FuNGI

A0A1B9IRW6

Protein Details

Accession

A0A1B9IRW6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
195-217	GYQSNPKKGKPKGKQKAKPALTE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
200-212	PKKGKPKGKQKAK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, cyto 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPRPGQAQARRKRALEEMESGGTTSYTQAQYDYPDGPSKVNFDNDELDQEQVEIEDIEDEGLIDNPRSQCLPVGVLPEDFSGEPIDGSQYLAMANRDNQNLPFVKTVINPYRSDLIGPTLPSSLSASNKTGSSSRHPALPKESWQELFPIHYQGYRKHIQSQLSSSSSSTSSYPSDYPPIPPASRRSDWYAYINGYQSNPKKGKPKGKQKAKPALTEEEMMNAAMGEGMDVDEEAAVEAEVVEDVVIGKTSRGNEKVVGAPREPLLGVLRKLNSSQALLILSHFAHWLSESIEQSPPPLPGGPDLPPDQPGISTPSPSSRHPQNTNHLSSNYFNWIFSLLLITDTQLSSEEISILRDLARASMKVAGHRYIIGVVGKHINEGWVLGEGLNNQQRTVEANGQDRTEVPGEKTEIGDSVDQILARCWLIIHAVAIGWGQKDLLFELDNLFT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.6
3	0.55
4	0.5
5	0.46
6	0.44
7	0.4
8	0.32
9	0.24
10	0.18
11	0.14
12	0.15
13	0.14
14	0.14
15	0.15
16	0.16
17	0.2
18	0.23
19	0.24
20	0.21
21	0.26
22	0.27
23	0.27
24	0.28
25	0.28
26	0.29
27	0.32
28	0.3
29	0.28
30	0.3
31	0.29
32	0.33
33	0.29
34	0.26
35	0.21
36	0.2
37	0.17
38	0.13
39	0.12
40	0.07
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.07
49	0.08
50	0.08
51	0.12
52	0.13
53	0.15
54	0.16
55	0.16
56	0.16
57	0.17
58	0.2
59	0.17
60	0.21
61	0.21
62	0.2
63	0.21
64	0.19
65	0.19
66	0.16
67	0.14
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.08
72	0.1
73	0.08
74	0.09
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.14
82	0.18
83	0.21
84	0.22
85	0.22
86	0.26
87	0.27
88	0.28
89	0.26
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.3
94	0.32
95	0.35
96	0.33
97	0.34
98	0.36
99	0.34
100	0.33
101	0.25
102	0.21
103	0.19
104	0.19
105	0.17
106	0.15
107	0.14
108	0.14
109	0.16
110	0.15
111	0.15
112	0.17
113	0.18
114	0.19
115	0.19
116	0.2
117	0.21
118	0.21
119	0.25
120	0.29
121	0.29
122	0.33
123	0.35
124	0.36
125	0.4
126	0.41
127	0.4
128	0.39
129	0.41
130	0.36
131	0.34
132	0.33
133	0.27
134	0.26
135	0.21
136	0.18
137	0.15
138	0.17
139	0.19
140	0.21
141	0.27
142	0.28
143	0.29
144	0.33
145	0.37
146	0.38
147	0.39
148	0.4
149	0.39
150	0.36
151	0.35
152	0.29
153	0.26
154	0.22
155	0.2
156	0.16
157	0.13
158	0.12
159	0.13
160	0.14
161	0.14
162	0.17
163	0.17
164	0.18
165	0.2
166	0.23
167	0.22
168	0.24
169	0.28
170	0.31
171	0.32
172	0.33
173	0.36
174	0.34
175	0.36
176	0.36
177	0.33
178	0.27
179	0.27
180	0.25
181	0.2
182	0.18
183	0.22
184	0.22
185	0.28
186	0.28
187	0.3
188	0.38
189	0.44
190	0.54
191	0.57
192	0.66
193	0.69
194	0.78
195	0.81
196	0.83
197	0.86
198	0.8
199	0.76
200	0.68
201	0.62
202	0.52
203	0.47
204	0.36
205	0.27
206	0.23
207	0.17
208	0.13
209	0.08
210	0.06
211	0.04
212	0.04
213	0.02
214	0.02
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.06
237	0.07
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.15
242	0.17
243	0.22
244	0.26
245	0.27
246	0.23
247	0.23
248	0.22
249	0.22
250	0.19
251	0.15
252	0.13
253	0.13
254	0.14
255	0.16
256	0.17
257	0.17
258	0.17
259	0.19
260	0.17
261	0.15
262	0.14
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.11
277	0.11
278	0.13
279	0.14
280	0.14
281	0.16
282	0.16
283	0.15
284	0.13
285	0.13
286	0.11
287	0.11
288	0.14
289	0.14
290	0.17
291	0.19
292	0.18
293	0.19
294	0.19
295	0.18
296	0.15
297	0.14
298	0.18
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.22
303	0.25
304	0.27
305	0.31
306	0.34
307	0.41
308	0.47
309	0.53
310	0.56
311	0.61
312	0.65
313	0.63
314	0.55
315	0.5
316	0.44
317	0.4
318	0.37
319	0.29
320	0.24
321	0.2
322	0.2
323	0.18
324	0.16
325	0.15
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.09
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.08
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.11
346	0.13
347	0.12
348	0.14
349	0.19
350	0.19
351	0.23
352	0.26
353	0.25
354	0.24
355	0.24
356	0.24
357	0.19
358	0.2
359	0.17
360	0.14
361	0.14
362	0.18
363	0.17
364	0.17
365	0.17
366	0.15
367	0.13
368	0.13
369	0.12
370	0.08
371	0.09
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.16
376	0.21
377	0.21
378	0.19
379	0.19
380	0.2
381	0.22
382	0.27
383	0.27
384	0.27
385	0.33
386	0.36
387	0.36
388	0.36
389	0.33
390	0.32
391	0.29
392	0.26
393	0.21
394	0.24
395	0.26
396	0.27
397	0.28
398	0.24
399	0.22
400	0.22
401	0.21
402	0.16
403	0.16
404	0.16
405	0.16
406	0.15
407	0.15
408	0.14
409	0.14
410	0.13
411	0.1
412	0.09
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.09
418	0.1
419	0.1
420	0.12
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.13
428	0.12
429	0.12

A0A1B9IRW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer