Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YPF1

Protein Details
Accession C7YPF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-46QTEPEPKRASRFDRRSRSPPARRTEPGRDRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-43PKRASRFDRRSRSPPARRTEPGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR031121  RIK/BLOM7  
IPR010378  TRAPPC13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_37787  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
PF00013  KH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
CDD cd22385  KH-I_KHDC4_rpt1  
cd22386  KH-I_KHDC4_rpt2  
Amino Acid Sequences MDDTERRTVKRSRFDQTEPEPKRASRFDRRSRSPPARRTEPGRDRSPLGNDGGSDPKKSPGDAAAAAAAAAARINAQLQARKGIQHVDVPPIKPAESSPAAPAPTSQSSSKTAPALNGEMYVADGDYIQDIEVNDLRNRYLLTKGSTQKMIKDDTGADVTTRGNYYPNKSMATAANPPLYLHVTSTSKQGLESAVAKINELIQQELPQLVDERRFRRRDQEQVERDEFGRRKWPEEKIPITLEPVHGFNLRAQVVGHGGAYVKHIQQETGCRVQIKGRGSGYLEAATNRESDEDMFLHVTGPDANMVEKAKELCEDLIANVKEQYEEFKTRPPRYGGDRYGGDRNHSHGGSHGGSHNSYGGSHGGSGGYGGYGSGSGGASNNSPAPPGVNSPTNAADYAAQYAQYYGGADPYAAYGGYANYVAMYQQYYGAQAQAQTQGQGSPAGAPGQSASPPPPPPSEAAPPPPPPPSSAPPPPPPSGSPPAAGGSYGAVFALELQHGKMSHQRYPSHDPVKEPHSISLKVLRLSRPSLVTQYPIDPPSSIGATIKPAPAPASLAYRSETTSNPSPFLLSPIVNLPVSFGSAYVGETFSCTLCANNDLLPDVPKNIRDVRIDAEMKTPGLGAVQRLELGPPTDKPEADLDSGGTLQRVVSFDLKEEGNHVLAVTVSYYEATETSGRTRTFRKLYQFICKASLIVRTKVGPLKAAAGDGQPRRWALEAQLENCSEDVVQLEKVVLDTEPGLRYRDCNWEASGSTKPVLHPGEVEQVCFVVEDSSGTGTPGGDVEVTPDGRIIFGSLGIGWRGEMGNRGFLSTGKLGTRVAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.74
4 0.76
5 0.7
6 0.7
7 0.66
8 0.6
9 0.62
10 0.61
11 0.61
12 0.61
13 0.67
14 0.71
15 0.77
16 0.83
17 0.83
18 0.86
19 0.87
20 0.87
21 0.85
22 0.84
23 0.82
24 0.8
25 0.81
26 0.82
27 0.81
28 0.79
29 0.77
30 0.71
31 0.67
32 0.65
33 0.63
34 0.55
35 0.48
36 0.41
37 0.35
38 0.35
39 0.4
40 0.36
41 0.33
42 0.3
43 0.33
44 0.33
45 0.33
46 0.31
47 0.25
48 0.29
49 0.27
50 0.27
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.12
56 0.07
57 0.06
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.05
62 0.09
63 0.13
64 0.17
65 0.19
66 0.26
67 0.27
68 0.28
69 0.3
70 0.31
71 0.3
72 0.32
73 0.33
74 0.36
75 0.39
76 0.38
77 0.4
78 0.37
79 0.35
80 0.29
81 0.28
82 0.26
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.28
87 0.28
88 0.27
89 0.28
90 0.26
91 0.26
92 0.28
93 0.26
94 0.25
95 0.29
96 0.32
97 0.34
98 0.31
99 0.29
100 0.28
101 0.3
102 0.29
103 0.25
104 0.23
105 0.19
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.09
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.1
119 0.12
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.19
128 0.2
129 0.23
130 0.31
131 0.36
132 0.39
133 0.45
134 0.45
135 0.46
136 0.46
137 0.45
138 0.38
139 0.35
140 0.31
141 0.27
142 0.28
143 0.23
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.12
150 0.15
151 0.19
152 0.24
153 0.29
154 0.32
155 0.32
156 0.32
157 0.34
158 0.32
159 0.33
160 0.33
161 0.3
162 0.3
163 0.28
164 0.27
165 0.26
166 0.26
167 0.21
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.23
173 0.23
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.19
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.13
196 0.12
197 0.19
198 0.24
199 0.29
200 0.37
201 0.41
202 0.42
203 0.49
204 0.55
205 0.59
206 0.61
207 0.66
208 0.64
209 0.69
210 0.69
211 0.61
212 0.54
213 0.53
214 0.45
215 0.37
216 0.4
217 0.33
218 0.36
219 0.41
220 0.47
221 0.47
222 0.55
223 0.56
224 0.51
225 0.53
226 0.48
227 0.46
228 0.4
229 0.33
230 0.26
231 0.23
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.19
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.21
255 0.24
256 0.27
257 0.28
258 0.25
259 0.26
260 0.3
261 0.33
262 0.29
263 0.29
264 0.25
265 0.26
266 0.27
267 0.28
268 0.25
269 0.21
270 0.19
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.17
312 0.14
313 0.17
314 0.18
315 0.24
316 0.33
317 0.35
318 0.39
319 0.39
320 0.38
321 0.42
322 0.5
323 0.46
324 0.42
325 0.42
326 0.4
327 0.43
328 0.4
329 0.35
330 0.28
331 0.28
332 0.27
333 0.25
334 0.22
335 0.17
336 0.21
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.16
380 0.15
381 0.15
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.11
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.12
440 0.13
441 0.16
442 0.17
443 0.17
444 0.18
445 0.21
446 0.24
447 0.23
448 0.27
449 0.3
450 0.31
451 0.32
452 0.33
453 0.3
454 0.28
455 0.3
456 0.29
457 0.31
458 0.35
459 0.38
460 0.42
461 0.47
462 0.45
463 0.43
464 0.41
465 0.4
466 0.39
467 0.35
468 0.29
469 0.25
470 0.25
471 0.22
472 0.2
473 0.14
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.08
488 0.13
489 0.16
490 0.2
491 0.26
492 0.29
493 0.34
494 0.42
495 0.5
496 0.52
497 0.5
498 0.48
499 0.46
500 0.47
501 0.46
502 0.38
503 0.34
504 0.32
505 0.31
506 0.3
507 0.33
508 0.32
509 0.3
510 0.32
511 0.3
512 0.28
513 0.3
514 0.31
515 0.26
516 0.25
517 0.26
518 0.24
519 0.24
520 0.22
521 0.22
522 0.23
523 0.21
524 0.2
525 0.17
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.12
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.14
534 0.14
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.12
541 0.15
542 0.15
543 0.16
544 0.17
545 0.17
546 0.18
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.25
551 0.25
552 0.25
553 0.24
554 0.24
555 0.22
556 0.25
557 0.22
558 0.14
559 0.14
560 0.15
561 0.17
562 0.15
563 0.15
564 0.13
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.07
576 0.08
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.08
582 0.1
583 0.1
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.12
588 0.14
589 0.13
590 0.15
591 0.16
592 0.16
593 0.19
594 0.22
595 0.26
596 0.26
597 0.28
598 0.27
599 0.34
600 0.34
601 0.31
602 0.3
603 0.27
604 0.25
605 0.23
606 0.19
607 0.11
608 0.12
609 0.11
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.12
618 0.13
619 0.13
620 0.18
621 0.2
622 0.2
623 0.21
624 0.23
625 0.24
626 0.23
627 0.22
628 0.17
629 0.16
630 0.17
631 0.15
632 0.11
633 0.08
634 0.07
635 0.09
636 0.09
637 0.11
638 0.14
639 0.14
640 0.15
641 0.18
642 0.18
643 0.16
644 0.17
645 0.17
646 0.14
647 0.14
648 0.12
649 0.1
650 0.09
651 0.09
652 0.07
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.08
660 0.09
661 0.1
662 0.13
663 0.19
664 0.2
665 0.23
666 0.27
667 0.33
668 0.39
669 0.44
670 0.5
671 0.52
672 0.57
673 0.64
674 0.66
675 0.6
676 0.57
677 0.51
678 0.43
679 0.36
680 0.4
681 0.34
682 0.3
683 0.31
684 0.28
685 0.33
686 0.36
687 0.36
688 0.29
689 0.26
690 0.28
691 0.26
692 0.25
693 0.22
694 0.2
695 0.27
696 0.28
697 0.29
698 0.28
699 0.27
700 0.28
701 0.29
702 0.27
703 0.23
704 0.29
705 0.33
706 0.32
707 0.37
708 0.35
709 0.34
710 0.33
711 0.3
712 0.19
713 0.14
714 0.13
715 0.1
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.09
720 0.09
721 0.1
722 0.08
723 0.07
724 0.08
725 0.12
726 0.14
727 0.15
728 0.18
729 0.18
730 0.2
731 0.23
732 0.32
733 0.3
734 0.31
735 0.32
736 0.33
737 0.33
738 0.35
739 0.36
740 0.29
741 0.28
742 0.27
743 0.25
744 0.29
745 0.3
746 0.28
747 0.25
748 0.25
749 0.34
750 0.32
751 0.32
752 0.25
753 0.23
754 0.22
755 0.2
756 0.17
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.08
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.07
770 0.07
771 0.1
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.15
776 0.14
777 0.14
778 0.14
779 0.12
780 0.08
781 0.08
782 0.09
783 0.08
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.09
788 0.1
789 0.1
790 0.1
791 0.16
792 0.16
793 0.22
794 0.22
795 0.23
796 0.22
797 0.22
798 0.27
799 0.24
800 0.26
801 0.2
802 0.22