FuNGI

A0A1A0HJL3

Protein Details

Accession

A0A1A0HJL3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-30	RAATPQPLRRHPPTRHLARTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MFCRPRTHGRAATPQPLRRHPPTRHLARTPGSLQAMLAPAVREQAQAVIATLQLQIVTRLQAEHTRAKVLNLETRTRLSHFLQAVFSGDYTAAGEVLGRFRSACTWTGASDKSVPIYTSCFATLLTQACRPDKRMPTMLDLTALVAAAERLPRRVGLAAQSPHPTRIRCLVVLVLLRKLAATPPANRIAHVNLVAYIRGLAAQFALSAEDVLAQLRALGPGLFAQFNQVFRRNERGPGPADEVHVALRNALDALRDDERSLSFDALCTFLERHSFDAAGFSPRPTAKYYEIFDSLSGQARADFLDAYLSYNHKKQLLVEDASQNVYRAVSSLRRMVGFTALHKAWIAAWLQAANGHVQRLVTSRADLEKFAFVFSYLSVEHVTSLCLTHMLSATVLAPHAKALHLASRIAWSLRKELGQADKVVFSPKNQDLVFGADHALELACSLIKILIQSCSLPESSAITSQLDELWAGRVFQFGVAHGEADMPKLWRLGTVKIHPVVAEHFRINQELFQTGEYRLPMIHPPKPWKSPRDGGFLSIRLPLVKSSEPMTSDAYMEQAHQTGQLTSVYLSVNALGACAWTINGFTLASFNALWDRPNIRALLPSLAPRLQENLPQPSRNAFPDDHSYQQALAKWKHVELENRKKSQDAQSLRIYYGMVKRLANSLATNGEIIYLPHNMDFRGRVYPAVSLLSHQNEDLVRSLLMFWEAKPLGPDGYNWLVYHLANLYNKKKMTMAELKEFVEQHKNPIRESAANPLAEDAWWVRADTPWQVLALCNELDKIWGYSGDISTFKSRIPVHQDGSCNGLQHYSALGADKEAARAVNILPDEKMQDVYTTVLGLVESRVEKDRNSAKELDQDLAREAKKVLSRKLIKQTVMTTVYGVTPYGATRQVQKQIADIAQTGSAISIPESKQLMLAKFISHHTLESISNLFAGAKLIQHWLVDNCARCIQAFDKKDYPRDENIDFFGGKHYRPMMWTSLSGFPVIQMYRKRQIRELVTPLQRLCLNDDTQLAPIDELRLKNGIAPNFIHSIDAIHLLMTCLGAKAENITFASVHDSFWTHAGEVGVLSRVIREEFARLHSSNIIENLRQDVKHINRNSHQLVWANRKHDERFVTDLVDLRKTYESTHKKLESASVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.72
3	0.74
4	0.74
5	0.73
6	0.76
7	0.73
8	0.75
9	0.78
10	0.8
11	0.81
12	0.79
13	0.78
14	0.73
15	0.73
16	0.65
17	0.61
18	0.53
19	0.44
20	0.38
21	0.33
22	0.3
23	0.23
24	0.22
25	0.16
26	0.14
27	0.16
28	0.17
29	0.14
30	0.12
31	0.14
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.11
39	0.09
40	0.09
41	0.09
42	0.1
43	0.1
44	0.12
45	0.12
46	0.12
47	0.15
48	0.2
49	0.26
50	0.31
51	0.32
52	0.37
53	0.37
54	0.38
55	0.41
56	0.4
57	0.42
58	0.4
59	0.43
60	0.4
61	0.43
62	0.44
63	0.4
64	0.41
65	0.36
66	0.38
67	0.36
68	0.36
69	0.34
70	0.31
71	0.31
72	0.27
73	0.24
74	0.17
75	0.14
76	0.11
77	0.1
78	0.1
79	0.07
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.15
89	0.17
90	0.18
91	0.2
92	0.21
93	0.22
94	0.27
95	0.28
96	0.28
97	0.28
98	0.27
99	0.25
100	0.25
101	0.24
102	0.2
103	0.23
104	0.21
105	0.2
106	0.19
107	0.17
108	0.15
109	0.16
110	0.19
111	0.19
112	0.21
113	0.23
114	0.27
115	0.33
116	0.36
117	0.39
118	0.44
119	0.48
120	0.52
121	0.56
122	0.55
123	0.56
124	0.57
125	0.53
126	0.45
127	0.38
128	0.31
129	0.23
130	0.2
131	0.12
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.14
139	0.15
140	0.17
141	0.18
142	0.19
143	0.2
144	0.28
145	0.29
146	0.32
147	0.38
148	0.37
149	0.41
150	0.43
151	0.39
152	0.34
153	0.39
154	0.39
155	0.34
156	0.34
157	0.3
158	0.3
159	0.33
160	0.32
161	0.26
162	0.22
163	0.21
164	0.19
165	0.18
166	0.16
167	0.18
168	0.2
169	0.22
170	0.28
171	0.37
172	0.37
173	0.37
174	0.38
175	0.34
176	0.34
177	0.31
178	0.26
179	0.2
180	0.2
181	0.2
182	0.17
183	0.14
184	0.1
185	0.09
186	0.09
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.05
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.14
212	0.16
213	0.19
214	0.24
215	0.29
216	0.3
217	0.33
218	0.42
219	0.38
220	0.42
221	0.42
222	0.42
223	0.39
224	0.4
225	0.43
226	0.36
227	0.36
228	0.31
229	0.28
230	0.25
231	0.24
232	0.2
233	0.14
234	0.12
235	0.11
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.07
240	0.11
241	0.13
242	0.14
243	0.14
244	0.15
245	0.16
246	0.17
247	0.18
248	0.15
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.15
258	0.15
259	0.17
260	0.17
261	0.17
262	0.15
263	0.17
264	0.17
265	0.18
266	0.18
267	0.16
268	0.19
269	0.2
270	0.22
271	0.22
272	0.25
273	0.24
274	0.29
275	0.31
276	0.31
277	0.32
278	0.31
279	0.28
280	0.27
281	0.24
