Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9J0W5

Protein Details
Accession A0A1B9J0W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-276VPVANAKKEKPKQKTQAELDEEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-245PKGHASAKTKGKATKLSTGNAKVGRAKAKAAGK
260-264KKEKP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10, cyto_nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAYNYSNPYQSTSAPPARPFNPPSSSSAAVTSQARQVLFSGLPVDISEKDLRELLLSDPLRLSPITTSVTCFSGPDGRFCGIALVYVANAADAEKIRTNYSGQQIDGTYTMSVQHILPANQSLSAASTSITAPSTSVPRPTNPAKAPKNKTNGAATPNPKVDEKPAGLKLLARLSKPAQGKDKQLALLEKQKANLAKSGASGAALLSRLQGSPKGHASAKTKGKATKLSTGNAKVGRAKAKAAGKDAMDVDKPVPVANAKKEKPKQKTQAELDEEMRAYERARRFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.49
4 0.49
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.48
9 0.46
10 0.47
11 0.47
12 0.47
13 0.4
14 0.38
15 0.32
16 0.3
17 0.3
18 0.26
19 0.23
20 0.24
21 0.23
22 0.21
23 0.2
24 0.2
25 0.18
26 0.17
27 0.15
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.1
33 0.14
34 0.16
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.16
41 0.13
42 0.19
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.09
51 0.12
52 0.15
53 0.14
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.21
65 0.21
66 0.21
67 0.2
68 0.12
69 0.12
70 0.1
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.19
87 0.25
88 0.24
89 0.22
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.1
122 0.1
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.21
127 0.23
128 0.29
129 0.3
130 0.39
131 0.42
132 0.51
133 0.56
134 0.58
135 0.61
136 0.57
137 0.56
138 0.51
139 0.46
140 0.41
141 0.42
142 0.38
143 0.36
144 0.35
145 0.33
146 0.3
147 0.27
148 0.25
149 0.23
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.24
158 0.24
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.27
163 0.29
164 0.31
165 0.32
166 0.33
167 0.38
168 0.39
169 0.41
170 0.36
171 0.36
172 0.34
173 0.3
174 0.35
175 0.36
176 0.32
177 0.3
178 0.32
179 0.32
180 0.31
181 0.3
182 0.23
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.13
198 0.14
199 0.17
200 0.2
201 0.23
202 0.24
203 0.3
204 0.34
205 0.38
206 0.45
207 0.46
208 0.48
209 0.48
210 0.51
211 0.54
212 0.54
213 0.54
214 0.49
215 0.49
216 0.52
217 0.51
218 0.53
219 0.47
220 0.45
221 0.41
222 0.42
223 0.44
224 0.38
225 0.36
226 0.37
227 0.41
228 0.42
229 0.42
230 0.41
231 0.35
232 0.37
233 0.37
234 0.33
235 0.28
236 0.25
237 0.21
238 0.19
239 0.19
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.21
244 0.29
245 0.39
246 0.41
247 0.52
248 0.6
249 0.69
250 0.73
251 0.78
252 0.79
253 0.79
254 0.85
255 0.82
256 0.84
257 0.8
258 0.76
259 0.68
260 0.62
261 0.52
262 0.43
263 0.36
264 0.27
265 0.22
266 0.25