FuNGI

A0A1B9J1L3

Protein Details

Accession

A0A1B9J1L3

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
77-97	GVQRLKFKPKVPIRRVKQEVD	Hydrophilic
213-247	DRRSNQDKKTKGKDEKKEKEKKKKKKDSPSTIESD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
114-133	GGMRGSPRGRGGPGRGRGRG
218-238	QDKKTKGKDEKKEKEKKKKKK
509-517	RRRLIREKG

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSASNRGKPSLIAAAQSQSQNHNQPQASTSTTTPTVPPNLASIPMSTVSSSTSGSGSISARSTPAPSQGGSVPPSGGVQRLKFKPKVPIRRVKQEVDVKPDISNIPASSSTPRGGMRGSPRGRGGPGRGRGRGNAPSTSIAAGVFGGPRPVPSASSSRKFTASASTMTSRFDEQDIEVYSDHSDQEGGSMGRPIDIDMVSTMSESAPTSLYRDRRSNQDKKTKGKDEKKEKEKKKKKKDSPSTIESDVNVGLGVKAEPISPEKRPQQLREDDTMLSDDEMQDRDDQGRRVRNFAQTGGIEEPPHSTRSPTGDNDEDDEVNEAQMVDLSESEEEEEEEDMTGDFNQVDGYDNPEEKLFIFQFPHLFPKFLPATPVDLTTDTKPDINNPTTTGSAQIKPDIKPTAAQLRSIGPGGKKLPEPLPEGRVGTMVVMKSGKVKIVMGKDIVMNVTPGLPTTFIQHLVHLDDKTKSAHVLGEVHKNYVVTPDIDRLLEDLYINGGKTPGEVDAERRRRLIREKGLMPMKRERD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.32
3	0.34
4	0.31
5	0.27
6	0.33
7	0.38
8	0.4
9	0.46
10	0.43
11	0.42
12	0.42
13	0.42
14	0.39
15	0.34
16	0.31
17	0.28
18	0.28
19	0.28
20	0.27
21	0.28
22	0.28
23	0.27
24	0.26
25	0.25
26	0.25
27	0.25
28	0.24
29	0.2
30	0.18
31	0.18
32	0.18
33	0.15
34	0.14
35	0.13
36	0.14
37	0.14
38	0.12
39	0.11
40	0.11
41	0.11
42	0.13
43	0.12
44	0.13
45	0.14
46	0.13
47	0.14
48	0.15
49	0.18
50	0.17
51	0.22
52	0.22
53	0.21
54	0.23
55	0.25
56	0.27
57	0.26
58	0.26
59	0.2
60	0.18
61	0.19
62	0.17
63	0.19
64	0.2
65	0.22
66	0.3
67	0.37
68	0.45
69	0.48
70	0.52
71	0.58
72	0.63
73	0.71
74	0.72
75	0.76
76	0.75
77	0.82
78	0.84
79	0.77
80	0.76
81	0.75
82	0.71
83	0.68
84	0.64
85	0.54
86	0.48
87	0.47
88	0.38
89	0.29
90	0.26
91	0.17
92	0.17
93	0.16
94	0.17
95	0.18
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.2
100	0.19
101	0.19
102	0.23
103	0.27
104	0.35
105	0.37
106	0.38
107	0.4
108	0.41
109	0.43
110	0.42
111	0.42
112	0.4
113	0.47
114	0.49
115	0.51
116	0.51
117	0.5
118	0.52
119	0.51
120	0.46
121	0.39
122	0.35
123	0.32
124	0.31
125	0.29
126	0.23
127	0.16
128	0.12
129	0.1
130	0.08
131	0.07
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.13
140	0.21
141	0.26
142	0.32
143	0.35
144	0.35
145	0.36
146	0.35
147	0.33
148	0.32
149	0.28
150	0.24
151	0.25
152	0.26
153	0.25
154	0.25
155	0.26
156	0.2
157	0.18
158	0.17
159	0.14
160	0.12
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.15
167	0.14
168	0.13
169	0.09
170	0.08
171	0.06
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.07
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.09
196	0.14
197	0.19
198	0.23
199	0.28
200	0.29
201	0.38
202	0.48
203	0.54
204	0.59
205	0.64
206	0.67
207	0.7
208	0.78
209	0.77
210	0.78
211	0.79
212	0.8
213	0.81
214	0.84
215	0.86
216	0.87
217	0.88
218	0.89
219	0.9
220	0.91
221	0.91
222	0.92
223	0.92
224	0.93
225	0.93
226	0.93
227	0.9
228	0.84
229	0.78
230	0.69
231	0.6
232	0.48
233	0.38
234	0.27
235	0.19
236	0.13
237	0.08
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.08
246	0.11
247	0.13
248	0.19
249	0.23
250	0.3
251	0.34
252	0.37
253	0.42
254	0.46
255	0.48
256	0.46
257	0.44
258	0.37
259	0.33
260	0.31
261	0.22
262	0.16
263	0.12
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.08
270	0.1
271	0.13
272	0.15
273	0.19
274	0.27
275	0.27
276	0.31
277	0.33
278	0.36
279	0.35
280	0.33
281	0.32
282	0.24
283	0.26
284	0.24
285	0.22
286	0.16
287	0.15
288	0.17
289	0.14
290	0.16
291	0.14
292	0.12
293	0.13
294	0.17
295	0.21
296	0.2
297	0.24
298	0.24
299	0.25
300	0.26
301	0.26
302	0.22
303	0.18
304	0.18
305	0.13
306	0.11
307	0.1
308	0.07
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.07
334	0.07
335	0.11
336	0.13
337	0.14
338	0.14
339	0.14
340	0.14
341	0.12
342	0.17
343	0.13
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.18
348	0.19
349	0.25
350	0.22
351	0.22
352	0.2
353	0.25
354	0.27
355	0.24
356	0.25
357	0.19
358	0.23
359	0.23
360	0.24
361	0.19
362	0.18
363	0.2
364	0.19
365	0.2
366	0.17
367	0.17
368	0.16
369	0.19
370	0.25
371	0.25
372	0.25
373	0.25
374	0.27
375	0.27
376	0.27
377	0.27
378	0.23
379	0.24
380	0.24
381	0.27
382	0.28
383	0.28
384	0.33
385	0.31
386	0.28
387	0.26
388	0.3
389	0.34
390	0.31
391	0.32
392	0.28
393	0.28
394	0.29
395	0.29
396	0.28
397	0.18
398	0.23
399	0.24
400	0.26
401	0.25
402	0.27
403	0.31
404	0.32
405	0.37
406	0.35
407	0.37
408	0.36
409	0.36
410	0.32
411	0.28
412	0.24
413	0.19
414	0.18
415	0.14
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.16
420	0.17
421	0.18
422	0.16
423	0.18
424	0.21
425	0.26
426	0.29
427	0.26
428	0.26
429	0.25
430	0.25
431	0.24
432	0.19
433	0.14
434	0.11
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.13
442	0.15
443	0.17
444	0.18
445	0.19
446	0.2
447	0.23
448	0.26
449	0.23
450	0.24
451	0.22
452	0.24
453	0.24
454	0.24
455	0.21
456	0.18
457	0.19
458	0.19
459	0.24
460	0.26
461	0.34
462	0.34
463	0.35
464	0.35
465	0.33
466	0.3
467	0.27
468	0.25
469	0.17
470	0.18
471	0.21
472	0.22
473	0.22
474	0.22
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.14
479	0.1
480	0.12
481	0.13
482	0.13
483	0.12
484	0.12
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.1
489	0.13
490	0.14
491	0.21
492	0.32
493	0.4
494	0.43
495	0.46
496	0.48
497	0.51
498	0.59
499	0.62
500	0.62
501	0.63
502	0.64
503	0.69
504	0.75
505	0.73
506	0.7

A0A1B9J1L3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer