Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IRF3

Protein Details
Accession A0A1B9IRF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-133MKSPIYRIPQRQNSHQHKEGHydrophilic
787-808GEDTKRRTAKNYFRTKPCKFFAHydrophilic
900-925MMVERPRPWRTKPCRHYQLNRCTLGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSHSTTSTPSSPPRTPLPSSPNFKFTLPTPPSFSAHRSSSHSRNTSSTNLADLPHQHDDTSRHSKRMSISSIHDPIVDNNEKKDRRVSFSIETNKPISRPSTTTSTAPPSGGMKSPIYRIPQRQNSHQHKEGEEILNSPEIPLTPPPTKRRPISFQGVSPGSTRFSNMAALKGISIDQSLSSPKGAFSRSIWSAGILPSSSSKSGWISSAGSAGPAGAKSISSTLKSPLPITTSTVATGEPLKSPSGSGKKGTASEIAKARGLSIAIIKENGKGVLPITPGLMTASSAGGLKSPIVTVGGLKSPDIKIIKHINAIGDVENGLSSAGSIGKKEIILCKFYHTPGLTCTSRPCRFVHNLSSIQAQLGSAYPQSATGALSGFRMLSPNRPDPTSGTFAQAQMTPSTATDFPRKTVKVTEDGGMDLGDVMPGEKVLIEDENGEEVVGQVFFMSGGGKGAMGKSREKWKTVPCKDFAEGHCPYGDYCSFIQAEVNEGKPAQQHRLTHRKSASLSSSLTAWTKALPTAILVPSVKVDPQVLQKTEGHLSAFAPPYLKEPIAVDETGDLIPASQSIEAIKASATTPPARAKEPLAIPMEPTITAPTKITAWAKGPPPNLRKVASIKNLSLTPHPRSHEKSSGLTPTSANHLMPPVSAISMFGTESDPATPFDPVVQRRKLQELEDALNDLPKSNLFQRLEHDQGLLPLPIMPTSPSQGYHPAPAAGGNQGNSILNSTTYPWGMPMSPLPGHGDPTVPLIPGGLGVIWTPTGWAVQDAAMKNALRSAEVKARYGEDTKRRTAKNYFRTKPCKFFAEGYCPHGDECTYMHVMVPSSPEQSSSSESESGASIGQTFSSPTSPYGTIKQPKTVHPKHQTLPCKFYNSSLGCNNGDRCNFLHTRVVPESVMMVERPRPWRTKPCRHYQLNRCTLGDACHFAHVLDPAWVNSGYHSQYQTSHPQQQLTEESLEKTLEEMRNGKNEMRGADDDEDEDEDDVEIITAVGDLTFSSTSYSPPSSVRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.53
4 0.57
5 0.59
6 0.61
7 0.65
8 0.65
9 0.62
10 0.58
11 0.54
12 0.48
13 0.41
14 0.42
15 0.4
16 0.39
17 0.41
18 0.42
19 0.45
20 0.46
21 0.47
22 0.43
23 0.41
24 0.41
25 0.41
26 0.45
27 0.51
28 0.57
29 0.58
30 0.55
31 0.56
32 0.57
33 0.54
34 0.52
35 0.44
36 0.38
37 0.34
38 0.32
39 0.31
40 0.31
41 0.32
42 0.33
43 0.32
44 0.29
45 0.31
46 0.34
47 0.39
48 0.46
49 0.43
50 0.42
51 0.42
52 0.46
53 0.49
54 0.53
55 0.5
56 0.45
57 0.47
58 0.51
59 0.55
60 0.51
61 0.46
62 0.38
63 0.35
64 0.39
65 0.4
66 0.33
67 0.35
68 0.44
69 0.44
70 0.46
71 0.52
72 0.49
73 0.49
74 0.53
75 0.54
76 0.5
77 0.58
78 0.65
79 0.6
80 0.59
81 0.55
82 0.52
83 0.46
84 0.44
85 0.38
86 0.33
87 0.33
88 0.34
89 0.37
90 0.38
91 0.4
92 0.41
93 0.43
94 0.4
95 0.36
96 0.33
97 0.28
98 0.28
99 0.28
100 0.27
101 0.24
102 0.25
103 0.28
104 0.32
105 0.36
106 0.41
107 0.47
108 0.54
109 0.6
110 0.64
111 0.7
112 0.76
113 0.79
114 0.8
115 0.78
116 0.73
117 0.65
118 0.63
119 0.6
120 0.54
121 0.45
122 0.37
123 0.32
124 0.29
125 0.27
126 0.23
127 0.16
128 0.12
129 0.13
130 0.15
131 0.2
132 0.24
133 0.32
134 0.4
135 0.48
136 0.55
137 0.59
138 0.64
139 0.66
140 0.67
141 0.69
142 0.66
143 0.61
144 0.61
145 0.56
146 0.49
147 0.42
148 0.36
149 0.28
150 0.24
151 0.23
152 0.16
153 0.15
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.24
177 0.24
178 0.26
179 0.25
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.14
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.2
217 0.22
218 0.21
219 0.23
220 0.23
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.17
225 0.15
226 0.16
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.21
234 0.26
235 0.28
236 0.28
237 0.3
