Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9INQ9

Protein Details
Accession A0A1B9INQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-352DEDDERPKKRRKGVYYHEINFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-343PKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9.833, mito 6.5, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSKKSDLLVRVRYLNPVPNPPFPPKLLDISTDINRLGEPSYLNHLAASTQLPMLVDSEMGMPLDLNEYDGIWDGQDQSLNPALDAGRVHHPIDVALLAPFNPPPEANGDVKAPVATEVSWMRNNNYLTRKNNARRKEAAEAKAEEVVDASEAAQIMAIEKSFHDLYEQDPKEIKHPDKKKRGLTVVESYDILPDVESWENSYALVRFPERPSAATAINPAATASSPRLAKAILRPIREDEDQQLIEFYLPKEEDLTNLEEAYERAIPSDEVDNVYAVTQEDPNDPTLPDIFSHVHYDRIRMYEVLSAAPPTKEILVSFQEDQNDGEQEDGSDEDDERPKKRRKGVYYHEINFRTLLRKTRAKRREEVALTADLWDKAVVGYRQPAGKDEKEREMSKAQVSDPTWVNEELRKSRGGDNMAELQGEAIQDEDVELDEEAQKIEAAVHEEEDNDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.51
4 0.52
5 0.53
6 0.57
7 0.58
8 0.58
9 0.52
10 0.53
11 0.46
12 0.47
13 0.42
14 0.39
15 0.37
16 0.38
17 0.39
18 0.36
19 0.33
20 0.27
21 0.25
22 0.23
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.12
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.09
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.11
63 0.1
64 0.13
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.18
79 0.19
80 0.16
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.13
92 0.17
93 0.17
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.14
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.1
104 0.12
105 0.16
106 0.2
107 0.21
108 0.22
109 0.27
110 0.28
111 0.32
112 0.37
113 0.42
114 0.41
115 0.47
116 0.55
117 0.59
118 0.66
119 0.66
120 0.65
121 0.63
122 0.65
123 0.68
124 0.66
125 0.62
126 0.59
127 0.55
128 0.49
129 0.45
130 0.4
131 0.3
132 0.21
133 0.16
134 0.1
135 0.08
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.22
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.24
158 0.28
159 0.34
160 0.37
161 0.36
162 0.46
163 0.54
164 0.63
165 0.7
166 0.72
167 0.72
168 0.73
169 0.67
170 0.63
171 0.6
172 0.52
173 0.45
174 0.39
175 0.31
176 0.25
177 0.21
178 0.15
179 0.08
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.13
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.21
200 0.2
201 0.17
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.15
218 0.24
219 0.25
220 0.26
221 0.27
222 0.29
223 0.33
224 0.33
225 0.3
226 0.22
227 0.22
228 0.21
229 0.2
230 0.18
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.18
280 0.17
281 0.23
282 0.23
283 0.25
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.19
288 0.2
289 0.16
290 0.17
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.11
302 0.13
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.18
310 0.16
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.1
321 0.17
322 0.2
323 0.23
324 0.31
325 0.39
326 0.46
327 0.55
328 0.62
329 0.64
330 0.72
331 0.79
332 0.8
333 0.81
334 0.8
335 0.79
336 0.71
337 0.63
338 0.54
339 0.46
340 0.41
341 0.34
342 0.37
343 0.35
344 0.43
345 0.49
346 0.59
347 0.65
348 0.67
349 0.7
350 0.67
351 0.7
352 0.65
353 0.62
354 0.55
355 0.49
356 0.42
357 0.37
358 0.34
359 0.23
360 0.2
361 0.15
362 0.11
363 0.09
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.17
368 0.2
369 0.23
370 0.23
371 0.27
372 0.29
373 0.35
374 0.42
375 0.43
376 0.49
377 0.53
378 0.54
379 0.55
380 0.53
381 0.5
382 0.47
383 0.45
384 0.38
385 0.38
386 0.37
387 0.38
388 0.36
389 0.34
390 0.32
391 0.3
392 0.3
393 0.28
394 0.34
395 0.33
396 0.34
397 0.34
398 0.34
399 0.38
400 0.42
401 0.42
402 0.37
403 0.37
404 0.41
405 0.38
406 0.35
407 0.3
408 0.24
409 0.21
410 0.19
411 0.13
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.13
430 0.13
431 0.15
432 0.15
433 0.16