Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9IYM6

Protein Details
Accession A0A1B9IYM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-196VPGKGKREREGDDKKRKKKKKKRNNFGQPYISTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-186VPGKGKREREGDDKKRKKKKKKR
219-236KRMREERRLKLIEERRRK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSLYGGIKFASGSASASASAPASSEEGKPSSSQPSSSINPTPTRPTSAAPQKTGEWSAALKFAPRVNKPKPPTARPVGFSNTTSTIASSSSNSNGNSPVPGVVDAQTQTKSDIIRSAEPVIATTIGVGVGISTGGQEVEDEVQFGPDGLPLAKAPAMTLAPKVVPGKGKREREGDDKKRKKKKKKRNNFGQPYISTFDPEEQYDPNRPNDLGEYQAYRKRMREERRLKLIEERRRKAEGLSSGESSYYTDSEDEAPRRDAPKMFAPPKIYNETPSTSTPNYPPPPAATSGEDAYTRRAAMASSGDDAYARRAALSQAPSTGDDAYARRVAMSQQPASGDDAYARRVAMSQNPQPPSFTTSQPPSFAPPAQTVPPPPSSDIPGFASSVPVPTSTAAPAASYKEKEDFAKMLEDRKKAAEAIAAKFRAFGGGAAAGPSVSTPPVPVPALAEDSGSGTFAEKMMRKWGHQEGSTLGIRNEGLIHALSAEHVVNQPQPKPGETLSKRQIAKQKTAMANLKNKKWVQAPNSRGRIVNANEDLRAMEAREKKGEESRIICLVGVVGSEEEIDEDLADEIGEECSKYGIVERVVLHMVEPPPPEPSDCLRIFVVFSGMAGAWRATKELDGRFFGGRKIRVTYFDEGRFDRGDRDGEILG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.13
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.17
13 0.18
14 0.2
15 0.21
16 0.23
17 0.29
18 0.28
19 0.28
20 0.27
21 0.33
22 0.35
23 0.39
24 0.42
25 0.39
26 0.42
27 0.44
28 0.49
29 0.45
30 0.48
31 0.44
32 0.41
33 0.46
34 0.52
35 0.55
36 0.51
37 0.51
38 0.47
39 0.5
40 0.49
41 0.39
42 0.31
43 0.26
44 0.24
45 0.25
46 0.22
47 0.2
48 0.21
49 0.25
50 0.31
51 0.36
52 0.44
53 0.48
54 0.58
55 0.62
56 0.69
57 0.73
58 0.72
59 0.74
60 0.75
61 0.74
62 0.67
63 0.67
64 0.63
65 0.58
66 0.51
67 0.47
68 0.4
69 0.35
70 0.32
71 0.26
72 0.2
73 0.18
74 0.18
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.2
100 0.21
101 0.23
102 0.25
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.24
107 0.2
108 0.17
109 0.13
110 0.1
111 0.08
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.05
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.06
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.22
152 0.25
153 0.34
154 0.41
155 0.48
156 0.5
157 0.55
158 0.57
159 0.6
160 0.68
161 0.69
162 0.71
163 0.75
164 0.8
165 0.85
166 0.91
167 0.92
168 0.92
169 0.93
170 0.93
171 0.94
172 0.95
173 0.96
174 0.97
175 0.96
176 0.93
177 0.9
178 0.8
179 0.73
180 0.64
181 0.53
182 0.43
183 0.33
184 0.27
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.15
189 0.18
190 0.23
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.23
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.22
202 0.26
203 0.28
204 0.28
205 0.29
206 0.34
207 0.42
208 0.47
209 0.54
210 0.61
211 0.66
212 0.74
213 0.73
214 0.67
215 0.67
216 0.68
217 0.67
218 0.68
219 0.63
220 0.58
221 0.59
222 0.58
223 0.49
224 0.46
225 0.42
226 0.38
227 0.36
228 0.33
229 0.3
230 0.29
231 0.28
232 0.22
233 0.16
234 0.1
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.19
243 0.2
244 0.22
245 0.23
246 0.22
247 0.22
248 0.27
249 0.34
250 0.35
251 0.37
252 0.41
253 0.42
254 0.45
255 0.46
256 0.39
257 0.33
258 0.34
259 0.32
260 0.29
261 0.28
262 0.28
263 0.24
264 0.25
265 0.24
266 0.29
267 0.29
268 0.27
269 0.26
270 0.24
271 0.25
272 0.25
273 0.25
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.14
318 0.18
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.18
325 0.13
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.19
336 0.24
337 0.3
338 0.33
339 0.33
340 0.33
341 0.33
342 0.32
343 0.29
344 0.24
345 0.22
346 0.25
347 0.26
348 0.27
349 0.26
350 0.25
351 0.25
352 0.24
353 0.22
354 0.19
355 0.19
356 0.2
357 0.2
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.2
362 0.2
363 0.19
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.18
369 0.17
370 0.15
371 0.16
372 0.12
373 0.13
374 0.11
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.18
391 0.2
392 0.17
393 0.16
394 0.21
395 0.21
396 0.27
397 0.31
398 0.32
399 0.31
400 0.31
401 0.31
402 0.25
403 0.25
404 0.21
405 0.19
406 0.21
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.24
411 0.23
412 0.2
413 0.16
414 0.12
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.08
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.21
448 0.23
449 0.23
450 0.29
451 0.36
452 0.37
453 0.36
454 0.37
455 0.29
456 0.33
457 0.34
458 0.29
459 0.21
460 0.18
461 0.17
462 0.15
463 0.14
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.09
476 0.13
477 0.17
478 0.19
479 0.22
480 0.24
481 0.24
482 0.27
483 0.28
484 0.35
485 0.35
486 0.42
487 0.44
488 0.5
489 0.5
490 0.53
491 0.58
492 0.53
493 0.57
494 0.55
495 0.57
496 0.53
497 0.6
498 0.61
499 0.6
500 0.64
501 0.64
502 0.62
503 0.61
504 0.58
505 0.55
506 0.56
507 0.57
508 0.55
509 0.58
510 0.62
511 0.63
512 0.69
513 0.66
514 0.6
515 0.54
516 0.54
517 0.46
518 0.46
519 0.41
520 0.36
521 0.35
522 0.34
523 0.32
524 0.25
525 0.23
526 0.16
527 0.18
528 0.22
529 0.25
530 0.29
531 0.31
532 0.33
533 0.39
534 0.43
535 0.42
536 0.39
537 0.4
538 0.39
539 0.37
540 0.34
541 0.27
542 0.22
543 0.15
544 0.12
545 0.09
546 0.06
547 0.05
548 0.06
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.1
568 0.13
569 0.14
570 0.19
571 0.19
572 0.22
573 0.23
574 0.23
575 0.2
576 0.21
577 0.21
578 0.21
579 0.22
580 0.2
581 0.22
582 0.24
583 0.25
584 0.23
585 0.27
586 0.31
587 0.3
588 0.32
589 0.3
590 0.3
591 0.29
592 0.26
593 0.23
594 0.14
595 0.13
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.11
603 0.12
604 0.11
605 0.14
606 0.2
607 0.25
608 0.3
609 0.31
610 0.34
611 0.37
612 0.38
613 0.4
614 0.42
615 0.4
616 0.38
617 0.41
618 0.41
619 0.42
620 0.46
621 0.48
622 0.48
623 0.49
624 0.51
625 0.47
626 0.48
627 0.46
628 0.41
629 0.38
630 0.33
631 0.3
632 0.26