.35
78 0.3
79 0.3
80 0.33
81 0.29
82 0.26
83 0.23
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.18
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.13
95 0.15
96 0.17
97 0.21
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.24
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.08
112 0.1
113 0.11
114 0.16
115 0.21
116 0.27
117 0.36
118 0.45
119 0.56
120 0.65
121 0.73
122 0.79
123 0.84
124 0.87
125 0.89
126 0.88
127 0.86
128 0.86
129 0.81
130 0.75
131 0.66
132 0.57
133 0.47
134 0.38
135 0.3
136 0.2
137 0.14
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.08
154 0.11
155 0.15
156 0.23
157 0.3
158 0.36
159 0.45
160 0.54
161 0.62
162 0.7
163 0.76
164 0.8
165 0.84
166 0.86
167 0.86
168 0.88
169 0.87
170 0.84
171 0.78
172 0.72
173 0.69
174 0.65
175 0.55
176 0.46
177 0.37
178 0.34
179 0.31
180 0.25
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.15
193 0.18
194 0.2
195 0.23
196 0.26
197 0.26
198 0.28
199 0.29
200 0.26
201 0.25
202 0.22
203 0.21
204 0.19
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.1
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.2
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.17
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.26
252 0.26
253 0.26
254 0.28
255 0.21
256 0.17
257 0.16
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.15
283 0.16
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.21
288 0.23
289 0.21
290 0.22
291 0.2
292 0.21
293 0.26
294 0.28
295 0.29
296 0.28
297 0.31
298 0.29
299 0.35
300 0.4
301 0.46
302 0.52
303 0.55
304 0.62
305 0.63
306 0.68
307 0.62
308 0.63
309 0.57
310 0.57
311 0.58
312 0.55
313 0.56
314 0.51
315 0.5
316 0.43
317 0.38
318 0.32
319 0.23
320 0.23
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.19
332 0.21
333 0.26
334 0.3
335 0.36
336 0.41
337 0.45
338 0.5
339 0.57
340 0.58
341 0.58
342 0.6
343 0.59
344 0.56
345 0.55
346 0.5
347 0.43
348 0.4
349 0.34