Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IXH8

Protein Details
Accession A0A1B9IXH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
488-512DEDSGKKSKKDKGGKKAKPSVQDDDBasic
551-572MEELKRKQAKRAKKDSGSGSDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
493-505KKSKKDKGGKKAK
555-584KRKQAKRAKKDSGSGSDAEKPKAKKAKKGD
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, cyto 11, nucl 9, mito 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR000969  SSRP1/POB3  
IPR035417  SSRP1/POB3_N  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF17292  POB3_N  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
CDD cd13230  PH1_SSRP1-like  
cd13231  PH2_SSRP1-like  
Amino Acid Sequences MATVTFENIFHGDSPDIGKLRFNAAGFGWKTYASEEAPTTFSGHDVRHATWLRVARNFQLRLAMRQAEKPRITFDGFKREDHDKVKRTLDEFFNIKMETRDTSLKGWNWGKAQVQGNDITFQVQGKTAFEIPLSTVGNSNIAGKNEVALEFNPPPPFPHDPKDLSKRVPDELVEMRFYIPGKSMKSKGSDAGSDGEETDLDEDGNEVSAADAFHNMIKEKADIGAVVGDSIVVFEDILVLTPRGRFSLEFYPDSLRLLGKSTDYRVPFTSIHRIFLLPKLDDLHVQLVLGLDPPIRQGATRYPFLVAQWPKDEEVDAELNLSDEELAKYPDLQRKYEAPTFQVISRVLKALTGKKVTPPGSFRTAQGLNGLKANVKAVQGELYFLEKGLIFIAKQPILIDFSKTESISFSRVGGGIASAKTFDMRVVSKTEVADHVFTAISKEEVQPISAFLKQKNIKLLNEMEETVMDIDEPLSDEDEEMESIASEDEDSGKKSKKDKGGKKAKPSVQDDDDESDDEDFQSESSDGGSPSESDSDEDESGMASDASDPMMEELKRKQAKRAKKDSGSGSDAEKPKAKKAKKGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.21
7 0.26
8 0.28
9 0.25
10 0.23
11 0.22
12 0.3
13 0.29
14 0.3
15 0.26
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.25
20 0.17
21 0.19
22 0.18
23 0.19
24 0.21
25 0.21
26 0.22
27 0.18
28 0.19
29 0.19
30 0.18
31 0.22
32 0.24
33 0.24
34 0.31
35 0.33
36 0.33
37 0.35
38 0.4
39 0.39
40 0.42
41 0.44
42 0.42
43 0.49
44 0.49
45 0.45
46 0.48
47 0.45
48 0.43
49 0.47
50 0.45
51 0.38
52 0.45
53 0.51
54 0.51
55 0.52
56 0.49
57 0.47
58 0.46
59 0.47
60 0.47
61 0.46
62 0.47
63 0.47
64 0.47
65 0.48
66 0.47
67 0.5
68 0.51
69 0.55
70 0.5
71 0.54
72 0.59
73 0.59
74 0.56
75 0.56
76 0.52
77 0.49
78 0.45
79 0.41
80 0.37
81 0.33
82 0.32
83 0.26
84 0.24
85 0.2
86 0.21
87 0.23
88 0.22
89 0.25
90 0.31
91 0.31
92 0.38
93 0.39
94 0.4
95 0.38
96 0.4
97 0.39
98 0.4
99 0.44
100 0.38
101 0.38
102 0.36
103 0.35
104 0.32
105 0.29
106 0.23
107 0.17
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.18
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.1
136 0.15
137 0.15
138 0.19
139 0.2
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.31
144 0.3
145 0.33
146 0.37
147 0.41
148 0.49
149 0.56
150 0.55
151 0.52
152 0.54
153 0.51
154 0.46
155 0.43
156 0.35
157 0.31
158 0.32
159 0.3
160 0.25
161 0.23
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.16
166 0.15
167 0.17
168 0.2
169 0.24
170 0.27
171 0.29
172 0.33
173 0.34
174 0.34
175 0.33
176 0.29
177 0.26
178 0.25
179 0.22
180 0.18
181 0.17
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.12
234 0.2
235 0.23
236 0.23
237 0.24
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.23
242 0.15
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.19
250 0.19
251 0.21
252 0.2
253 0.23
254 0.22
255 0.24
256 0.31
257 0.26
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.23
262 0.25
263 0.26
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.14
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.13
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.25
293 0.2
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.12
301 0.14
302 0.12
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.12
317 0.17
318 0.19
319 0.2
320 0.22
321 0.25
322 0.3
323 0.34
324 0.3
325 0.27
326 0.27
327 0.28
328 0.26
329 0.26
330 0.21
331 0.19
332 0.19
333 0.18
334 0.14
335 0.14
336 0.17
337 0.19
338 0.23
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.33
343 0.34
344 0.34
345 0.33
346 0.32
347 0.35
348 0.35
349 0.32
350 0.32
351 0.3
352 0.27
353 0.29
354 0.27
355 0.22
356 0.22
357 0.22
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.14
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.09
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.17
386 0.16
387 0.12
388 0.15
389 0.17
390 0.17
391 0.16
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.12
413 0.15
414 0.17
415 0.19
416 0.19
417 0.2
418 0.2
419 0.2
420 0.19
421 0.15
422 0.15
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.11
430 0.14
431 0.14
432 0.16
433 0.14
434 0.16
435 0.17
436 0.2
437 0.22
438 0.18
439 0.28
440 0.31
441 0.34
442 0.41
443 0.43
444 0.41
445 0.44
446 0.46
447 0.42
448 0.4
449 0.37
450 0.28
451 0.23
452 0.23
453 0.18
454 0.14
455 0.09
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.07
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.08
476 0.09
477 0.12
478 0.16
479 0.22
480 0.27
481 0.33
482 0.41
483 0.48
484 0.58
485 0.66
486 0.72
487 0.78
488 0.83
489 0.87
490 0.89
491 0.85
492 0.84
493 0.8
494 0.77
495 0.7
496 0.64
497 0.57
498 0.51
499 0.47
500 0.38
501 0.33
502 0.25
503 0.21
504 0.18
505 0.15
506 0.1
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.15
522 0.18
523 0.17
524 0.17
525 0.15
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.1
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.13
538 0.13
539 0.16
540 0.2
541 0.3
542 0.38
543 0.4
544 0.48
545 0.53
546 0.64
547 0.71
548 0.77
549 0.78
550 0.78
551 0.85
552 0.83
553 0.82
554 0.75
555 0.66
556 0.6
557 0.58
558 0.54
559 0.51
560 0.49
561 0.44
562 0.49
563 0.57
564 0.59