238 0.33
239 0.34
240 0.35
241 0.33
242 0.27
243 0.3
244 0.32
245 0.3
246 0.29
247 0.27
248 0.26
249 0.21
250 0.19
251 0.15
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.18
293 0.19
294 0.17
295 0.21
296 0.28
297 0.3
298 0.3
299 0.31
300 0.26
301 0.26
302 0.27
303 0.21
304 0.14
305 0.12
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.17
321 0.16
322 0.19
323 0.19
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.3
328 0.24
329 0.23
330 0.23
331 0.29
332 0.25
333 0.23
334 0.29
335 0.32
336 0.35
337 0.36
338 0.35
339 0.36
340 0.4
341 0.45
342 0.45
343 0.43
344 0.42
345 0.41
346 0.41
347 0.34
348 0.29
349 0.24
350 0.16
351 0.1
352 0.08
353 0.08
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.08
370 0.14
371 0.19
372 0.25
373 0.27
374 0.27
375 0.28
376 0.29
377 0.34
378 0.32
379 0.27
380 0.24
381 0.23
382 0.23
383 0.23
384 0.21
385 0.17
386 0.13
387 0.13
388 0.1
389 0.09
390 0.12
391 0.11
392 0.12
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.26
397 0.26
398 0.25
399 0.29
400 0.29
401 0.28
402 0.29
403 0.29
404 0.23
405 0.22
406 0.21
407 0.16
408 0.13
409 0.08
410 0.06
411 0.04
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.08
444 0.1
445 0.12
446 0.15
447 0.24
448 0.27
449 0.29
450 0.33
451 0.39
452 0.48
453 0.55
454 0.57
455 0.51
456 0.52
457 0.51
458 0.53
459 0.45
460 0.41
461 0.34
462 0.29
463 0.26
464 0.22
465 0.2
466 0.18
467 0.16
468 0.11
469 0.1
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.12
474 0.09
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.12
482 0.14
483 0.15
484 0.18
485 0.21
486 0.29
487 0.39
488 0.41
489 0.45
490 0.45
491 0.44
492 0.42
493 0.41
494 0.36
495 0.28
496 0.27
497 0.2
498 0.19
499 0.16
500 0.15
501 0.12
502 0.1
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.14
521 0.18
522 0.18
523 0.21
524 0.21
525 0.23
526 0.24
527 0.23
528 0.17
529 0.13
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.12
534 0.12
535 0.11
536 0.13
537 0.15
538 0.14
539 0.1
540 0.1
541 0.13
542 0.14
543 0.14
544 0.11
545 0.09
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.07
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.05
554 0.03
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.07
564 0.09
565 0.1
566 0.13
567 0.17
568 0.19
569 0.2
570 0.21
571 0.21
572 0.25
573 0.24
574 0.27
575 0.25
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.21
580 0.16
581 0.15
582 0.12
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.13
589 0.14
590 0.13
591 0.14
592 0.18
593 0.22
594 0.26
595 0.3
596 0.35
597 0.38
598 0.42
599 0.44
600 0.4
601 0.4
602 0.41
603 0.44
604 0.43
605 0.43
606 0.37
607 0.36
608 0.36
609 0.34
610 0.34
611 0.31
612 0.29
613 0.31
614 0.32
615 0.35
616 0.4
617 0.45
618 0.46
619 0.44
620 0.42
621 0.41
622 0.44
623 0.4
624 0.35
625 0.29
626 0.23
627 0.25
628 0.23
629 0.19
630 0.15
631 0.15
632 0.14
633 0.13
634 0.13
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.09
649 0.1
650 0.09
651 0.08
652 0.11
653 0.16
654 0.2
655 0.27
656 0.31
657 0.33
658 0.35
659 0.41
660 0.4
661 0.36
662 0.37
663 0.34
664 0.32
665 0.3
666 0.29
667 0.24
668 0.23
669 0.21
670 0.16
671 0.12
672 0.09
673 0.11
674 0.12
675 0.21
676 0.2
677 0.22
678 0.25
679 0.31
680 0.35
681 0.32
682 0.31
683 0.23
684 0.22
685 0.23
686 0.19
687 0.13
688 0.1
689 0.1
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.11
695 0.12
696 0.12
697 0.13
698 0.19
699 0.2
700 0.21
701 0.21
702 0.19
703 0.18
704 0.18
705 0.17
706 0.14
707 0.14
708 0.12
709 0.12
710 0.12
711 0.12
712 0.11
713 0.12
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.1
718 0.11
719 0.11
720 0.1
721 0.1
722 0.11
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.14
727 0.14
728 0.15
729 0.19
730 0.18
731 0.21
732 0.2
733 0.19
734 0.15
735 0.19
736 0.19
737 0.15
738 0.14
739 0.11
740 0.11
741 0.1
742 0.09
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.05
752 0.05
753 0.06
754 0.06
755 0.08
756 0.13
757 0.13
758 0.14
759 0.17
760 0.17
761 0.17
762 0.18
763 0.17
764 0.13
765 0.14
766 0.17
767 0.22
768 0.24
769 0.26
770 0.25
771 0.27
772 0.28
773 0.31
774 0.35
775 0.36
776 0.4
777 0.46
778 0.53
779 0.53
780 0.56
781 0.61
782 0.64
783 0.65
784 0.7
785 0.71
786 0.74
787 0.82
788 0.83
789 0.81
790 0.75
791 0.69
792 0.62
793 0.6
794 0.56
795 0.56
796 0.52
797 0.49
798 0.47
799 0.43
800 0.4
801 0.34
802 0.27
803 0.18
804 0.16
805 0.16
806 0.14
807 0.14
808 0.15
809 0.15
810 0.16
811 0.15
812 0.18
813 0.15
814 0.16
815 0.16
816 0.17
817 0.17
818 0.19
819 0.22
820 0.21
821 0.22
822 0.21
823 0.21
824 0.2
825 0.19
826 0.17
827 0.14
828 0.11
829 0.09
830 0.07
831 0.08
832 0.07
833 0.08
834 0.08
835 0.1
836 0.11
837 0.11
838 0.16
839 0.17
840 0.19
841 0.23
842 0.31
843 0.38
844 0.4
845 0.47
846 0.47
847 0.54
848 0.62
849 0.66
850 0.67
851 0.68
852 0.73
853 0.72
854 0.78
855 0.79
856 0.75
857 0.74
858 0.69
859 0.66
860 0.59
861 0.55
862 0.55
863 0.48
864 0.47
865 0.43
866 0.43
867 0.38
868 0.42
869 0.42
870 0.39
871 0.37
872 0.34
873 0.31
874 0.34
875 0.33
876 0.31
877 0.36
878 0.31
879 0.38
880 0.38
881 0.39
882 0.32
883 0.3
884 0.29
885 0.22
886 0.21
887 0.14
888 0.14
889 0.17
890 0.23
891 0.29
892 0.34
893 0.38
894 0.45
895 0.55
896 0.63
897 0.7
898 0.73
899 0.78
900 0.82
901 0.87
902 0.9
903 0.89
904 0.9
905 0.88
906 0.83
907 0.73
908 0.64
909 0.56
910 0.5
911 0.43
912 0.37
913 0.28
914 0.26
915 0.25
916 0.23
917 0.24
918 0.21
919 0.18
920 0.16
921 0.16
922 0.14
923 0.17
924 0.17
925 0.15
926 0.15
927 0.2
928 0.19
929 0.22
930 0.24
931 0.22
932 0.25
933 0.31
934 0.39
935 0.41
936 0.47
937 0.46
938 0.48
939 0.48
940 0.5
941 0.49
942 0.43
943 0.39
944 0.32
945 0.31
946 0.29
947 0.28
948 0.23
949 0.2
950 0.23
951 0.22
952 0.25
953 0.29
954 0.31
955 0.38
956 0.41
957 0.43
958 0.41
959 0.41
960 0.38
961 0.39
962 0.37
963 0.35
964 0.35
965 0.33
966 0.29
967 0.27
968 0.27
969 0.21
970 0.19
971 0.14
972 0.11
973 0.1
974 0.09
975 0.08
976 0.06
977 0.05
978 0.05
979 0.04
980 0.04
981 0.04
982 0.04
983 0.04
984 0.06
985 0.07
986 0.07
987 0.1
988 0.1
989 0.12
990 0.17
991 0.19
992 0.19