Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IM36

Protein Details
Accession A0A1B9IM36    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
417-438ERQEHHSKRRRIDDHRRQNEAKBasic
610-632VDESPNRPNKRKRTKADENDEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
969-977GGGGHRRGP
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MVSLFRWLSKKYPKIVNRVVEDTPKKVRTQDGEIEEIPVQYDGPNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEAEMMVEIFKYTERVVNMTRPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKAEEKREAIKMFEAMGHTVSEETQNQKHWDTNAITPGTPFMDLLSISLKYWVSHKLSTDPGWKNLKVILSDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRSHSTWDANTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFAQGNKGPQPCKNCGQTGHLTANCIGEKKAKDPNIVEVAKPVDPKPFIFLDVSCLREYLAVELNVPGVPFPFDHELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLLKIWRAELPRMGGYLTNHGKVNLDRAQVILEGLAKNEDEIFQKRKEDEERQEHHSKRRRIDDHRRQNEAKGNGGGQHTRFDSPPKGTMQLNGQEYVAVQPALTARGGPLHPSLPTRPAFDLVPKEEADKTQTHAVKKAMSNTASNSDIVKNRRAIRMANLSAAEALKAELLGGDNEPETVTVENTEDEEKEQILKDEAKEILEEQGEDEGVDEEIVQPALVTDEDEGEAPIGDETIELDEGVDESPNRPNKRKRTKADENDEEEAEEDDESSSSSSDDDDAPPNPEADQPIPKKKLKVNPDGTVDGYEDDVKLWEPGYRERYYEKKFGVSLSDTEFIQQITKSYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWFYPYHYAPFAQDFKDIGQFKIEFEISEPFKPFAQLLGVFPAASRIHLPEPLQELMINEDSPILDFYPEDFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQDRLLAALESKEKDLKPEERIRNRWGDNIMFVSNQQEYGLSEVCSEMYGLKLKDVHMPVPLNPKQSDGATGSILAVPNYIPYSTFETPIPEIEECPDLTNNNSISVRYYFPKQAHPHRSVILPQYKPGPSRLNESDKDWVRRGGGGGGGHRRGPRQSGGDNRTGGPGMGRGGFHQTPQPRSTNGYPAPSQHDLARHGAAPSSGGYGGGYAPPGNAYNPPRPSYGKGGGGYGGYNAPPPAPAPYGGYGGGYGGYGGAPAGSAYSAPGQGGYGGYGGGSAYSAYNPPPARNTNPYAAPPPNPYGAHPRPAYGAPPPQGGYGGYGGTGGAGGAGGAGRGGYNPYGGGNSAYQPRNGNSGGGGGRGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.78
3 0.77
4 0.73
5 0.71
6 0.67
7 0.67
8 0.64
9 0.6
10 0.6
11 0.56
12 0.51
13 0.5
14 0.54
15 0.5
16 0.53
17 0.56
18 0.51
19 0.53
20 0.51
21 0.51
22 0.44
23 0.37
24 0.3
25 0.21
26 0.17
27 0.11
28 0.16
29 0.16
30 0.19
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.24
35 0.23
36 0.19
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.13
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.17
53 0.2
54 0.2
55 0.27
56 0.33
57 0.36
58 0.41
59 0.4
60 0.39
61 0.37
62 0.39
63 0.34
64 0.3
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.15
69 0.14
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.13
76 0.14
77 0.18
78 0.22
79 0.31
80 0.41
81 0.48
82 0.51
83 0.5
84 0.51
85 0.48
86 0.46
87 0.42
88 0.36
89 0.33
90 0.29
91 0.27
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.2
96 0.15
97 0.1
98 0.13
99 0.2
100 0.26
101 0.37
102 0.46
103 0.55
104 0.66
105 0.74
106 0.8
107 0.81
108 0.78
109 0.74
110 0.75
111 0.72
112 0.68
113 0.67
114 0.6
115 0.54
116 0.51
117 0.46
118 0.36
119 0.35
120 0.29
121 0.24
122 0.25
123 0.29
124 0.28
