Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IVJ8

Protein Details
Accession A0A1B9IVJ8    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-41TNAQASSSKHHKSRKDKSHKKDKSHKHASNNHQGTSHydrophilic
303-335GWTPREIKAYRKQLEKKKKDARKARKEEGQVLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-32KHHKSRKDKSHKKDKSHKH
311-328AYRKQLEKKKKDARKARK
364-378RKAGQGDSENKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSQPTTNAQASSSKHHKSRKDKSHKKDKSHKHASNNHQGTSKNDKSPFEHRLSRMRLAIPPKFSFNMMQGVKEKLDGMIMRYVAQMGGVLLAHWDHEFVDDTSKIINECPSGVIEVEFHSILWAPKIGQKLYGTHSLSSPSHLSLLFNKTFNVSIPLQHIPTDLYEFEHTDETADADSDSEDEEEEGFILGMGNGVVEDVGRWKVKETGKSLGEGGKGIKFTVIGMQVTNQMLSLTGSLLSDPSNPPPAPEPTLHLPTRVSPSPSLSPEPTHRSAKQARLAPTNRSRQPAVQGEADEVPDQTGWTPREIKAYRKQLEKKKKDARKARKEEGQVLEHVQMEAAGDLVHTQGQGEFEENVDVGSKRKAGQGDSENKKRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.58
3 0.66
4 0.71
5 0.79
6 0.82
7 0.84
8 0.87
9 0.9
10 0.93
11 0.93
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.93
16 0.93
17 0.9
18 0.89
19 0.9
20 0.88
21 0.89
22 0.83
23 0.75
24 0.68
25 0.62
26 0.58
27 0.58
28 0.56
29 0.52
30 0.52
31 0.52
32 0.53
33 0.6
34 0.6
35 0.57
36 0.58
37 0.55
38 0.6
39 0.62
40 0.62
41 0.58
42 0.53
43 0.52
44 0.52
45 0.54
46 0.51
47 0.47
48 0.46
49 0.43
50 0.42
51 0.38
52 0.32
53 0.35
54 0.29
55 0.31
56 0.29
57 0.3
58 0.29
59 0.27
60 0.25
61 0.16
62 0.19
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.12
71 0.12
72 0.09
73 0.05
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.13
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.11
113 0.15
114 0.14
115 0.17
116 0.18
117 0.2
118 0.23
119 0.3
120 0.28
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.25
125 0.25
126 0.22
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.13
141 0.13
142 0.16
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.03
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.15
192 0.18
193 0.24
194 0.26
195 0.3
196 0.31
197 0.32
198 0.32
199 0.28
200 0.25
201 0.2
202 0.18
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.2
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.26
239 0.25
240 0.32
241 0.31
242 0.29
243 0.26
244 0.26
245 0.31
246 0.29
247 0.27
248 0.22
249 0.26
250 0.3
251 0.32
252 0.33
253 0.29
254 0.3
255 0.33
256 0.39
257 0.39
258 0.41
259 0.38
260 0.43
261 0.48
262 0.52
263 0.53
264 0.52
265 0.52
266 0.56
267 0.58
268 0.59
269 0.61
270 0.63
271 0.6
272 0.58
273 0.56
274 0.49
275 0.54
276 0.52
277 0.47
278 0.41
279 0.37
280 0.35
281 0.33
282 0.32
283 0.24
284 0.17
285 0.14
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.14
290 0.14
291 0.17
292 0.21
293 0.21
294 0.32
295 0.34
296 0.41
297 0.45
298 0.55
299 0.57
300 0.64
301 0.72
302 0.73
303 0.82
304 0.83
305 0.84
306 0.84
307 0.87
308 0.88
309 0.9
310 0.9
311 0.9
312 0.91
313 0.89
314 0.87
315 0.85
316 0.83
317 0.79
318 0.71
319 0.62
320 0.55
321 0.48
322 0.4
323 0.33
324 0.24
325 0.17
326 0.14
327 0.11
328 0.08
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.17
350 0.17
351 0.22
352 0.26
353 0.26
354 0.34
355 0.42
356 0.49
357 0.57
358 0.66