Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9J1M2

Protein Details
Accession A0A1B9J1M2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
601-626SESIERDKKGKGKKSLRFPRVKVVWEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
607-622DKKGKGKKSLRFPRVK
Subcellular Location(s) mito 14, cyto_mito 10.333, nucl 7.5, cyto_nucl 6.666, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
Amino Acid Sequences MLPFSRLLGGRALSSGSEAAHVPYVKPAHLPIIPPTTLRHRTHSTSAPQAVEDAAEVASDTPSESAVIHQLKRVSELQSRVSRENSKIGKQMIIAQYPDLRALLEYVYDPNLRTNLTFGSLLRYLDSSSRKTTPGGPSLPNMIELFERLSKKQITGNEAKDVVHGFLAANDVLDDHRLLSTFGRLLDRNLAAGFGANTLKQVIWPNGPQTTKPSASAEGSLSNGKAISYNTDKTPIHPQSATLDKFEVALGKSLEPPFEPLFKDGSQWYASRKLDGVRCITFLDFLVPSSSNPESASGIQPLILVSAHFVSRTGKEFTSLIKLEEQLQHLSKLPELRSWLDVDPLIVETRPEGVIKRLVLDGEVCVMRPKTPEESHAAQARDDGSLADTMWIANDNYTEDFQSTVSLMRRSGATIQHLSYFIFDVLSYSELNAKKSLPAQEGLGKRFGKRIEDIRSLGKWLNGHLDDLGVKEKMVRDLKQIKVGDAKEVEEMVERAAREGWEGIILRKDEEYKGKRSTDIRKFKKWLDSEYTVRSIDTSSMRLSVDGVFGEYVALANVWIEHDGHPVSVGSGFTAEQRIRYAKHPEQIVGKMITVEYFSESESIERDKKGKGKKSLRFPRVKVVWEEGKRGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.11
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.16
8 0.17
9 0.15
10 0.21
11 0.23
12 0.22
13 0.24
14 0.24
15 0.25
16 0.27
17 0.28
18 0.28
19 0.33
20 0.33
21 0.32
22 0.35
23 0.39
24 0.46
25 0.47
26 0.48
27 0.48
28 0.53
29 0.59
30 0.62
31 0.59
32 0.59
33 0.6
34 0.54
35 0.48
36 0.43
37 0.36
38 0.28
39 0.22
40 0.13
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.15
54 0.21
55 0.21
56 0.25
57 0.28
58 0.28
59 0.32
60 0.34
61 0.32
62 0.33
63 0.36
64 0.41
65 0.46
66 0.5
67 0.49
68 0.52
69 0.52
70 0.49
71 0.54
72 0.51
73 0.49
74 0.5
75 0.49
76 0.45
77 0.4
78 0.45
79 0.41
80 0.39
81 0.35
82 0.31
83 0.32
84 0.3
85 0.3
86 0.21
87 0.16
88 0.12
89 0.13
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.16
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.18
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.2
113 0.25
114 0.23
115 0.27
116 0.29
117 0.29
118 0.31
119 0.36
120 0.37
121 0.4
122 0.41
123 0.38
124 0.37
125 0.41
126 0.39
127 0.34
128 0.28
129 0.21
130 0.17
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.19
135 0.18
136 0.23
137 0.24
138 0.25
139 0.29
140 0.3
141 0.33
142 0.39
143 0.41
144 0.41
145 0.4
146 0.39
147 0.36
148 0.32
149 0.25
150 0.17
151 0.14
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.17
177 0.16
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.25
194 0.26
195 0.25
196 0.27
197 0.31
198 0.29
199 0.29
200 0.28
201 0.25
202 0.26
203 0.27
204 0.22
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.11
215 0.15
216 0.17
217 0.17
218 0.23
219 0.23
220 0.24
221 0.34
222 0.32
223 0.31
224 0.29
225 0.3
226 0.28
227 0.36
228 0.34
229 0.25
230 0.23
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.17
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.16
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.15
248 0.18
249 0.17
250 0.19
251 0.15
252 0.17
253 0.16
254 0.16
255 0.18
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.22
260 0.24
261 0.25
262 0.28
263 0.29
264 0.22
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.18
269 0.15
270 0.13
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.12
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.11
300 0.13
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.19
306 0.18
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.17
311 0.19
312 0.2
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.16
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.18
323 0.18
324 0.17
325 0.19
326 0.18
327 0.15
328 0.15
329 0.13
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.12
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.13
357 0.17
358 0.18
359 0.21
360 0.25
361 0.28
362 0.32
363 0.36
364 0.34
365 0.27
366 0.28
367 0.26
368 0.19
369 0.16
370 0.12
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.16
399 0.16
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.21
404 0.22
405 0.2
406 0.18
407 0.16
408 0.11
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.2
423 0.25
424 0.21
425 0.21
426 0.22
427 0.28
428 0.32
429 0.32
430 0.35
431 0.32
432 0.3
433 0.33
434 0.33
435 0.3
436 0.3
437 0.36
438 0.37
439 0.41
440 0.42
441 0.43
442 0.41
443 0.4
444 0.37
445 0.32
446 0.25
447 0.21
448 0.26
449 0.21
450 0.21
451 0.18
452 0.18
453 0.16
454 0.17
455 0.18
456 0.11
457 0.1
458 0.11
459 0.13
460 0.2
461 0.24
462 0.24
463 0.31
464 0.39
465 0.43
466 0.49
467 0.48
468 0.43
469 0.45
470 0.44
471 0.41
472 0.34
473 0.32
474 0.25
475 0.24
476 0.22
477 0.16
478 0.16
479 0.11
480 0.13
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.12
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.14
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.18
495 0.2
496 0.2
497 0.3
498 0.33
499 0.35
500 0.41
501 0.42
502 0.46
503 0.51
504 0.58
505 0.59
506 0.65
507 0.66
508 0.7
509 0.74
510 0.75
511 0.77
512 0.71
513 0.67
514 0.65
515 0.64
516 0.59
517 0.59
518 0.57
519 0.47
520 0.43
521 0.36
522 0.28
523 0.25
524 0.23
525 0.19
526 0.17
527 0.18
528 0.18
529 0.18
530 0.18
531 0.15
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.08
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.13
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.11
557 0.08
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.2
565 0.24
566 0.25
567 0.31
568 0.4
569 0.4
570 0.46
571 0.48
572 0.48
573 0.5
574 0.51
575 0.5
576 0.42
577 0.36
578 0.31
579 0.27
580 0.24
581 0.18
582 0.16
583 0.13
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.15
590 0.2
591 0.21
592 0.24
593 0.26
594 0.32
595 0.4
596 0.49
597 0.57
598 0.62
599 0.68
600 0.74
601 0.82
602 0.87
603 0.89
604 0.89
605 0.84
606 0.84
607 0.8
608 0.77
609 0.71
610 0.69
611 0.68
612 0.62