Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IHJ8

Protein Details
Accession A0A1B9IHJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31ASAGPLPTKKQNYKGKQSSTYTKKSGHydrophilic
550-589EGEATQKEKVKRKMKGKGGSTSRYLRKKQKKNIVDNSLLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
556-580KEKVKRKMKGKGGSTSRYLRKKQKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 13.333, nucl 12, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDALLASAGPLPTKKQNYKGKQSSTYTKKSGPTSHQTIPRADGTSIDPSLHSILSSTRIPAGFHQSNLASGSGSTPIKPDVSIGRIQDKKLRSKLARQDITHKQAKLDRQDVNEWLNKAISGDKGGIEVDEELGEKTWRVKQSEISDSVSVGSKGKKFDLKFEGMGSYKVDYTRNGRHLAIASSKGHVATFDWQAGKLHSEIQLKESIRDIKFLHSQDFYAVAQKKYVFIYDQNGVELHKLKQHIDPTHMEFLPYHYLLATVGHAGYLKYHDTSTGVMLTQIPSHLGSPHSMAQNPHSAIIHLGHANGTMTLWSPNMTTPHVKLLAHRGPVNGIAVDPSETSAGRYVATSGMDGVVKIWDGRMWGKEVRSWHVRNQVTTLGYSGMGMLSVGGKSGVTVYRDLHSGNIQHTPTPYLTLPLPSLTASSVKFCPFDDLLCVGHEKGISSLLVPGSGEPNFDSNEADLYETYSRKRERDVRGLLEKIRPELITLDTDFLGHINESRGGETFEERNSRSYRQLGRLERLRMDGKADEPQNQLEDEDEEGEGEGGEGEATQKEKVKRKMKGKGGSTSRYLRKKQKKNIVDNSLLAMKAKVAAQKKAEDTRRKIANGEIVKETGALARFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.48
3 0.59
4 0.68
5 0.78
6 0.83
7 0.83
8 0.82
9 0.83
10 0.83
11 0.82
12 0.8
13 0.75
14 0.71
15 0.69
16 0.67
17 0.67
18 0.65
19 0.65
20 0.64
21 0.66
22 0.68
23 0.66
24 0.62
25 0.58
26 0.54
27 0.48
28 0.41
29 0.35
30 0.31
31 0.33
32 0.3
33 0.27
34 0.22
35 0.21
36 0.23
37 0.2
38 0.16
39 0.11
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.23
48 0.31
49 0.29
50 0.29
51 0.32
52 0.28
53 0.29
54 0.29
55 0.26
56 0.16
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.21
69 0.25
70 0.27
71 0.34
72 0.37
73 0.39
74 0.44
75 0.45
76 0.51
77 0.54
78 0.6
79 0.56
80 0.63
81 0.71
82 0.75
83 0.76
84 0.69
85 0.71
86 0.71
87 0.74
88 0.71
89 0.62
90 0.56
91 0.53
92 0.58
93 0.57
94 0.55
95 0.52
96 0.5
97 0.53
98 0.52
99 0.52
100 0.49
101 0.41
102 0.35
103 0.3
104 0.25
105 0.22
106 0.21
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.11
124 0.16
125 0.21
126 0.23
127 0.25
128 0.31
129 0.37
130 0.45
131 0.45
132 0.43
133 0.38
134 0.36
135 0.35
136 0.29
137 0.23
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.23
143 0.29
144 0.28
145 0.35
146 0.4
147 0.4
148 0.38
149 0.37
150 0.38
151 0.32
152 0.32
153 0.26
154 0.2
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.21
160 0.28
161 0.32
162 0.33
163 0.32
164 0.33
165 0.33
166 0.33
167 0.31
168 0.27
169 0.24
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.18
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.14
185 0.14
186 0.17
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.28
191 0.27
192 0.27
193 0.29
194 0.3
195 0.26
196 0.29
197 0.28
198 0.26
199 0.32
200 0.32
201 0.31
202 0.25
203 0.25
204 0.22
205 0.24
206 0.19
207 0.21
208 0.23
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.22
213 0.2
214 0.21
215 0.15
216 0.13
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.17
229 0.2
230 0.27
231 0.27
232 0.29
233 0.32
234 0.33
235 0.37
236 0.35
237 0.31
238 0.25
239 0.25
240 0.25
241 0.21
242 0.16
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.13
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.16
281 0.21
282 0.2
283 0.19
284 0.16
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.15
308 0.17
309 0.16
310 0.16
311 0.23
312 0.26
313 0.26
314 0.26
315 0.23
316 0.22
317 0.23
318 0.22
319 0.13
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.18
354 0.19
355 0.23
356 0.3
357 0.31
358 0.33
359 0.4
360 0.41
361 0.39
362 0.4
363 0.38
364 0.31
365 0.29
366 0.24
367 0.15
368 0.14
369 0.13
370 0.1
371 0.06
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.05
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.19
397 0.2
398 0.18
399 0.19
400 0.17
401 0.14
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.13
406 0.13
407 0.1
408 0.11
409 0.1
410 0.12
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.19
418 0.17
419 0.17
420 0.17
421 0.17
422 0.16
423 0.16
424 0.17
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.12
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.11
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.22
456 0.25
457 0.26
458 0.34
459 0.4
460 0.45
461 0.54
462 0.59
463 0.6
464 0.63
465 0.66
466 0.62
467 0.58
468 0.52
469 0.44
470 0.39
471 0.31
472 0.25
473 0.23
474 0.21
475 0.19
476 0.18
477 0.18
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.12
482 0.11
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.15
492 0.17
493 0.18
494 0.19
495 0.24
496 0.24
497 0.29
498 0.32
499 0.34
500 0.36
501 0.41
502 0.44
503 0.47
504 0.55
505 0.56
506 0.61
507 0.66
508 0.65
509 0.6
510 0.58
511 0.53
512 0.44
513 0.42
514 0.35
515 0.3
516 0.33
517 0.33
518 0.33
519 0.33
520 0.34
521 0.32
522 0.3
523 0.27
524 0.2
525 0.2
526 0.16
527 0.14
528 0.12
529 0.11
530 0.1
531 0.1
532 0.08
533 0.07
534 0.06
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.08
541 0.1
542 0.16
543 0.24
544 0.34
545 0.44
546 0.53
547 0.61
548 0.7
549 0.78
550 0.82
551 0.84
552 0.82
553 0.82
554 0.81
555 0.77
556 0.74
557 0.73
558 0.72
559 0.72
560 0.74
561 0.74
562 0.77
563 0.82
564 0.86
565 0.88
566 0.89
567 0.9
568 0.92
569 0.9
570 0.85
571 0.75
572 0.69
573 0.61
574 0.51
575 0.41
576 0.3
577 0.22
578 0.18
579 0.2
580 0.22
581 0.24
582 0.3
583 0.34
584 0.4
585 0.47
586 0.55
587 0.62
588 0.65
589 0.68
590 0.7
591 0.73
592 0.69
593 0.64
594 0.6
595 0.6
596 0.56
597 0.53
598 0.47
599 0.4
600 0.38
601 0.36
602 0.31
603 0.25