Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IH88

Protein Details
Accession A0A1B9IH88    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-150YSSRPSKKTTTAKAPSRPKPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 9, cyto 8, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSGFFGFDTSLPERGGQRGPGGGQQHFSGFQASNVDETFALGGAGEEEDLAVYTWGEGGMGGGGLLEGGDELNDETFGDDLGEINNNFQFSSQPATAPPTVKGKIASTQSRYKPKPVSDPFAFSEDDFYSSRPSKKTTTAKAPSRPKPSTGQSGSVENLWNKPAVSSPAWGTAPSAMTKLTPPPSASFPSQPPAPGHIKSLEEIEAEMAQMAIPSTSTAAPTQQKVFSLEEIEKQMMEQIEPPRQATPQQPAPPREATPTQVPGLAGSGYASQQALLDSMFPELGKGPSALGGLAPAFPPGPRQEGQSQPSQPPQPSPEELARMEELHKRITSKIQSMAKYNNLMGSSDKDFITRIQLSQLATADPYTSDFYAQVFSALKRSRMIAEGQGDGPTVVQVGAGMGLGVGGPVGNRFGKMGQNTMTKLSTQVKKLVENRAQHQKITNTAALQGALGRVTRGNAAAPRPVLAIPTSNKPENRPASQLNQQTGIHRAALTKKQVMFALEELYDAILELEQMRREAPPPTAMEEIEIWHAKCQAKVDIIWRRLMVMEPLDISIPHPFISLVNPIKGQKLFPRLLRHLPHTQSITLLSLLIATYTQLDVVFRAPPPPVADASLLTKADRLDRVKREAETDSFLQFVIPGVDMIINRCGLGLVAGMLAISAQRSEVWRVAATRPGVALYTALLSKAQSLIRSPTPDPMNPQQNQQVDPAELEQWSKTFTYFLHVLLPHLNDLFPSSVAQKAAFGPGAYLIGGDAVSDREGQEMERREAEVWGFVAVLAVNAAEEDQTNLVAALREKILHTVQSSRHPNVSPARAEMKLRNVNMFLNGLGLDASMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.26
4 0.26
5 0.27
6 0.28
7 0.31
8 0.34
9 0.32
10 0.3
11 0.28
12 0.28
13 0.26
14 0.25
15 0.23
16 0.19
17 0.18
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.2
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.1
27 0.09
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.02
55 0.02
56 0.03
57 0.03
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.11
70 0.1
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.18
82 0.24
83 0.27
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.31
88 0.31
89 0.32
90 0.29
91 0.32
92 0.38
93 0.43
94 0.41
95 0.49
96 0.56
97 0.64
98 0.65
99 0.67
100 0.67
101 0.65
102 0.7
103 0.68
104 0.69
105 0.62
106 0.64
107 0.58
108 0.53
109 0.48
110 0.37
111 0.34
112 0.26
113 0.25
114 0.2
115 0.18
116 0.22
117 0.26
118 0.31
119 0.29
120 0.33
121 0.34
122 0.43
123 0.52
124 0.54
125 0.6
126 0.65
127 0.71
128 0.77
129 0.83
130 0.82
131 0.82
132 0.76
133 0.69
134 0.67
135 0.65
136 0.65
137 0.59
138 0.56
139 0.48
140 0.48
141 0.45
142 0.4
143 0.38
144 0.29
145 0.27
146 0.22
147 0.21
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.22
159 0.19
160 0.19
161 0.18
162 0.17
163 0.12
164 0.12
165 0.14
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.22
170 0.24
171 0.28
172 0.32
173 0.34
174 0.32
175 0.31
176 0.33
177 0.32
178 0.32
179 0.3
180 0.31
181 0.33
182 0.3
183 0.3
184 0.29
185 0.28
186 0.26
187 0.27
188 0.22
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.13
207 0.16
208 0.19
209 0.22
210 0.22
211 0.23
212 0.25
213 0.26
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.22
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.23
228 0.24
229 0.26
230 0.24
231 0.25
232 0.28
233 0.27
234 0.3
235 0.33
236 0.39
237 0.45
238 0.46
239 0.5
240 0.5
241 0.47
242 0.44
243 0.38
244 0.34
245 0.32
246 0.33
247 0.28
248 0.26
249 0.25
250 0.2
251 0.19
252 0.15
253 0.1
254 0.07
255 0.08
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.08
287 0.09
288 0.14
289 0.14
290 0.18
291 0.23
292 0.29
293 0.32
294 0.37
295 0.38
296 0.36
297 0.41
298 0.41
299 0.36
300 0.33
301 0.34
302 0.31
303 0.3
304 0.31
305 0.28
306 0.28
307 0.27
308 0.26
309 0.24
310 0.2
311 0.21
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.2
318 0.26
319 0.28
320 0.26
321 0.32
322 0.35
323 0.36
324 0.38
325 0.41
326 0.37
327 0.35
328 0.32
329 0.27
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.18
341 0.16
342 0.14
343 0.14
344 0.16
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.19
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.07
381 0.05
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.15
406 0.17
407 0.18
408 0.2
409 0.19
410 0.16
411 0.18
412 0.23
413 0.23
414 0.22
415 0.27
416 0.27
417 0.32
418 0.36
419 0.42
420 0.42
421 0.41
422 0.44
423 0.49
424 0.49
425 0.44
426 0.43
427 0.36
428 0.33
429 0.34
430 0.3
431 0.2
432 0.2
433 0.19
434 0.16
435 0.14
436 0.11
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.09
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.12
454 0.1
455 0.12
456 0.12
457 0.17
458 0.2
459 0.22
460 0.24
461 0.26
462 0.34
463 0.35
464 0.36
465 0.35
466 0.35
467 0.36
468 0.43
469 0.44
470 0.37
471 0.36
472 0.34
473 0.31
474 0.31
475 0.27
476 0.2
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.22
481 0.24
482 0.25
483 0.25
484 0.26
485 0.27
486 0.26
487 0.23
488 0.18
489 0.17
490 0.13
491 0.12
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.06
496 0.05
497 0.03
498 0.03
499 0.04
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.11
507 0.12
508 0.15
509 0.15
510 0.19
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.17
515 0.16
516 0.15
517 0.16
518 0.12
519 0.12
520 0.17
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.18
525 0.19
526 0.2
527 0.28
528 0.32
529 0.33
530 0.34
531 0.31
532 0.29
533 0.28
534 0.27
535 0.2
536 0.13
537 0.12
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.1
550 0.17
551 0.17
552 0.18
553 0.2
554 0.2
555 0.24
556 0.24
557 0.24
558 0.23
559 0.29
560 0.31
561 0.35
562 0.42
563 0.43
564 0.51
565 0.53
566 0.52
567 0.53
568 0.51
569 0.51
570 0.45
571 0.4
572 0.33
573 0.31
574 0.26
575 0.18
576 0.15
577 0.1
578 0.08
579 0.07
580 0.06
581 0.05
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.07
590 0.09
591 0.09
592 0.11
593 0.11
594 0.13
595 0.15
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.18
602 0.2
603 0.18
604 0.16
605 0.17
606 0.16
607 0.18
608 0.23
609 0.25
610 0.3
611 0.35
612 0.41
613 0.44
614 0.44
615 0.44
616 0.42
617 0.4
618 0.36
619 0.32
620 0.27
621 0.23
622 0.22
623 0.18
624 0.14
625 0.12
626 0.09
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.08
631 0.08
632 0.1
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.1
637 0.09
638 0.07
639 0.08
640 0.06
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.05
652 0.07
653 0.1
654 0.13
655 0.15
656 0.16
657 0.19
658 0.21
659 0.25
660 0.24
661 0.22
662 0.21
663 0.19
664 0.18
665 0.15
666 0.13
667 0.08
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.12
675 0.13
676 0.12
677 0.15
678 0.2
679 0.24
680 0.29
681 0.29
682 0.33
683 0.36
684 0.37
685 0.42
686 0.45
687 0.5
688 0.47
689 0.51
690 0.51
691 0.5
692 0.49
693 0.46
694 0.4
695 0.31
696 0.31
697 0.27
698 0.21
699 0.18
700 0.18
701 0.15
702 0.13
703 0.14
704 0.13
705 0.12
706 0.12
707 0.11
708 0.16
709 0.17
710 0.17
711 0.21
712 0.21
713 0.23
714 0.25
715 0.27
716 0.22
717 0.21
718 0.2
719 0.14
720 0.16
721 0.16
722 0.12
723 0.12
724 0.12
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.15
729 0.15
730 0.18
731 0.17
732 0.16
733 0.13
734 0.13
735 0.14
736 0.12
737 0.1
738 0.07
739 0.06
740 0.06
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.08
747 0.08
748 0.09
749 0.11
750 0.17
751 0.22
752 0.25
753 0.26
754 0.28
755 0.27
756 0.29
757 0.28
758 0.23
759 0.18
760 0.15
761 0.13
762 0.11
763 0.11
764 0.08
765 0.08
766 0.05
767 0.05
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.04
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.08
779 0.1
780 0.11
781 0.12
782 0.13
783 0.14
784 0.15
785 0.19
786 0.2
787 0.22
788 0.24
789 0.28
790 0.31
791 0.4
792 0.47
793 0.46
794 0.5
795 0.48
796 0.52
797 0.54
798 0.57
799 0.5
800 0.48
801 0.49
802 0.47
803 0.5
804 0.49
805 0.51
806 0.52
807 0.51
808 0.5
809 0.46
810 0.45
811 0.43
812 0.39
813 0.28
814 0.21
815 0.19
816 0.15
817 0.12
818 0.1