125 0.29
126 0.31
127 0.25
128 0.25
129 0.26
130 0.23
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.18
140 0.21
141 0.25
142 0.28
143 0.3
144 0.33
145 0.31
146 0.36
147 0.34
148 0.36
149 0.38
150 0.36
151 0.34
152 0.31
153 0.31
154 0.25
155 0.22
156 0.17
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.15
168 0.21
169 0.23
170 0.25
171 0.27
172 0.29
173 0.33
174 0.38
175 0.45
176 0.42
177 0.45
178 0.49
179 0.47
180 0.44
181 0.43
182 0.41
183 0.33
184 0.31
185 0.27
186 0.23
187 0.24
188 0.24
189 0.22
190 0.19
191 0.17
192 0.16
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.2
201 0.26
202 0.35
203 0.42
204 0.48
205 0.52
206 0.56
207 0.59
208 0.61
209 0.6
210 0.59
211 0.53
212 0.54
213 0.52
214 0.45
215 0.42
216 0.37
217 0.29
218 0.23
219 0.2
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.14
238 0.17
239 0.16
240 0.2
241 0.23
242 0.24
243 0.26
244 0.26
245 0.23
246 0.25
247 0.25
248 0.23
249 0.22
250 0.22
251 0.23
252 0.26
253 0.27
254 0.27
255 0.34
256 0.37
257 0.42
258 0.44
259 0.44
260 0.43
261 0.47
262 0.47
263 0.46
264 0.48
265 0.42
266 0.38
267 0.36
268 0.36
269 0.31
270 0.27
271 0.22
272 0.21
273 0.22
274 0.25
275 0.32
276 0.32
277 0.36
278 0.37
279 0.42
280 0.45
281 0.44
282 0.4
283 0.34
284 0.33
285 0.31
286 0.31
287 0.25
288 0.22
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.21
297 0.23
298 0.25
299 0.21
300 0.2
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.15
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.1
313 0.06
314 0.07
315 0.06
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.16
324 0.12
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.07
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.09
360 0.11
361 0.13
362 0.14
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.17
369 0.23
370 0.23
371 0.22
372 0.22
373 0.21
374 0.23
375 0.21
376 0.27
377 0.23
378 0.21
379 0.19
380 0.19
381 0.2
382 0.18
383 0.18
384 0.12
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.14
395 0.18
396 0.2
397 0.23
398 0.24
399 0.28
400 0.34
401 0.39
402 0.44
403 0.49
404 0.51
405 0.56
406 0.64
407 0.63
408 0.66
409 0.67
410 0.65
411 0.62
412 0.68
413 0.68
414 0.7
415 0.77
416 0.79
417 0.81
418 0.82
419 0.83
420 0.74
421 0.71
422 0.69
423 0.59
424 0.51
425 0.41
426 0.34
427 0.3
428 0.31
429 0.28
430 0.21
431 0.21
432 0.19
433 0.19
434 0.19
435 0.2
436 0.22
437 0.22
438 0.25
439 0.24
440 0.25
441 0.24
442 0.25
443 0.26
444 0.28
445 0.27
446 0.24
447 0.22
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.14
452 0.08
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.15
467 0.16
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.2
472 0.21
473 0.2
474 0.22
475 0.25
476 0.22
477 0.23
478 0.21
479 0.22
480 0.21
481 0.21
482 0.2
483 0.17
484 0.16
485 0.21
486 0.24
487 0.24
488 0.27
489 0.28
490 0.29
491 0.3
492 0.33
493 0.3
494 0.28
495 0.28
496 0.26
497 0.28
498 0.24
499 0.23
500 0.19
501 0.17
502 0.21
503 0.22
504 0.24
505 0.26
506 0.29
507 0.31
508 0.32
509 0.3
510 0.31
511 0.36
512 0.34
513 0.3
514 0.27
515 0.24
516 0.23
517 0.22
518 0.16
519 0.08
520 0.07
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.1
601 0.16
602 0.2
603 0.27
604 0.35
605 0.46
606 0.57
607 0.66
608 0.68
609 0.72
610 0.8
611 0.83
612 0.84
613 0.81
614 0.75
615 0.67
616 0.6
617 0.5
618 0.39
619 0.3
620 0.2
621 0.12
622 0.07
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.06
633 0.07
634 0.09
635 0.1
636 0.12
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.13
643 0.2
644 0.22
645 0.3
646 0.36
647 0.38
648 0.41
649 0.45
650 0.51
651 0.52
652 0.57
653 0.56
654 0.55
655 0.57
656 0.54
657 0.49
658 0.42
659 0.34
660 0.24
661 0.18
662 0.13
663 0.09
664 0.07
665 0.07
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.13
672 0.19
673 0.2
674 0.21
675 0.25
676 0.33
677 0.35
678 0.4
679 0.36
680 0.33
681 0.32
682 0.31
683 0.31
684 0.25
685 0.21
686 0.19
687 0.19
688 0.16
689 0.16
690 0.16
691 0.13
692 0.12
693 0.1
694 0.07
695 0.08
696 0.09
697 0.08
698 0.09
699 0.1
700 0.09
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.09
705 0.08
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.09
716 0.1
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.12
721 0.14
722 0.15
723 0.15
724 0.14
725 0.15
726 0.14
727 0.19
728 0.19
729 0.17
730 0.17
731 0.16
732 0.17
733 0.24
734 0.23
735 0.19
736 0.2
737 0.2
738 0.19
739 0.21
740 0.2
741 0.13
742 0.13
743 0.18
744 0.17
745 0.19
746 0.2
747 0.18
748 0.18
749 0.18
750 0.17
751 0.12
752 0.13
753 0.11
754 0.11
755 0.13
756 0.13
757 0.12
758 0.12
759 0.15
760 0.12
761 0.12
762 0.12
763 0.11
764 0.12
765 0.15
766 0.16
767 0.15
768 0.2
769 0.19
770 0.19
771 0.17
772 0.16
773 0.16
774 0.17
775 0.14
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.06
782 0.05
783 0.05
784 0.06
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.1
789 0.1
790 0.11
791 0.13
792 0.13
793 0.1
794 0.1
795 0.09
796 0.1
797 0.12
798 0.13
799 0.11
800 0.1
801 0.12
802 0.14
803 0.15
804 0.14
805 0.12
806 0.1
807 0.1
808 0.11
809 0.09
810 0.06
811 0.05
812 0.06
813 0.07
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.08
818 0.12
819 0.13
820 0.14
821 0.17
822 0.17
823 0.2
824 0.26
825 0.28
826 0.33
827 0.43
828 0.51
829 0.57
830 0.62
831 0.64
832 0.67
833 0.63
834 0.6
835 0.53
836 0.45
837 0.37
838 0.35
839 0.3
840 0.22
841 0.21
842 0.19
843 0.15
844 0.14
845 0.12
846 0.09
847 0.08
848 0.11
849 0.12
850 0.09
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.06
857 0.07
858 0.11
859 0.11
860 0.12
861 0.14
862 0.15
863 0.21
864 0.23
865 0.23
866 0.24
867 0.25
868 0.27
869 0.36
870 0.38
871 0.36
872 0.34
873 0.35
874 0.31
875 0.3
876 0.3
877 0.22
878 0.21
879 0.17
880 0.17
881 0.15
882 0.15
883 0.15
884 0.11
885 0.09
886 0.07
887 0.08
888 0.09
889 0.08
890 0.07
891 0.09
892 0.17
893 0.18
894 0.2
895 0.19
896 0.22
897 0.23
898 0.23
899 0.24
900 0.17
901 0.16
902 0.17
903 0.18
904 0.15
905 0.16
906 0.16
907 0.14
908 0.15
909 0.19
910 0.18
911 0.2
912 0.2
913 0.18
914 0.2
915 0.21
916 0.23
917 0.21
918 0.24
919 0.26
920 0.29
921 0.38
922 0.43
923 0.51
924 0.57
925 0.59
926 0.59
927 0.55
928 0.55
929 0.51
930 0.52
931 0.5
932 0.42
933 0.4
934 0.43
935 0.44
936 0.43
937 0.44
938 0.42
939 0.35
940 0.42
941 0.47
942 0.48
943 0.47
944 0.49
945 0.53
946 0.52
947 0.56
948 0.5
949 0.45
950 0.39
951 0.38
952 0.35
953 0.28
954 0.25
955 0.22
956 0.25
957 0.29
958 0.3
959 0.32
960 0.32
961 0.33
962 0.32
963 0.34
964 0.34
965 0.33
966 0.38
967 0.45
968 0.48
969 0.52
970 0.51
971 0.48
972 0.45
973 0.39
974 0.32
975 0.22
976 0.18
977 0.14
978 0.14
979 0.14
980 0.13
981 0.19
982 0.2
983 0.2
984 0.26
985 0.3
986 0.34
987 0.38
988 0.4
989 0.35
990 0.41
991 0.43
992 0.46
993 0.44
994 0.44
995 0.41
996 0.42
997 0.47
998 0.43
999 0.41
1000 0.34
1001 0.35
1002 0.32
1003 0.34
1004 0.33
1005 0.27
1006 0.25
1007 0.24
1008 0.21
1009 0.18
1010 0.15
1011 0.14
1012 0.11
1013 0.1
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.1
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.07
1020 0.07
1021 0.09
1022 0.1
1023 0.11
1024 0.17
1025 0.22
1026 0.29
1027 0.34
1028 0.37
1029 0.39
1030 0.42
1031 0.46
1032 0.47
1033 0.48
1034 0.46
1035 0.42
1036 0.41
1037 0.38
1038 0.35
1039 0.3
1040 0.23
1041 0.18
1042 0.12
1043 0.13
1044 0.12
1045 0.11
1046 0.1
1047 0.11
1048 0.14
1049 0.14
1050 0.15
1051 0.17
1052 0.19
1053 0.21
1054 0.21
1055 0.2
1056 0.16
1057 0.15
1058 0.14
1059 0.09
1060 0.07
1061 0.05
1062 0.05
1063 0.04
1064 0.04
1065 0.03
1066 0.03
1067 0.03
1068 0.04
1069 0.04
1070 0.04
1071 0.05
1072 0.08
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.09
1076 0.08
1077 0.09
1078 0.09
1079 0.09
1080 0.07
1081 0.06
1082 0.06
1083 0.06
1084 0.05
1085 0.05
1086 0.05
1087 0.04
1088 0.05
1089 0.06
1090 0.08
1091 0.09
1092 0.17
1093 0.18
1094 0.21
1095 0.27
1096 0.33
1097 0.38
1098 0.44
1099 0.49
1100 0.48
1101 0.51
1102 0.53
1103 0.53
1104 0.52
1105 0.49
1106 0.47
1107 0.46
1108 0.45
1109 0.42
1110 0.41
1111 0.44
1112 0.45
1113 0.49
1114 0.45
1115 0.42
1116 0.4
1117 0.41
1118 0.41
1119 0.37
1120 0.4
1121 0.35
1122 0.38
1123 0.38
1124 0.35
1125 0.34
1126 0.31
1127 0.27
1128 0.2
1129 0.17
1130 0.13
1131 0.12
1132 0.1
1133 0.09
1134 0.08
1135 0.05
1136 0.04
1137 0.03
1138 0.03
1139 0.03
1140 0.03
1141 0.03
1142 0.03
1143 0.03
1144 0.03
1145 0.04
1146 0.07
1147 0.07
1148 0.08
1149 0.09
1150 0.1
1151 0.11
1152 0.12
1153 0.13
1154 0.13
1155 0.17
1156 0.25
1157 0.26
1158 0.29
1159 0.31
1160 0.33
1161 0.36
1162 0.35
1163 0.32
1164 0.24
1165 0.28
1166 0.26
1167 0.23
1168 0.22