282	0.23
283	0.21
284	0.16
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.1
290	0.06
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.11
295	0.13
296	0.15
297	0.18
298	0.2
299	0.2
300	0.2
301	0.2
302	0.27
303	0.31
304	0.31
305	0.32
306	0.32
307	0.31
308	0.33
309	0.31
310	0.23
311	0.17
312	0.15
313	0.11
314	0.09
315	0.11
316	0.13
317	0.15
318	0.19
319	0.2
320	0.21
321	0.21
322	0.21
323	0.23
324	0.2
325	0.19
326	0.21
327	0.2
328	0.19
329	0.19
330	0.18
331	0.14
332	0.15
333	0.14
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.14
348	0.12
349	0.12
350	0.14
351	0.17
352	0.18
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.17
357	0.16
358	0.14
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.07
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.07
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.12
391	0.13
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.15
396	0.15
397	0.17
398	0.14
399	0.16
400	0.18
401	0.18
402	0.17
403	0.2
404	0.25
405	0.24
406	0.24
407	0.22
408	0.21
409	0.21
410	0.24
411	0.2
412	0.15
413	0.2
414	0.2
415	0.25
416	0.23
417	0.24
418	0.21
419	0.23
420	0.23
421	0.16
422	0.15
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.07
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.05
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.06
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.1
478	0.12
479	0.15
480	0.2
481	0.22
482	0.26
483	0.26
484	0.27
485	0.24
486	0.23
487	0.21
488	0.19
489	0.18
490	0.14
491	0.15
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.14
496	0.12
497	0.11
498	0.11
499	0.1
500	0.11
501	0.11
502	0.12
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.1
507	0.14
508	0.17
509	0.21
510	0.23
511	0.3
512	0.35
513	0.43
514	0.48
515	0.47
516	0.49
517	0.52
518	0.52
519	0.53
520	0.48
521	0.43
522	0.4
523	0.36
524	0.31
525	0.25
526	0.21
527	0.13
528	0.13
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.13
535	0.14
536	0.15
537	0.16
538	0.14
539	0.14
540	0.13
541	0.12
542	0.1
543	0.1
544	0.08
545	0.07
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.04
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.09
582	0.11
583	0.11
584	0.13
585	0.13
586	0.12
587	0.13
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.14
592	0.14
593	0.14
594	0.15
595	0.13
596	0.15
597	0.14
598	0.18
599	0.2
600	0.26
601	0.27
602	0.28
603	0.28
604	0.27
605	0.28
606	0.25
607	0.25
608	0.17
609	0.18
610	0.24
611	0.26
612	0.26
613	0.25
614	0.24
615	0.21
616	0.23
617	0.23
618	0.22
619	0.21
620	0.22
621	0.22
622	0.22
623	0.24
624	0.25
625	0.3
626	0.35
627	0.46
628	0.5
629	0.52
630	0.52
631	0.5
632	0.51
633	0.51
634	0.49
635	0.42
636	0.39
637	0.42
638	0.44
639	0.43
640	0.4
641	0.31
642	0.25
643	0.24
644	0.23
645	0.19
646	0.18
647	0.18
648	0.2
649	0.2
650	0.18
651	0.15
652	0.13
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.08
657	0.08
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.09
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.11
669	0.13
670	0.13
671	0.13
672	0.13
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.12
677	0.1
678	0.13
679	0.14
680	0.14
681	0.13
682	0.14
683	0.12
684	0.13
685	0.13
686	0.11
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.07
691	0.09
692	0.08
693	0.07
694	0.13
695	0.13
696	0.13
697	0.14
698	0.14
699	0.13
700	0.14
701	0.14
702	0.12
703	0.15
704	0.16
705	0.15
706	0.15
707	0.15
708	0.15
709	0.15
710	0.11
711	0.12
712	0.14
713	0.2
714	0.22
715	0.27
716	0.27
717	0.27
718	0.28
719	0.25
720	0.3
721	0.33
722	0.35
723	0.35
724	0.38
725	0.38
726	0.38
727	0.38
728	0.32
729	0.32
730	0.28
731	0.3
732	0.34
733	0.34
734	0.32
735	0.36
736	0.37
737	0.31
738	0.33
739	0.33
740	0.31
741	0.3
742	0.29
743	0.26
744	0.23
745	0.19
746	0.19
747	0.11
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.09
753	0.11
754	0.12
755	0.13
756	0.12
757	0.12
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.13
762	0.11
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.09
773	0.1
774	0.11
775	0.11
776	0.12
777	0.15
778	0.15
779	0.14
780	0.18
781	0.19
782	0.22
783	0.3
784	0.34
785	0.34
786	0.38
787	0.4
788	0.36
789	0.4
790	0.36
791	0.28
792	0.22
793	0.2
794	0.15
795	0.13
796	0.13
797	0.08
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.09
806	0.09
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.11
812	0.11
813	0.11
814	0.12
815	0.13
816	0.13
817	0.14
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.11
822	0.1
823	0.09
824	0.08
825	0.07
826	0.07
827	0.06
828	0.06
829	0.07
830	0.07
831	0.09
832	0.13
833	0.14
834	0.14
835	0.21
836	0.28
837	0.3
838	0.34
839	0.35
840	0.34
841	0.41
842	0.42
843	0.38
844	0.31
845	0.28
846	0.25
847	0.28
848	0.27
849	0.2
850	0.19
851	0.21
852	0.26
853	0.3
854	0.33
855	0.38
856	0.44
857	0.51
858	0.61
859	0.62
860	0.59
861	0.57
862	0.54
863	0.51
864	0.48
865	0.4
866	0.3
867	0.24
868	0.23
869	0.19
870	0.17
871	0.1
872	0.08
873	0.08
874	0.1
875	0.11
876	0.12
877	0.17
878	0.23
879	0.3
880	0.34
881	0.34
882	0.33
883	0.35
884	0.36
885	0.32
886	0.26
887	0.2
888	0.17
889	0.16
890	0.14
891	0.09
892	0.08
893	0.07
894	0.07
895	0.1
896	0.1
897	0.14
898	0.16
899	0.15
900	0.18
901	0.22
902	0.22
903	0.21
904	0.22
905	0.19
906	0.2
907	0.22
908	0.22
909	0.19
910	0.19
911	0.16
912	0.18
913	0.17
914	0.17
915	0.17
916	0.13
917	0.13
918	0.13
919	0.11
920	0.09
921	0.1
922	0.08
923	0.08
924	0.09
925	0.11
926	0.12
927	0.12
928	0.14
929	0.14
930	0.18
931	0.21
932	0.22
933	0.23
934	0.24
935	0.24
936	0.22
937	0.25
938	0.25
939	0.31
940	0.32
941	0.36
942	0.42
943	0.46
944	0.53
945	0.56
946	0.56
947	0.54
948	0.56
949	0.52
950	0.47
951	0.45
952	0.41
953	0.35
954	0.3
955	0.3
956	0.27
957	0.24
958	0.26
959	0.25
960	0.23
961	0.25
962	0.28
963	0.25
964	0.25
965	0.27
966	0.26
967	0.29
968	0.29
969	0.27
970	0.23
971	0.19
972	0.21
973	0.2
974	0.22
975	0.24
976	0.3
977	0.39
978	0.45
979	0.48
980	0.49
981	0.57
982	0.59
983	0.61
984	0.62
985	0.62
986	0.63
987	0.64
988	0.59
989	0.54
990	0.49
991	0.41
992	0.39
993	0.35
994	0.3
995	0.28
996	0.3
997	0.27
998	0.27
999	0.27
1000	0.22
1001	0.17
1002	0.16
1003	0.17
1004	0.19
1005	0.18
1006	0.19
1007	0.19
1008	0.19
1009	0.23
1010	0.28
1011	0.26
1012	0.25
1013	0.26
1014	0.28
1015	0.29
1016	0.29
1017	0.25
1018	0.19
1019	0.18
1020	0.16
1021	0.17
1022	0.13
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.07
1033	0.11
1034	0.11
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.15
1038	0.14
1039	0.15
1040	0.21
1041	0.17
1042	0.17
1043	0.16
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.18
1047	0.19
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.14
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.12
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.15
1063	0.18
1064	0.23
1065	0.28
1066	0.27
1067	0.29
1068	0.31
1069	0.31
1070	0.3
1071	0.33
1072	0.31
1073	0.27
1074	0.28
1075	0.32
1076	0.33
1077	0.31
1078	0.3
1079	0.34
1080	0.38
1081	0.46
1082	0.51
1083	0.53
1084	0.55
1085	0.64
1086	0.66
1087	0.6
1088	0.58
1089	0.55
1090	0.58
1091	0.6
1092	0.6
1093	0.56
1094	0.57
1095	0.59
1096	0.58
1097	0.59
1098	0.55
1099	0.5
1100	0.51
1101	0.49
1102	0.45
1103	0.4
1104	0.42
1105	0.38
1106	0.38
1107	0.32
1108	0.28
1109	0.3
1110	0.28
1111	0.3
1112	0.36
1113	0.42
1114	0.43
1115	0.53
1116	0.53
1117	0.51
1118	0.52

A0A1A0HJL3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer