Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IZI9

Protein Details
Accession A0A1B9IZI9    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-328NGETTGEKKKVKKKRPPPQTEEQEDEGVKEVKKPKKKKKLNNTNTAAEAHydrophilic
333-385NEETTTAPTKKKKNTNTQKDTNAAQNEAPPPAKKKVQKKKKDDGEKAKNDGTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-297KKKVKKKRPPP
308-318KEVKKPKKKKK
362-378PPAKKKVQKKKKDDGEK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLTVQLHHNYWRFENSPINFQYEGEMKPFLLALRSQVIPSSLIRSLYNIYPTISFVDGCLVVEIQDFRRSPETRSRVVMRPAAETLAQTIDVISERKGQVLDEGMGLELESRIIAATSPPLYLGTSILATRNATLALALTSPANPNLSSDGTARSSSSTGDGTGNDSKSTLDKMRKLLRAGINDRSTSSGGTPFQANWVVLRAKEQFERLKMQREIEAREAANRPPQGMGNGNDPNGMLQNGAEGMGVGGDGIGNGETTGEKKKVKKKRPPPQTEEQEDEGVKEVKKPKKKKKLNNTNTAAEAEATKNEETTTAPTKKKKNTNTQKDTNAAQNEAPPPAKKKVQKKKKDDGEKAKNDGTAGESGAGTGAGLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.66
6 0.73
7 0.78
8 0.74
9 0.72
10 0.72
11 0.69
12 0.69
13 0.73
14 0.68
15 0.61
16 0.6
17 0.58
18 0.52
19 0.52
20 0.46
21 0.39
22 0.39
23 0.42
24 0.38
25 0.38
26 0.43
27 0.39
28 0.43
29 0.42
30 0.44
31 0.38
32 0.36
33 0.36
34 0.31
35 0.3
36 0.23
37 0.22
38 0.17
39 0.17
40 0.18
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.2
61 0.19
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.17
66 0.14
67 0.11
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.1
77 0.16
78 0.16
79 0.18
80 0.26
81 0.27
82 0.31
83 0.39
84 0.43
85 0.41
86 0.46
87 0.49
88 0.48
89 0.52
90 0.52
91 0.43
92 0.4
93 0.37
94 0.33
95 0.28
96 0.22
97 0.18
98 0.14
99 0.13
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.05
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.12
175 0.15
176 0.15
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.21
185 0.26
186 0.33
187 0.36
188 0.37
189 0.41
190 0.4
191 0.43
192 0.43
193 0.45
194 0.4
195 0.37
196 0.36
197 0.32
198 0.28
199 0.21
200 0.18
201 0.14
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.12
209 0.09
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.22
218 0.22
219 0.24
220 0.32
221 0.31
222 0.37
223 0.37
224 0.37
225 0.38
226 0.37
227 0.38
228 0.34
229 0.35
230 0.27
231 0.29
232 0.29
233 0.26
234 0.29
235 0.25
236 0.23
237 0.2
238 0.21
239 0.19
240 0.21
241 0.21
242 0.22
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.21
247 0.19
248 0.16
249 0.15
250 0.08
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.06
271 0.1
272 0.14
273 0.19
274 0.27
275 0.37
276 0.47
277 0.58
278 0.67
279 0.74
280 0.81
281 0.88
282 0.9
283 0.89
284 0.89
285 0.88
286 0.84
287 0.78
288 0.71
289 0.63
290 0.53
291 0.45
292 0.37
293 0.31
294 0.25
295 0.25
296 0.31
297 0.36
298 0.46
299 0.56
300 0.64
301 0.72
302 0.83
303 0.87
304 0.9
305 0.93
306 0.94
307 0.94
308 0.89
309 0.82
310 0.74
311 0.64
312 0.53
313 0.42
314 0.34
315 0.24
316 0.19
317 0.17
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.17
324 0.24
325 0.29
326 0.36
327 0.44
328 0.53
329 0.62
330 0.7
331 0.75
332 0.77
333 0.81
334 0.86
335 0.88
336 0.88
337 0.86
338 0.8
339 0.73
340 0.7
341 0.63
342 0.54
343 0.45
344 0.42
345 0.37
346 0.38
347 0.38
348 0.34
349 0.35
350 0.4
351 0.47
352 0.5
353 0.59
354 0.65
355 0.73
356 0.8
357 0.84
358 0.88
359 0.91
360 0.93
361 0.93
362 0.93
363 0.93
364 0.91
365 0.88
366 0.8
367 0.71
368 0.6
369 0.5
370 0.42
371 0.33
372 0.25
373 0.2
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.12