Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IJK6

Protein Details
Accession A0A1B9IJK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-81SRTPSQDRNRRNSQSLRRQLSTSTRQNRNRKHSRSSSLFHydrophilic
226-245ISSSLKTKKHHNSFRPDLGFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF11969  DcpS_C  
PF16278  zf-C2HE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51084  HIT_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MGNCFAPISPDSSDSEVETPAPPGPSTGRSRSSDRQPRPSTSSRTPSQDRNRRNSQSLRRQLSTSTRQNRNRKHSRSSSLFSMGGPSLDALRNYATLSNPRSSLAPSKLLISNKNTIAIFDSYPKAKYHFLILPRYPFPPQSDPDSKESIIPLNALDDLKSLLLSQNRQERDEVMSALYNTALEVEEMIKDEMLKTEGYEWKVDMGFHAIPSMKHIHLHVISDDRISSSLKTKKHHNSFRPDLGFFVPIMEVQRWLEDDSNIQERVEALADAERLLNTPLTCHKCDEFITNIPKLKIHLEKHFVDERASALRHIARHGRQRSSDEDMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.2
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.15
10 0.16
11 0.19
12 0.24
13 0.3
14 0.34
15 0.38
16 0.41
17 0.49
18 0.54
19 0.62
20 0.66
21 0.68
22 0.72
23 0.72
24 0.75
25 0.75
26 0.75
27 0.73
28 0.71
29 0.71
30 0.65
31 0.67
32 0.66
33 0.68
34 0.71
35 0.73
36 0.73
37 0.74
38 0.78
39 0.77
40 0.8
41 0.79
42 0.79
43 0.8
44 0.81
45 0.8
46 0.72
47 0.67
48 0.63
49 0.62
50 0.61
51 0.6
52 0.6
53 0.63
54 0.7
55 0.79
56 0.84
57 0.86
58 0.87
59 0.84
60 0.84
61 0.83
62 0.82
63 0.8
64 0.75
65 0.69
66 0.62
67 0.56
68 0.46
69 0.4
70 0.31
71 0.23
72 0.18
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.16
84 0.2
85 0.21
86 0.2
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.26
91 0.24
92 0.24
93 0.23
94 0.25
95 0.28
96 0.3
97 0.31
98 0.29
99 0.31
100 0.28
101 0.31
102 0.28
103 0.24
104 0.24
105 0.22
106 0.18
107 0.16
108 0.18
109 0.16
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.25
118 0.31
119 0.32
120 0.34
121 0.34
122 0.36
123 0.32
124 0.3
125 0.3
126 0.27
127 0.27
128 0.3
129 0.35
130 0.36
131 0.38
132 0.39
133 0.35
134 0.31
135 0.3
136 0.23
137 0.17
138 0.14
139 0.11
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.14
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.19
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.1
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.14
199 0.18
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.17
216 0.23
217 0.27
218 0.3
219 0.39
220 0.48
221 0.58
222 0.67
223 0.67
224 0.71
225 0.74
226 0.8
227 0.75
228 0.65
229 0.56
230 0.48
231 0.41
232 0.31
233 0.24
234 0.15
235 0.12
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.15
246 0.18
247 0.22
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.12
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.12
264 0.1
265 0.12
266 0.21
267 0.26
268 0.28
269 0.31
270 0.31
271 0.32
272 0.34
273 0.36
274 0.32
275 0.34
276 0.39
277 0.41
278 0.44
279 0.42
280 0.41
281 0.39
282 0.41
283 0.42
284 0.41
285 0.45
286 0.47
287 0.48
288 0.54
289 0.58
290 0.52
291 0.45
292 0.4
293 0.34
294 0.33
295 0.32
296 0.26
297 0.24
298 0.27
299 0.27
300 0.32
301 0.39
302 0.41
303 0.5
304 0.57
305 0.6
306 0.62
307 0.65
308 0.65