Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IKJ5

Protein Details
Accession A0A1B9IKJ5    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-153SSKPTSKKAEKPKSKGKPESVHydrophilic
157-177ETEKPKSKGRGRPPNSKKEEABasic
192-211EKRGRGRPPNSKKDESPKKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-264KPTSKKAEKPKSKGKPESVEKEETEKPKSKGRGRPPNSKKEEAKSPEKPTTEEAEVGEKRGRGRPPNSKKDESPKKTTGEGDGEGEKRGRGRPPKKTSEEGEKSEKPPSKKAKTTAEGTRKPPSRGAKKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR021487  DUF3140  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF11338  DUF3140  
Amino Acid Sequences MAPKSEQDVVNDFNEIVNMTADELETFLKTEGSETTGYQKDDGSGESIGHESGRKIVDILKRNPDKDPSKYTEEDKEHMRRVVSYCKRHLAQEGKLKETKTPEELEKTKSTRSLKNWGHDPMKTLSKSDQPQSSKPTSKKAEKPKSKGKPESVEKEETEKPKSKGRGRPPNSKKEEAKSPEKPTTEEAEVGEKRGRGRPPNSKKDESPKKTTGEGDGEGEKRGRGRPPKKTSEEGEKSEKPPSKKAKTTAEGTRKPPSRGAKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.12
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.1
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.19
23 0.22
24 0.23
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.16
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.12
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.18
44 0.25
45 0.32
46 0.37
47 0.44
48 0.49
49 0.5
50 0.53
51 0.56
52 0.54
53 0.53
54 0.55
55 0.5
56 0.51
57 0.52
58 0.53
59 0.53
60 0.5
61 0.47
62 0.46
63 0.47
64 0.44
65 0.44
66 0.41
67 0.34
68 0.34
69 0.42
70 0.43
71 0.44
72 0.45
73 0.49
74 0.49
75 0.48
76 0.52
77 0.48
78 0.46
79 0.48
80 0.47
81 0.46
82 0.47
83 0.46
84 0.42
85 0.4
86 0.35
87 0.3
88 0.29
89 0.27
90 0.31
91 0.33
92 0.35
93 0.36
94 0.35
95 0.34
96 0.37
97 0.38
98 0.38
99 0.4
100 0.45
101 0.44
102 0.47
103 0.5
104 0.5
105 0.49
106 0.43
107 0.42
108 0.35
109 0.36
110 0.31
111 0.28
112 0.24
113 0.27
114 0.29
115 0.3
116 0.33
117 0.31
118 0.34
119 0.38
120 0.42
121 0.43
122 0.42
123 0.47
124 0.47
125 0.51
126 0.56
127 0.61
128 0.66
129 0.69
130 0.74
131 0.77
132 0.8
133 0.82
134 0.81
135 0.76
136 0.74
137 0.72
138 0.73
139 0.67
140 0.61
141 0.52
142 0.5
143 0.49
144 0.43
145 0.42
146 0.4
147 0.37
148 0.4
149 0.47
150 0.5
151 0.54
152 0.62
153 0.67
154 0.68
155 0.77
156 0.79
157 0.81
158 0.8
159 0.79
160 0.73
161 0.67
162 0.7
163 0.66
164 0.66
165 0.63
166 0.63
167 0.62
168 0.58
169 0.55
170 0.48
171 0.47
172 0.4
173 0.33
174 0.27
175 0.29
176 0.27
177 0.28
178 0.27
179 0.23
180 0.24
181 0.28
182 0.33
183 0.33
184 0.41
185 0.5
186 0.59
187 0.68
188 0.74
189 0.73
190 0.74
191 0.77
192 0.8
193 0.76
194 0.74
195 0.69
196 0.64
197 0.62
198 0.58
199 0.52
200 0.45
201 0.4
202 0.34
203 0.33
204 0.3
205 0.29
206 0.27
207 0.23
208 0.21
209 0.24
210 0.29
211 0.35
212 0.44
213 0.53
214 0.62
215 0.72
216 0.76
217 0.78
218 0.76
219 0.77
220 0.75
221 0.7
222 0.69
223 0.65
224 0.6
225 0.63
226 0.63
227 0.56
228 0.58
229 0.63
230 0.64
231 0.66
232 0.72
233 0.73
234 0.73
235 0.76
236 0.77
237 0.77
238 0.75
239 0.72
240 0.74
241 0.7
242 0.67
243 0.68
244 0.68