FuNGI

A0A1B9J1R4

Protein Details

Accession

A0A1B9J1R4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-520	EMEAQAKRRRKQCKGSKAPGSKY	Hydrophilic
658-680	NPQPRPQQQYYPQRQQQQQNFPY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
506-507	RR
593-624	RGGRGRGRGRGQGRDRGRGRGGSGGGGGRGHG

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSPLPAKPDLEIKMEDHISDSSDAELEAAIQVEPEVEPEVESSETSAPSASTSFKLPPNPIMPQDLSLIMEMVSKNEVVGSLPPISMSAAEKRKLVEQSLKGKGKDTETEIPQQKLQEEEEDTDSDSSSEFVTSSEDESEKEDVPMNQVQHQQLKQELDEFVGSSNHVEVESDSDSDEEGEGDESYGGLGQMGFESMEDSEDDGPATAGPITSLHEAPLPPVAQPPMIKLPEGEGVSLAGEVVSWMREKKVEVWLEKRRLEEEQIKMKEKIEEGNVSEQKQDNKAEGPANENEDVMGATTIDQSNDKIKSETEDTKEHLTEVAALQTSKEEGEVVEGGTVLQSTLEVPDTCKEHEEIAQQPKKTLTPSKAKAVEPKFTSSGTVVVRAMQSRPGAADEGWLEEGSVLCWEDGRVLGTVHETFGPLTSPFYTIRLPPPPFPYPSPQSLSAGSKLFYPMNTSYRSFVNMLTIRDPRFKGSDASNLYDEEIGEDEMEWSDDEMEAQAKRRRKQCKGSKAPGSKYGTVQNIPGLPNRPHFDYDHDGSETASLHGEAEEDNWETGSSFSTRSRKEPEPYDINIDDSPQTQRSHQSPNQRGGRGRGRGRGQGRDRGRGRGGSGGGGGRGHGSRGSNSHNSNNDRQQFSLPLNPMMTQPQYQQQYNPQPRPQQQYYPQRQQQQQNFPYFPQPQQSYQSYPYPQMGFTQQQHQPQYDNHNDTYEPNQPSTGMPTFPNYQQQQGYLQQQQQNFGSQSVPAINPRFAAQYAQMISNQSPQQGQGQAQGQQGYGYGYGSQNQDHQYSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.27
4	0.24
5	0.22
6	0.21
7	0.2
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.11
12	0.1
13	0.08
14	0.07
15	0.07
16	0.06
17	0.06
18	0.06
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.09
23	0.08
24	0.09
25	0.09
26	0.12
27	0.12
28	0.12
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.11
35	0.11
36	0.13
37	0.13
38	0.12
39	0.15
40	0.2
41	0.24
42	0.3
43	0.32
44	0.38
45	0.41
46	0.44
47	0.44
48	0.46
49	0.42
50	0.38
51	0.37
52	0.31
53	0.26
54	0.21
55	0.19
56	0.13
57	0.14
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.08
66	0.1
67	0.12
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.13
73	0.14
74	0.15
75	0.2
76	0.25
77	0.27
78	0.28
79	0.29
80	0.35
81	0.37
82	0.39
83	0.4
84	0.42
85	0.49
86	0.58
87	0.63
88	0.57
89	0.58
90	0.57
91	0.52
92	0.49
93	0.47
94	0.45
95	0.43
96	0.52
97	0.53
98	0.51
99	0.49
100	0.46
101	0.41
102	0.35
103	0.33
104	0.28
105	0.26
106	0.27
107	0.27
108	0.26
109	0.26
110	0.23
111	0.21
112	0.17
113	0.14
114	0.11
115	0.08
116	0.08
117	0.06
118	0.06
119	0.08
120	0.09
121	0.11
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.16
126	0.19
127	0.17
128	0.17
129	0.19
130	0.17
131	0.21
132	0.24
133	0.23
134	0.25
135	0.3
136	0.33
137	0.37
138	0.38
139	0.36
140	0.37
141	0.38
142	0.34
143	0.32
144	0.28
145	0.22
146	0.21
147	0.19
148	0.15
149	0.13
150	0.12
151	0.1
152	0.1
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.07
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.12
203	0.12
204	0.13
205	0.16
206	0.14
207	0.12
208	0.14
209	0.15
210	0.15
211	0.15
212	0.18
213	0.22
214	0.22
215	0.22
216	0.2
217	0.21
218	0.24
219	0.24
220	0.2
221	0.13
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.09
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.07
234	0.08
235	0.1
236	0.13
237	0.21
238	0.26
239	0.3
240	0.39
241	0.47
242	0.53
243	0.55
244	0.53
245	0.47
246	0.43
247	0.44
248	0.43
249	0.41
250	0.43
251	0.46
252	0.48
253	0.47
254	0.46
255	0.43
256	0.37
257	0.33
258	0.27
259	0.25
260	0.23
261	0.31
262	0.32
263	0.3
264	0.32
265	0.31
266	0.3
267	0.31
268	0.3
269	0.22
270	0.21
271	0.24
272	0.24
273	0.23
274	0.24
275	0.22
276	0.24
277	0.23
278	0.21
279	0.18
280	0.15
281	0.14
282	0.1
283	0.08
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.12
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.14
296	0.16
297	0.21
298	0.25
299	0.25
300	0.26
301	0.27
302	0.3
303	0.3
304	0.27
305	0.22
306	0.17
307	0.14
308	0.12
309	0.11
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.04
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.14
342	0.17
343	0.21
344	0.29
345	0.33
346	0.32
347	0.32
348	0.33
349	0.31
350	0.31
351	0.31
352	0.27
353	0.33
354	0.36
355	0.43
356	0.46
357	0.46
358	0.51
359	0.49
360	0.49
361	0.41
362	0.41
363	0.35
364	0.3
365	0.3
366	0.22
367	0.22
368	0.16
369	0.16
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.1
383	0.07
384	0.08
385	0.09
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.09
415	0.11
416	0.12
417	0.12
418	0.17
419	0.23
420	0.25
421	0.26
422	0.31
423	0.32
424	0.34
425	0.35
426	0.37
427	0.33
428	0.35
429	0.36
430	0.31
431	0.3
432	0.3
433	0.29
434	0.25
435	0.22
436	0.18
437	0.16
438	0.16
439	0.15
440	0.12
441	0.15
442	0.15
443	0.17
444	0.2
445	0.2
446	0.2
447	0.2
448	0.23
449	0.19
450	0.16
451	0.2
452	0.2
453	0.2
454	0.23
455	0.25
456	0.25
457	0.29
458	0.29
459	0.25
460	0.24
461	0.24
462	0.23
463	0.22
464	0.28
465	0.26
466	0.28
467	0.27
468	0.25
469	0.24
470	0.22
471	0.19
472	0.12
473	0.1
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.05
481	0.04
482	0.05
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.06
487	0.07
488	0.12
489	0.17
490	0.24
491	0.3
492	0.38
493	0.47
494	0.54
495	0.65
496	0.7
497	0.76
498	0.8
499	0.83
500	0.86
501	0.85
502	0.8
503	0.78
504	0.73
505	0.63
506	0.55
507	0.52
508	0.45
509	0.37
510	0.34
511	0.28
512	0.25
513	0.24
514	0.25
515	0.23
516	0.22
517	0.26
518	0.28
519	0.29
520	0.28
521	0.28
522	0.31
523	0.32
524	0.32
525	0.31
526	0.29
527	0.26
528	0.24
529	0.24
530	0.18
531	0.13
532	0.11
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.08
548	0.09
549	0.15
550	0.22
551	0.24
552	0.29
553	0.35
554	0.39
555	0.44
556	0.48
557	0.51
558	0.5
559	0.5
560	0.52
561	0.45
562	0.42
563	0.36
564	0.32
565	0.25
566	0.2
567	0.21
568	0.18
569	0.19
570	0.18
571	0.24
572	0.26
573	0.35
574	0.38
575	0.46
576	0.5
577	0.58
578	0.64
579	0.63
580	0.61
581	0.6
582	0.64
583	0.62
584	0.6
585	0.58
586	0.55
587	0.59
588	0.62
589	0.64
590	0.6
591	0.61
592	0.61
593	0.63
594	0.61
595	0.59
596	0.57
597	0.49
598	0.45
599	0.41
600	0.37
601	0.28
602	0.27
603	0.21
604	0.19
605	0.17
606	0.15
607	0.11
608	0.11
609	0.1
610	0.11
611	0.12
612	0.13
613	0.17
614	0.23
615	0.28
616	0.31
617	0.37
618	0.43
619	0.47
620	0.52
621	0.58
622	0.59
623	0.55
624	0.53
625	0.48
626	0.44
627	0.41
628	0.41
629	0.34
630	0.3
631	0.29
632	0.28
633	0.26
634	0.27
635	0.26
636	0.21
637	0.21
638	0.26
639	0.3
640	0.31
641	0.33
642	0.39
643	0.47
644	0.56
645	0.61
646	0.61
647	0.65
648	0.71
649	0.77
650	0.73
651	0.71
652	0.71
653	0.74
654	0.77
655	0.79
656	0.78
657	0.78
658	0.8
659	0.81
660	0.81
661	0.8
662	0.78
663	0.76
664	0.71
665	0.64
666	0.65
667	0.59
668	0.52
669	0.5
670	0.46
671	0.42
672	0.46
673	0.49
674	0.46
675	0.46
676	0.5
677	0.44
678	0.43
679	0.44
680	0.39
681	0.35
682	0.32
683	0.34
684	0.33
685	0.33
686	0.39
687	0.39
688	0.45
689	0.48
690	0.47
691	0.45
692	0.43
693	0.49
694	0.5
695	0.51
696	0.45
697	0.43
698	0.42
699	0.42
700	0.42
701	0.41
702	0.35
703	0.3
704	0.3
705	0.28
706	0.28
707	0.32
708	0.29
709	0.23
710	0.21
711	0.24
712	0.28
713	0.3
714	0.38
715	0.34
716	0.37
717	0.37
718	0.38
719	0.39
720	0.41
721	0.45
722	0.43
723	0.48
724	0.48
725	0.48
726	0.5
727	0.47
728	0.46
729	0.4
730	0.34
731	0.28
732	0.23
733	0.23
734	0.23
735	0.23
736	0.23
737	0.25
738	0.25
739	0.25
740	0.26
741	0.27
742	0.24
743	0.25
744	0.21
745	0.24
746	0.25
747	0.26
748	0.26
749	0.26
750	0.27
751	0.32
752	0.31
753	0.26
754	0.25
755	0.25
756	0.29
757	0.3
758	0.3
759	0.29
760	0.32
761	0.35
762	0.37
763	0.37
764	0.31
765	0.28
766	0.27
767	0.22
768	0.18
769	0.13
770	0.12
771	0.12
772	0.16
773	0.18
774	0.19
775	0.23
776	0.26

A0A1B9J1R4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer