FuNGI

A0A1B9IXZ8

Protein Details

Accession

A0A1B9IXZ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
313-387	EEAKAKEKAKQKIKEKKRRERQKEKKKKMKEKKEKKMEKKRKEKEKKKKKKKEREREKAKKKKSKKNDTAISDSD	Basic
393-417	SINDESSSKKRKKRSRSSSVSSVSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
316-378	KAKEKAKQKIKEKKRRERQKEKKKKMKEKKEKKMEKKRKEKEKKKKKKKEREREKAKKKKSKK
401-408	KKRKKRSR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1 IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSMSTSDQQVWKKVLAAKNKYMTMPQIEASFPTMAKKAVTQSTANLVKLRLFSTSKLKDDDKTILFHAHTAEEAKQKSAMTPEQKIVLQVIKQAGERGIASAQIGRQIGHETMPQAILRKTVKNLESSGHIKQFKPVNAPTTIYYVMADVKIPEEISGGIWFDNNQEYDQGLVDALCQVLQHRVYRLTYVDNRDRTGKADPAALKDTKESLLVPYAMTLSNSKNYSLLTPMALRNFVNKSKLTSAELSVKNIMEVMRALELDGLVESIKPFNASITFQEDDDDHLDEREGSSSKRRKLNLDNGDDDEGLDSEEEAKAKEKAKQKIKEKKRRERQKEKKKKMKEKKEKKMEKKRKEKEKKKKKKKEREREKAKKKKSKKNDTAISDSDDDQLLSINDESSSKKRKKRSRSSSVSSVSSISSVSTVSTVSTVSSVSSVSSGSSDSVSSVASDEIDDVLLPIKSKSYSTNNNVPNNNIPNFFPGGLGGGITDLSDQSIIYKATNRLVNLLKGQNEIPCGKCPVFSFCEEDGPVNPKGCTYMSQYLDDEVGGWDRRVLGKMRPDLAEPEPEPEPEPELQVEGIEGEINGNGDYDMDEGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.49
3	0.54
4	0.57
5	0.61
6	0.63
7	0.59
8	0.55
9	0.54
10	0.49
11	0.43
12	0.36
13	0.31
14	0.29
15	0.28
16	0.28
17	0.25
18	0.19
19	0.2
20	0.2
21	0.18
22	0.19
23	0.2
24	0.23
25	0.27
26	0.31
27	0.29
28	0.3
29	0.38
30	0.42
31	0.4
32	0.36
33	0.32
34	0.31
35	0.32
36	0.3
37	0.26
38	0.24
39	0.26
40	0.34
41	0.4
42	0.41
43	0.44
44	0.46
45	0.44
46	0.46
47	0.5
48	0.42
49	0.38
50	0.36
51	0.35
52	0.33
53	0.32
54	0.28
55	0.21
56	0.2
57	0.2
58	0.22
59	0.24
60	0.25
61	0.25
62	0.26
63	0.25
64	0.26
65	0.29
66	0.33
67	0.33
68	0.36
69	0.37
70	0.38
71	0.39
72	0.37
73	0.34
74	0.3
75	0.24
76	0.25
77	0.25
78	0.24
79	0.24
80	0.25
81	0.23
82	0.2
83	0.19
84	0.17
85	0.14
86	0.12
87	0.12
88	0.13
89	0.12
90	0.15
91	0.15
92	0.14
93	0.14
94	0.17
95	0.17
96	0.16
97	0.17
98	0.14
99	0.15
100	0.16
101	0.16
102	0.16
103	0.16
104	0.21
105	0.23
106	0.25
107	0.27
108	0.33
109	0.34
110	0.35
111	0.36
112	0.32
113	0.34
114	0.35
115	0.37
116	0.37
117	0.38
118	0.35
119	0.4
120	0.45
121	0.42
122	0.45
123	0.43
124	0.4
125	0.39
126	0.4
127	0.36
128	0.34
129	0.31
130	0.24
131	0.21
132	0.17
133	0.16
134	0.14
135	0.13
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.09
167	0.12
168	0.13
169	0.15
170	0.18
171	0.19
172	0.2
173	0.21
174	0.24
175	0.27
176	0.33
177	0.39
178	0.38
179	0.39
180	0.41
181	0.4
182	0.36
183	0.35
184	0.3
185	0.24
186	0.27
187	0.27
188	0.28
189	0.32
190	0.3
191	0.26
192	0.24
193	0.25
194	0.19
195	0.19
196	0.15
197	0.11
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.1
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.15
212	0.15
213	0.15
214	0.14
215	0.11
216	0.13
217	0.15
218	0.15
219	0.16
220	0.15
221	0.17
222	0.2
223	0.21
224	0.23
225	0.21
226	0.24
227	0.25
228	0.27
229	0.26
230	0.23
231	0.23
232	0.28
233	0.29
234	0.27
235	0.26
236	0.24
237	0.21
238	0.2
239	0.17
240	0.09
241	0.09
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.09
262	0.13
263	0.14
264	0.13
265	0.14
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.09
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.16
279	0.23
280	0.28
281	0.34
282	0.36
283	0.4
284	0.47
285	0.56
286	0.56
287	0.55
288	0.52
289	0.48
290	0.47
291	0.42
292	0.33
293	0.24
294	0.15
295	0.1
296	0.07
297	0.05
298	0.04
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.09
304	0.11
305	0.17
306	0.24
307	0.33
308	0.42
309	0.51
310	0.6
311	0.67
312	0.77
313	0.82
314	0.85
315	0.88
316	0.89
317	0.92
318	0.93
319	0.94
320	0.94
321	0.95
322	0.95
323	0.95
324	0.95
325	0.94
326	0.95
327	0.94
328	0.94
329	0.94
330	0.94
331	0.94
332	0.95
333	0.94
334	0.94
335	0.95
336	0.94
337	0.94
338	0.94
339	0.92
340	0.93
341	0.93
342	0.94
343	0.93
344	0.94
345	0.95
346	0.95
347	0.96
348	0.96
349	0.96
350	0.97
351	0.97
352	0.97
353	0.96
354	0.96
355	0.96
356	0.96
357	0.96
358	0.95
359	0.94
360	0.93
361	0.93
362	0.92
363	0.93
364	0.91
365	0.91
366	0.89
367	0.84
368	0.8
369	0.71
370	0.64
371	0.54
372	0.45
373	0.35
374	0.26
375	0.2
376	0.13
377	0.12
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.08
384	0.11
385	0.16
386	0.26
387	0.32
388	0.39
389	0.49
390	0.58
391	0.68
392	0.77
393	0.81
394	0.83
395	0.85
396	0.86
397	0.85
398	0.8
399	0.71
400	0.61
401	0.51
402	0.4
403	0.3
404	0.23
405	0.14
406	0.09
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.11
449	0.16
450	0.23
451	0.31
452	0.38
453	0.47
454	0.53
455	0.6
456	0.6
457	0.58
458	0.57
459	0.54
460	0.5
461	0.42
462	0.35
463	0.32
464	0.32
465	0.29
466	0.22
467	0.16
468	0.15
469	0.13
470	0.12
471	0.09
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.15
485	0.17
486	0.23
487	0.27
488	0.26
489	0.29
490	0.32
491	0.34
492	0.35
493	0.38
494	0.34
495	0.33
496	0.34
497	0.31
498	0.32
499	0.33
500	0.29
501	0.28
502	0.31
503	0.29
504	0.31
505	0.3
506	0.32
507	0.32
508	0.32
509	0.35
510	0.31
511	0.35
512	0.33
513	0.33
514	0.3
515	0.3
516	0.31
517	0.26
518	0.25
519	0.2
520	0.22
521	0.21
522	0.21
523	0.25
524	0.3
525	0.31
526	0.35
527	0.35
528	0.34
529	0.33
530	0.3
531	0.23
532	0.16
533	0.17
534	0.15
535	0.14
536	0.14
537	0.15
538	0.18
539	0.21
540	0.22
541	0.25
542	0.33
543	0.39
544	0.43
545	0.43
546	0.43
547	0.44
548	0.44
549	0.46
550	0.38
551	0.35
552	0.32
553	0.32
554	0.32
555	0.28
556	0.29
557	0.22
558	0.23
559	0.2
560	0.2
561	0.19
562	0.16
563	0.15
564	0.11
565	0.11
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.07

A0A1B9IXZ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer