FuNGI

A0A1B9IM88

Protein Details

Accession

A0A1B9IM88

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	SDAALFLRKRKDKDRRNRVPSRSVGGP	Hydrophilic
173-199	SNEDHPPPPTKGKRKMKKGTKEVLHQD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-19	RKRKDKDRRNR
181-191	PTKGKRKMKKG
451-461	KQLKKIMKKRR
499-536	KKPLADGDRPSRPPSRGPGSRGTSSPTGKRPNGPMPGK
628-639	AKGNKSGKRKTT
655-677	SPSSKRKNSPSEAGRVGKKSKKS

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSDAALFLRKRKDKDRRNRVPSRSVGGPSTSTSTSASGPSPSTRPSNAAASSSTSTTIKPESSDTTNGKNPNITEIKIFSSGSDGGLRFNFMRLNHEKEIDPSQIGRTVLLNRKRPGPKQPPLFALDGEGKIMGKYVYDASGKPVLDAEGKPVVEKKPEGMDMSLIGTAPPGSNEDHPPPPTKGKRKMKKGTKEVLHQDVEVMRLRREEAQPWILENSKPRSSTGANSNIPETWVGRMQEPSALPTVLLINDGTTDGFEMVPLGRTYRFDPERPFKALDSDEAIKLFEHQAKHKIHDRWALRPEGSDTNGNGSTSEGPVLNIKAERDLEQRAMRWEGRMRLNNGNLEDRKPKIEKYEDDYVKEGRRAERGLEGGIDEELDFDEAEHFQDDDDVNTFYRNAEEEDDAKEAEEQQKKEFRLANANVGDKPQIAEDDDEDDLFGERKKYSEEGKQLKKIMKKRREEGEDDNLFSDDDSDDSDTESIDSKTSQNKDQDKDKDKKPLADGDRPSRPPSRGPGSRGTSSPTGKRPNGPMPGKASTAPPGSGAALLAQRAASRGASPRPSGGARAGSPLSGRAASPEGRATSPVMRGNSPVPGRGQSPGPARGSSPVSGHSTRDASPAPGSSGAAKGNKSGKRKTTSESPGPSGPSGPSTSSPSSKRKNSPSEAGRVGKKSKKSGSNTPTPGPEEIESFPGMITKQDVLDWFKGLNKETVPMSEAIAAFRNRIMNAGKNREANQKLFLGWMKMLADQEEKMLRLKDEYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.86
3	0.87
4	0.9
5	0.94
6	0.91
7	0.9
8	0.85
9	0.81
10	0.76
11	0.68
12	0.6
13	0.53
14	0.47
15	0.39
16	0.37
17	0.32
18	0.26
19	0.24
20	0.23
21	0.21
22	0.21
23	0.2
24	0.18
25	0.2
26	0.22
27	0.24
28	0.26
29	0.3
30	0.3
31	0.32
32	0.33
33	0.36
34	0.35
35	0.34
36	0.31
37	0.31
38	0.31
39	0.28
40	0.27
41	0.22
42	0.2
43	0.22
44	0.23
45	0.19
46	0.19
47	0.22
48	0.25
49	0.28
50	0.35
51	0.36
52	0.39
53	0.44
54	0.46
55	0.44
56	0.43
57	0.39
58	0.41
59	0.4
60	0.35
61	0.32
62	0.31
63	0.33
64	0.32
65	0.31
66	0.22
67	0.22
68	0.22
69	0.2
70	0.22
71	0.18
72	0.18
73	0.19
74	0.21
75	0.18
76	0.19
77	0.21
78	0.17
79	0.25
80	0.28
81	0.35
82	0.36
83	0.38
84	0.37
85	0.37
86	0.42
87	0.36
88	0.32
89	0.26
90	0.25
91	0.27
92	0.26
93	0.23
94	0.21
95	0.27
96	0.34
97	0.41
98	0.47
99	0.45
100	0.55
101	0.62
102	0.65
103	0.68
104	0.69
105	0.71
106	0.72
107	0.75
108	0.7
109	0.66
110	0.62
111	0.51
112	0.44
113	0.39
114	0.3
115	0.25
116	0.2
117	0.16
118	0.14
119	0.15
120	0.11
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.12
125	0.13
126	0.14
127	0.17
128	0.23
129	0.22
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.21
134	0.21
135	0.2
136	0.2
137	0.2
138	0.21
139	0.24
140	0.25
141	0.25
142	0.26
143	0.24
144	0.24
145	0.27
146	0.28
147	0.25
148	0.24
149	0.2
150	0.21
151	0.18
152	0.13
153	0.1
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.12
161	0.17
162	0.21
163	0.26
164	0.29
165	0.33
166	0.35
167	0.43
168	0.5
169	0.55
170	0.61
171	0.67
172	0.75
173	0.82
174	0.88
175	0.89
176	0.9
177	0.9
178	0.89
179	0.85
180	0.84
181	0.8
182	0.76
183	0.67
184	0.56
185	0.48
186	0.39
187	0.35
188	0.31
189	0.25
190	0.19
191	0.18
192	0.2
193	0.23
194	0.24
195	0.25
196	0.26
197	0.3
198	0.29
199	0.3
200	0.31
201	0.28
202	0.27
203	0.3
204	0.31
205	0.3
206	0.31
207	0.3
208	0.32
209	0.32
210	0.35
211	0.37
212	0.39
213	0.37
214	0.37
215	0.38
216	0.33
217	0.32
218	0.27
219	0.2
220	0.13
221	0.15
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.16
226	0.19
227	0.18
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.13
232	0.12
233	0.13
234	0.09
235	0.09
236	0.07
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.1
253	0.12
254	0.2
255	0.23
256	0.25
257	0.32
258	0.39
259	0.43
260	0.45
261	0.45
262	0.37
263	0.38
264	0.35
265	0.29
266	0.26
267	0.24
268	0.2
269	0.19
270	0.19
271	0.14
272	0.15
273	0.16
274	0.15
275	0.15
276	0.17
277	0.25
278	0.27
279	0.31
280	0.38
281	0.39
282	0.41
283	0.47
284	0.47
285	0.46
286	0.49
287	0.48
288	0.4
289	0.37
290	0.35
291	0.31
292	0.3
293	0.24
294	0.2
295	0.21
296	0.21
297	0.2
298	0.16
299	0.14
300	0.13
301	0.11
302	0.12
303	0.08
304	0.07
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.13
313	0.14
314	0.16
315	0.18
316	0.19
317	0.2
318	0.21
319	0.23
320	0.21
321	0.22
322	0.23
323	0.25
324	0.3
325	0.34
326	0.36
327	0.38
328	0.4
329	0.4
330	0.38
331	0.39
332	0.33
333	0.32
334	0.32
335	0.27
336	0.29
337	0.28
338	0.27
339	0.27
340	0.31
341	0.31
342	0.33
343	0.42
344	0.4
345	0.4
346	0.41
347	0.37
348	0.33
349	0.33
350	0.29
351	0.2
352	0.22
353	0.21
354	0.2
355	0.2
356	0.19
357	0.17
358	0.15
359	0.13
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.09
389	0.1
390	0.12
391	0.13
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.16
397	0.2
398	0.19
399	0.23
400	0.28
401	0.29
402	0.33
403	0.35
404	0.29
405	0.34
406	0.34
407	0.37
408	0.34
409	0.35
410	0.31
411	0.28
412	0.27
413	0.18
414	0.17
415	0.11
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.1
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.12
433	0.16
434	0.22
435	0.31
436	0.39
437	0.46
438	0.5
439	0.53
440	0.56
441	0.59
442	0.61
443	0.62
444	0.62
445	0.63
446	0.65
447	0.69
448	0.7
449	0.68
450	0.66
451	0.65
452	0.58
453	0.51
454	0.45
455	0.36
456	0.3
457	0.24
458	0.19
459	0.09
460	0.06
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.08
472	0.1
473	0.17
474	0.19
475	0.24
476	0.31
477	0.37
478	0.41
479	0.49
480	0.56
481	0.58
482	0.63
483	0.63
484	0.65
485	0.62
486	0.62
487	0.56
488	0.56
489	0.53
490	0.54
491	0.55
492	0.52
493	0.57
494	0.55
495	0.56
496	0.51
497	0.47
498	0.42
499	0.44
500	0.46
501	0.43
502	0.46
503	0.5
504	0.51
505	0.51
506	0.48
507	0.45
508	0.42
509	0.4
510	0.41
511	0.4
512	0.42
513	0.42
514	0.46
515	0.48
516	0.5
517	0.56
518	0.53
519	0.5
520	0.48
521	0.49
522	0.46
523	0.41
524	0.35
525	0.29
526	0.28
527	0.24
528	0.19
529	0.17
530	0.16
531	0.15
532	0.13
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.09
543	0.13
544	0.18
545	0.22
546	0.23
547	0.23
548	0.26
549	0.26
550	0.26
551	0.25
552	0.24
553	0.21
554	0.23
555	0.22
556	0.2
557	0.19
558	0.18
559	0.17
560	0.14
561	0.13
562	0.11
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.18
567	0.18
568	0.18
569	0.2
570	0.2
571	0.2
572	0.24
573	0.27
574	0.26
575	0.24
576	0.26
577	0.26
578	0.31
579	0.29
580	0.26
581	0.24
582	0.24
583	0.25
584	0.25
585	0.25
586	0.24
587	0.28
588	0.32
589	0.32
590	0.31
591	0.3
592	0.32
593	0.34
594	0.29
595	0.25
596	0.23
597	0.26
598	0.27
599	0.27
600	0.27
601	0.26
602	0.25
603	0.28
604	0.25
605	0.22
606	0.22
607	0.22
608	0.2
609	0.19
610	0.18
611	0.16
612	0.17
613	0.19
614	0.21
615	0.2
616	0.23
617	0.31
618	0.36
619	0.42
620	0.48
621	0.52
622	0.56
623	0.59
624	0.6
625	0.62
626	0.64
627	0.66
628	0.64
629	0.6
630	0.56
631	0.56
632	0.51
633	0.42
634	0.34
635	0.28
636	0.25
637	0.22
638	0.21
639	0.25
640	0.28
641	0.33
642	0.38
643	0.44
644	0.51
645	0.58
646	0.64
647	0.68
648	0.73
649	0.74
650	0.77
651	0.74
652	0.74
653	0.72
654	0.7
655	0.66
656	0.63
657	0.64
658	0.61
659	0.62
660	0.62
661	0.64
662	0.67
663	0.68
664	0.73
665	0.72
666	0.76
667	0.75
668	0.7
669	0.67
670	0.61
671	0.55
672	0.48
673	0.41
674	0.34
675	0.29
676	0.28
677	0.23
678	0.2
679	0.18
680	0.16
681	0.15
682	0.12
683	0.13
684	0.12
685	0.12
686	0.13
687	0.17
688	0.21
689	0.23
690	0.23
691	0.22
692	0.25
693	0.27
694	0.28
695	0.29
696	0.25
697	0.26
698	0.26
699	0.27
700	0.25
701	0.22
702	0.22
703	0.21
704	0.21
705	0.19
706	0.23
707	0.22
708	0.21
709	0.23
710	0.24
711	0.2
712	0.24
713	0.26
714	0.3
715	0.39
716	0.46
717	0.5
718	0.52
719	0.56
720	0.62
721	0.63
722	0.58
723	0.53
724	0.46
725	0.41
726	0.41
727	0.39
728	0.33
729	0.28
730	0.28
731	0.24
732	0.24
733	0.25
734	0.23
735	0.23
736	0.2
737	0.24
738	0.24
739	0.24
740	0.26
741	0.28
742	0.26

A0A1B9IM88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer